审计署是国务院组成部门之一、规格级别是正部级，根据工作需要，中央审计委员会办公室目前就设在审计署。审计署的核心职责是贯彻落实党中央关于审计工作的方针政策和决策部署，在履行职责过程中坚持和加强党对审计工作的集中统一领导，负责主管全国审计工作（其中包括依法领导和监督地方审计机关的业务），切实发挥审计监督作用，维护国家和人民的利益。

和其他单位部门不同的是，审计署的主要负责人称作“审计长”，同时还设有若干名副审计长协助其开展工作，此外中央经济责任审计工作部际联席会议办公室主任也是审计署领导班子成员、入选审计署党组成员。中央纪委国家监委向审计署派驻有纪检监察组，驻审计署纪检监察组组长同样是审计署党组成员。值得一提的是，由于审计工作和纪检工作也是密切相关的，所以现任审计署审计长同时兼任中央纪委常委一职。

而为了加强依法检查审计决定执行情况、督促整改审计查出的问题，依法领导和监督地方审计机关的业务，组织地方审计机关实施特定项目的专项审计或审计调查，纠正或责成纠正地方审计机关违反国家规定作出的审计决定，审计署面向全国共设置了18个驻地方特派员办事处（级别均为正厅级，特派办数量在各部委/总局中也最多），具体分别是：

审计署京津冀特派员办事处、审计署驻太原特派员办事处、审计署驻沈阳特派员办事处、审计署驻哈尔滨特派员办事处、审计署驻上海特派员办事处、审计署驻南京特派员办事处、审计署驻武汉特派员办事处、审计署驻广州特派员办事处、审计署驻郑州特派员办事处、审计署驻济南特派员办事处、审计署驻西安特派员办事处、审计署驻兰州特派员办事处、审计署驻昆明特派员办事处、审计署驻成都特派员办事处、审计署驻长沙特派员办事处、审计署驻深圳特派员办事处、审计署驻长春特派员办事处和审计署驻重庆特派员办事处。

当然了，不同特派办有不同的管辖区域，例如审计署驻沈阳特派员办事处的审计范围是辽宁和大连（大连是计划单列市、所以单独列出），审计署驻南京特派员办事处的审计范围是江苏和安徽，审计署驻昆明特派员办事处的审计范围则是云南、贵州两省。

在内设机构设置方面，各审计署特派办均设有相应的办公室、法规审理处、财政审计处、税收征管审计处、行政事业审计处、农业审计处、资源环保审计处、固定资产投资审计处、金融审计处、企业审计处、社会保障审计处、计算机审计处、人事教育处和机关党委。

在工作任务方面，审计署各特派办主要根据审计署的授权，依据法律法规和审计署的规定履行以下职责，比如审计省级人民政府的预算执行情况、决算和其他财政收支，中央财政转移支付资金；审计海关总署、国家税务总局等中央单位驻地方分支机构或派出机构的预算执行情况和其他财政收支情况；审计中国人民银行、国家外汇管理局驻地方分支机构的财务收支；审计中央投资和以中央投资为主的建设项目的预算执行情况和决算；审计中央国有企业、中央国有资本占控股地位或主导地位的企业的资产、负债和损益；审计中央金融机构、中央国有资本占控股地位或主导地位的金融机构驻地方分支机构的资产、负债和损益；以及其他相关审计工作。