故事的开端，充满了戏剧性的反差。黄子淇，现代一名顶尖特工，代号“夜枭”，擅长伪装、格斗、爆破，更精通多国语言和各种高科技手段。在一次执行跨国任务时，她遭遇了前所未有的危机，为了保护同伴，她毅然引爆炸弹，与敌人同归于尽。然而，当她再次睁开眼睛时，却发现自己身处一个完全陌生的环境——古色古香的房间，破旧的衣衫，以及一个瘦弱不堪、奄奄一息的身体。原来，她穿越了，成了尚书府一个备受冷落、甚至被嫡母和嫡姐视为眼中钉的庶女，同样也叫黄子淇。

初来乍到，黄子淇面临着前所未有的困境。嫡母的刻薄，嫡姐的刁难，父亲的不闻不问，下人的欺软怕硬，让她这个来自现代的特工感到无比的憋屈和愤怒。但黄子淇岂是那种任人宰割的弱女子？她迅速调整心态，运用自己丰富的特工经验和敏锐的观察力，开始反击。她先是巧妙地化解了嫡母和嫡姐的一次次刁难，用现代的心理学知识和伪装技巧，让对方自食其果。接着，她利用自己对古代历史的了解，以及对各种草药和化学知识的掌握，开始改善自己的身体状况，并暗中培养自己的势力。