日照海事局的前身是中华人民共和国石臼港务监督，1988年1月1日，在此基础上组建交通部日照海上安全监督局，为正处级单位。

交通部日照海上安全监督局是对海上辖区和港口水域内的交通安全及防止船舶污染海域实行统一监督管理的主管机关。

为适应涉外工作的需要，仍保留中华人民共和国石臼港务监督名称。

1992年6月1日，经交通部批准，更名为交通部日照海上安全监督局（中华人民共和国日照港务监督）。

作为交通部直属一级行政单位。当时有120人，下设局办公室（审计科）、通航监督科、船舶监督科、船员证件管理科、计划财务科、组织宣传科、人事教育科、纪检、监督科、前沿监督站、中港监督站、航标站和工会、共青团组织。

海监局自1988年1月1日组建以来，领导班子有几次大的调整。第一届领导班子由3人组成，张寿增任副局长兼副监督长主持行政工作，范玉祥任副局长，王家生任副监督长。

1992年9月24日，经调整任免，邱云龙任副局长兼副监督长主持行政工作，王玉成任副监督长。

1994年12月26日，调整为邱云龙任局长兼监督长，孙树年任副局长，徐增福任副监督长。1996年4月12日，王玉成任日照海上安全监督局局长兼监督长。

2000年9月13日，按照国务院水监体制改革方案，原交通部日照海上安全监督局和山东省岚山海上安全监督局合并，成立了中华人民共和国日照海事局，实行"一水一监、一港一监"，建立起了统一政令、统一布局、统一监督管理的水上安全监督管理新机制。

在日照沿海海域和辖区港口水域行使《中华人民共和国海上交通安全法》、《中华人民共和国海洋环境保护法》等法律法规赋予的水上安全和船舶污染的执法权，统一管理日照沿海、所辖港口水域内水上安全、防止船舶污染等工作。下设通航管理处、船舶监督处、船员管理处、危害防污处、岚山海事处、东港海事处、奎山海事处等监督业务部门。