从以伊战争停火到现在，以色列的实际战争损失一直是个谜团。以色列13频道透露: 伊朗对以色列境内军事设施和基地的导弹打击造成的大部分伤亡数字和损失，至今仍然被政府要求“禁止任何报道”。以色列国防军内部人士透露，以色列严重低估了伊朗的导弹威力，以至于遭受的战争损失超出了预期承受限度。英国媒体的报道也暗指，以色列军方从头至尾都在故意隐瞒战争损失情况。

据英国《每日电讯报》援引俄勒冈州立大学进行的卫星图分析报道称，在与伊朗的12天冲突中，以色列隐瞒了其五个军事设施（包括一个主要空军基地）被伊朗袭击的事实。这些卫星图片显示，六枚伊朗导弹击中了以色列北部、南部和中部的目标。其中包括一个以色列军事情报中心和一个后勤基地。在短暂的冲突中，伊朗导弹袭击了40多个以色列基础设施。

被黑客破解的以色列“HES”网站上发现的上千名死亡人员分类列表中，包括6名以色列军方高级将领和11名科学家。其中11名科学家被认为是以色列核研究中心（魏茨曼科学研究所）。但是外界很难想象，以色列军方如何损失了6名高级将领。虽然有多座以色列军事基地遭伊朗导弹袭击，但以色列军方坚称他们拦截了大多数的伊朗导弹，只有28枚伊朗导弹突防成功后击中目标。

根据以媒和遭打击目标当地人提供的信息，以色列内瓦蒂姆空军基地被伊朗导弹炸了，地面损失严重。但即便损失严重，也不可能一下子被炸死6名高级将领。7月7日破案了！以色列媒体当天关于以军“影子总参谋部”的报道，打破了所有疑问。以色列《新消息报》报道称，以色列军方为了应对伊以冲突而组建了“影子总参谋部”，将一套平行军事指挥班底藏在另一处地点，以确保在原有总参谋部人员遭到袭击的情况下继续维持指挥体系。

也就是说，以色列军方秘密组建了一个参谋班子，并将其安置在特拉维夫市区某处地下坚固设施内。伊朗媒体此前也揭露称，以色列通常把军事指挥所建在公共建筑（医院、学校等民用建筑）的地下室。以伊战争最后一天，伊朗弹道导弹轰炸了特拉维夫一座证券大楼，导弹贯穿证券大楼后摧毁了下面的地下室。伊朗方面事后称摧毁以色列军方指挥所。现在看来，特拉维夫证券大楼地下室应该就是以军的“影子总参谋部”。