1993年，台湾投资人杨登魁指定李连杰主演《新少林五祖》，并且要求保留“少林五祖”的设定，但是当时香港影坛难以找到四位和李连杰咖位匹配的动作演员，而且预算压力大，这就让身为导演的王晶有点烦恼。

王晶之后将“少林五祖”改为5个孩子，作为藏宝图的携带者，李连杰则饰演保护他们的洪熙官，并且加入虚构儿子洪文定，由谢苗饰演，这个调整既满足投资方的需求，又规避了演员的成本问题。

1993年初，《新少林五祖》和《倚天屠龙记之魔教教主》同步拍摄，导演王晶白天拍摄《倚天屠龙记之魔教教主》，晚上则赶场《新少林五祖》，仅用了18天就完成了主体拍摄，创造了港片效率纪录。

由于动作指导元奎设计的“洪熙官父子双枪斗马宁儿”的戏份中，李连杰坚持用实心的木棍和饰演马宁儿的动作演员计春华对打，计春华饰演“刀枪不入”的反派马宁儿，每天拍摄的时候，需要全身涂满乳胶和油漆，每次都要耗时2小时化妆。

当时7岁的谢苗在北京少年宫因一套长拳被导演王晶选中，其冷静的气质和李连杰的洪熙官的刚猛形成反差，成为“银幕父子”经典组合。

当时刘松仁原定天地会总舵主陈近南，原来要拍摄2天，后来因为档期原因，王晶就把刘松仁的戏份改成了“出场即牺牲”，不过，刘松仁总舵主的白衣飘逸镜头成为影史经典。

王晶拍摄这部戏的时候，弱化了历史厚重感，加入了父子互动幽默，虽然被批娱乐化，但是影片票房位列年度第二。

王晶在一次节目中谈到李连杰的时候说：“李连杰是整个电影界使用武器最好的一个，不管是什么，即使是只有一块木头，在李连杰手上，也能像魔术一样玩耍，成龙很擅长身体的移动，但用到武器时，李连杰是最好的，即使是成龙，也无法像李连杰打得那么好。”