近期,贵州省果树科学研究所猕猴桃科研创新团队在国际期刊Scientific Data上发表了抗溃疡病猕猴桃品种‘贵猕2号’ (Actinidia chinensis, 2n=58) 染色体级基因组,为猕猴桃抗病分子育种及比较基因组学研究提供了核心基因组资源。

研究团队整合MGI短读长、PacBio HiFi长读长及Hi-C测序技术,成功组装了608.43 Mb基因组,并将99.7%序列锚定至29条染色体,基因组contig N50为20.7 Mb,BUSCO完整性98.4%。共注释251.15 Mb(41%)的重复序列及45,986个蛋白编码基因。与溃疡病感病品种‘红阳’相比,‘贵猕2号’含282个NLR抗病基因,比‘红阳’多30个;进一步分析筛选了205个位于NLR及其2 kb侧翼区的结构变异位点(SV),可能与抗性关联。

贵州省果树科学研究所猕猴桃科研创新团队唐冬梅研究员为论文通讯作者,周嘉助理研究员为第一作者,团队成员参与了研究工作。

论文链接:

https://doi.org/10.1038/s41597-025-05593-6