太祖晚年疑心病很重，他看着大权在握的李淑妃，突然感到不安起来。担心自己的身体，可能撑不了几年了，而太子朱标还没有成长起来，还不具备统治大明朝的能力。他害怕自己死后，李淑妃会成为吕雉和武则天。一天，朱元璋把李贤妃的两个哥哥叫到偏殿，让她去看望自己的哥哥。李贤妃很聪明，她知道太祖的举动如此反常，是要赐死自己。

李贤妃和两位哥哥道别后，哭着回到了后宫自杀身亡。朱元璋得知李贤妃之死，痛哭流涕。召见了李贤妃的两位哥哥说：“以贤妃之才，让朕不得不顾忌可能发生的武氏之祸，也是不得已而为之。”两位哥哥泪流满面，谢恩而退。洪武三十一年（1398年）五月，太祖病逝，李淑妃陪葬孝陵。后来，有人在故宫的角落里，发现了李淑妃的日记，里面写着：“帝王家的恩宠，从来都是穿肠的毒药。”纸页已经泛黄，墨迹却还清晰。

3.宁妃郭宁莲（？-1398年）：濠州（今安徽凤阳）人，郭山甫之女。生得国色天香，秀丽迷人，气质出众。至正十一年（1351年），各地爆发了反元起义，朱元璋投入了郭子兴领导的起义军。一次，朱元璋路过同乡人郭山甫家。郭山甫在十里八乡以擅长相面著称，而且大多灵验，当地人对他极为尊重。当他看到朱元璋时，惊讶地说：“公相贵不可言。”对儿子郭兴和郭英说：“吾相汝曹皆可封侯者以此。”从此，郭山甫一家跟随朱元璋，并把爱女郭宁莲嫁给了朱元璋为妾室。宁氏生有鲁王朱檀、崇宁公主与汝宁公主。

郭氏一直侍奉在太祖身边，平易近人，知书达理，以马皇后为楷模，全力佐助太祖。对太祖关心体贴无微不至，这使太祖十分感动，封其为宁妃。她的两个哥哥郭兴和郭英均成为明朝开国名将、淮西二十四将之一，立下了赫赫战功，分别封为巩昌侯（死后获赠陕国公）、武定侯（死后获赠营国公）。而已去世的郭山甫，也被追封为营国公。

洪武十七年（1384年）李淑妃去世，郭宁妃成为后宫的第三任掌权者。位比皇后，统管六宫。郭宁妃没有骄傲，而是严以律己，勤于内治。郭宁妃卒年不详，一些史料认为最终的结局极有可能是殉葬了。也有人认为，可能被太祖赐死。

4.昭敬充妃胡氏（生卒年不详）：濠州（今安徽凤阳）人，都指挥同知胡显之千金。天生丽质，貌美如花，妖冶迷人。胡氏曾嫁人，男方青年去世，一直寡居在娘家。少年朱元璋见之，神魂颠倒，央求家人给他提亲，遭到了胡母的无情拒绝。主要原因有两方面：一是朱家太穷，上无片瓦，下无插锥之地。二是朱元璋长相丑陋，是丑男中的丑男。

后来，朱元璋参加红巾军，并成就了建国壮举。至正十六年（1356年）三月，占领应天（今南京）后，派人打听令他念念不忘的胡氏下落。得知此女随军驻扎淮安，依旧待字闺中。当即派使携书函给镇守的平章赵君用处，恳请其成人之美。赵君用欣然应允，亲送胡氏与其母到太祖处。太祖大喜，纳胡女为妃。至正二十四年（1364年）三月，生皇第六子朱桢。此时，平定武昌的捷报传来，朱元璋高兴地说:“子长，以楚封之。”洪武三年（1370年）四月，朱桢被封为楚王（封地武昌），同年五月，胡氏被封为充妃。

她懂得用自己美貌的优势去获得朱元璋的青睐。一时间，胡氏出尽了风头，成为了六宫中最得圣意的妃子。洪武二十二年（1389年），官居都督佥事的胡显被加封为梁国公。朱元璋开了外戚不凭军功封公的先河，胡显也被称为明朝第一个也是唯一超封的公爵。

某天，负责清理环境卫生的太监在捞取御河中的枯枝败叶时，捞到了一个不足月的死婴。怀疑宫中有人堕胎，为消除罪证偷偷而将其扔进了河里。太祖得知，爆跳如雷，下令彻查。不久，一条线索反馈到了太祖处，说此事是一位姓胡的妃子所为。太祖璋大为震怒，怀疑胡充氏与人偷情，生下了死胎。下令把这个曾经十分中意的妃子处死，将她的尸体丢到了城外荒无人烟的乱坟岗。冷静过后，太祖意识杀错人了。胡充妃自从进宫后，一向中规中矩，从无半点轻佻之色。况且，她已是五十岁的老女人了，怎么会做这种龌龊之事呢？

洪武三十一年（1398年），太祖病逝，皇太孙朱允炆继位，为建文帝。建文帝与亲信大臣齐泰、黄子澄等采取一系列削藩措施。建文元年（1399年）七月，太祖第四子燕王朱棣与太祖第十七子宁王朱权为首的藩王共同反叛侄儿建文帝，发动靖难这役。