一、从有效养分种类及组成上区别
从化肥有效养分的元素种类和组成结构来看，掺混肥、复混肥和复合肥均为含有多种元素的肥料。合格的这三类肥料，都需明确标明氮、磷、钾三大营养元素中两种及以上养分的含量。若未按此标准标明，这类产品便属于不合格范畴，甚至可能是假冒伪劣的化肥，无法保障其质量与肥效。
二、从生产工艺技术水平上区别
从生产工艺来看，化肥可分为掺混肥、复混肥和复合肥。掺混肥的制作相对简单，是将氮、磷、钾中两种或以上的肥料颗粒直接进行混合，只需简单搅拌即可。复混肥则是先把氮、磷、钾两种或以上的肥料颗粒粉碎，再通过物理方式混合后造粒。而复合肥更为复杂，同样先把相关肥料颗粒粉碎，但之后是经过化学反应再进行造粒。
1.掺混肥，掺混肥是以含有氮素、磷素、钾素的单质肥料或复合肥料为原料。这些复合肥料需至少含氮磷钾中的两种养分。它是按一定的氮、磷、钾配比，通过机器进行简单物理混合而成的化肥，也至少含氮磷钾中的两种养分。简单来说，就是把氮磷钾原料单纯混合。因此，掺混肥也被叫作“散装掺混肥料”“干混肥料”“BB肥”。
2.复合肥，复合肥以含氮、磷、钾的单质或复合肥料为原料，生产时按一定氮、磷、钾配比，通过特定化学工艺使原料发生化学反应。这类化肥至少含氮、磷、钾中的两种养分，需先进设备，经复杂工艺和化学反应后重新造粒而成。具体设备、技术和工艺不展开讨论。
3.复混肥料，严格来说，复混肥料是广义称呼，包含复合肥（广义上属复混肥分类）和复混肥。它以含氮、磷、钾的单质或复合肥料为原料，这些原料至少含氮、磷、钾中的两种养分。按一定配比，通过化学或掺混方法生产出至少含氮、磷、钾中两种养分的肥料，化学方法生产的是常用复合肥，掺混方法生产的是狭义复混肥。
三、从肥料的使用效果上区别
1.从肥料颗粒外观均匀度看，复合肥最好，复混肥居中，掺混肥最差、大小不一。简单撒施、沟施、穴施时，三者施肥方式差异不明显；用农耕机械施肥，复合肥能保证均匀，掺混肥易下粒不均，严重时无法机器施肥。养分释放方面，复合肥均匀稳定，复混肥欠佳，掺混肥最不稳定均衡。
2.从肥料颗粒养分均匀度看，掺混肥较差，它是不同肥料颗粒简单物理混合，氮肥、钾肥、磷肥颗粒相互独立。复合肥和复混肥则是把不同肥料颗粒破碎后，让氮磷钾重新混合造粒，每颗肥料中氮磷钾分布更均匀。在养分分布均匀度上，化学混合生产的复合肥比物理掺混生产的复混肥表现更好。
3.从肥料综合使用效果看，同等氮磷钾含量配比、相同条件和用肥量时，作物对肥料有效吸收利用率通常为复合肥＞复混肥＞掺混肥。从肥料颗粒品质稳定性、物理性状等方面看，三者性能依次递减，因复合肥和复混肥造粒添加辅助物质，所以在这些方面优于掺混肥。一般复合肥有效成分含量高于复混肥，高浓度复合肥常见，大部分复混肥有效成分含量在30％以下，掺混肥不参与有效成分含量比较。
四、从肥料的生产标准区别
掺混肥、复混肥和复合肥生产执行标准不同，国家要求肥料外包装必须标明产品执行标准，购买时要仔细查看，以防权益受损。以下是这三种肥料的最低国家标准，合格产品参数应高于而非低于此标准，否则不合格。掺混肥执行GB/T 21633 - 2020《掺混肥料（BB肥）》，复合肥和复混肥执行GB15063—2001《复混肥料（复合肥料）》，不符合或无上述标准的肥料可认定为假化肥。
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