我们常说,肠道是人体的“第二大脑”,是免疫的“中枢基地”,是健康的“气象站”。但一个关键问题至今困扰医学界:如何科学、快速、精准地评估一个人肠道菌群的稳态水平?

过去,人们大多依赖高通量测序(如16S rRNA、宏基因组)进行大规模分析,但这种方式成本高、操作复杂、周期长,难以真正落地临床检测与个体化评估

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2023年,《Engineering》期刊刊发了一项来自李兰娟院士团队的重磅研究,首次提出并验证了一种基于qPCR快速检测10种核心菌群,即可准确评估肠道微生态平衡状态的方法。通过这套模型,医生能判断一个人是否菌群“失衡”,还能辅助筛查肝硬化等相关疾病。

一句话总结:肠道健康不再需要“测全景”,只需精准盯住“十个关键角色”

0110种菌群组成“健康晴雨表”,评估肠道稳态有据可依

本研究核心在于构建了基于10种粪便细菌肠道菌群稳态评估系统,该组合包括:

  • 益生菌群:乳酸杆菌(Lactobacillus)、双歧杆菌(Bifidobacterium)、F. prausnitzii、C. leptum
  • 功能菌群:Bacteroides、Atopobium、E. rectale
  • 条件致病菌群:肠杆菌科(Enterobacteriaceae)、肠球菌(Enterococcus)、大肠杆菌(E. coli)

研究团队共纳入744人样本,其中包括500名健康人、244名肝硬化患者。他们利用qPCR方法对10种菌进行定量检测,并建立了健康组各菌群的参考值范围。

▲健康人群肠道菌群。(a) 十种细菌在不同年龄段的差异。
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▲健康人群肠道菌群。(a) 十种细菌在不同年龄段的差异。

结果发现,健康人肠道中益生菌占主导比例,条件致病菌受抑制,而一旦菌群比例严重偏离这一平衡结构,极可能提示微生态失衡,甚至是疾病风险。

这意味着,这10种菌群就是“肠道状态的代谢仪表盘”,对失衡与健康之间的差异,具有高度敏感性和识别力。

02菌群随年龄变化而动,Atopobium是“老化敏感菌”?

有趣的是,这套评估模型还揭示出一个重要现象:不同年龄段的人,肠道菌群构成存在显著差异

研究表明,健康人群中:

  • Atopobium随着年龄增加显著下降,提示其可能与“年轻态肠道环境”高度相关;
  • 肠球菌(Enterococcus)在老年组中升高,可能与免疫下降和菌群易位有关;
  • 双歧杆菌与乳酸杆菌在中年群体中最为活跃,但在高龄组出现轻微下降趋势。

这些发现提示我们,肠道菌群变化或可作为“生理年龄”的微生态指标,未来有望为衰老评估、慢病风险预测提供辅助路径。

在临床上,医生可据此构建“年龄—菌群—疾病”三维模型,为早期干预与营养指导提供决策支持。

03肝硬化患者菌群严重紊乱,这套模型可辅助临床识别

研究进一步在244例肝硬化(LC)患者样本中验证了这套10菌模型的鉴别能力。

结果发现,与健康人相比,肝硬化患者的肠道菌群出现系统性紊乱:

  • 有益菌如F. prausnitzii、C. leptum显著下降;
  • 条件致病菌如Enterococcus、Enterobacteriaceae比例上升;
  • 多种菌群之间的比例关系被打破,微生态屏障功能丧失。

▲LC患者和 HC 受试者的肠道菌群。
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▲LC患者和 HC 受试者的肠道菌群。

其中,研究团队提出了3个具有临床筛查潜力的关键菌群比值

1、C. leptum/Bacteroides:衡量厌氧代谢稳定性

2、E. coli/Bifidobacterium:反映益生菌-致病菌对抗状态

3、Enterococcus/Enterobacteriaceae(Ec/E):高度相关于肝硬化分级及并发症风险

这些比值为临床医生提供了一个全新的、非侵入性、高效识别“菌群失衡状态”的工具,尤其适用于肝病、肠肝轴疾病、代谢综合征等高风险人群的预警筛查。

04人工智能登场!机器学习助力构建肠道“诊断算法”

为了进一步提升模型识别力,李兰娟院士团队还引入了机器学习算法,构建了基于10菌数据的肝硬化预测系统。

共测试了6种算法模型,包括:

  • 逻辑回归(LR)
  • 支持向量机(SVM)
  • 随机森林(RF)
  • 极端梯度提升(XGBoost)
  • AdaBoost
  • K近邻(KNN)

结果显示:

  • XGBoost模型的准确率最高,AUC值达0.94,适合用于疾病排除与风险分层;
  • 随机森林模型表现最稳定,识别敏感性最强,适合用于临床早筛策略。

这也预示着,未来肠道菌群检测将不仅仅依赖单一菌种分析,而是通过“菌群+算法+临床信息”三位一体的智能判断系统,实现更高效的健康评估与慢病预测。

▲多种机器学习模型。
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▲多种机器学习模型。

05肠道健康量化时代来了,“十菌模型”有望写入临床指南

这项研究的最大意义,不只是验证了一种新的检测技术,更是为“肠道微生态稳态”这一抽象概念,提供了可复制、可量化、可推广的标准化评估模型

它的优势体现在三个层面:

1、成本可控,适用于临床落地:qPCR平台普遍具备,不依赖复杂测序;

2、评估明确,指标直观:菌群含量+比值组合,形成清晰判断框架;

3、模型可扩展,具备AI融合能力:适配多病种筛查及未来个体化营养/治疗指导。

正如论文结语所说:“我们期待这一微生态检测模型,成为未来肠道健康评估、疾病辅助诊断、精准营养干预的基础构件之一。”

在全民健康管理走向精准化的今天,我们更需要这样的科研成果,走下实验室,走入每一个人的生活中。

注明参考文献

  • Zhongwen Wu, Xiaxia Pan, Yin Yuan, Pengcheng Lou, Lorina Gordejeva, Shuo Ni, Xiaofei Zhu, Bowen Liu, Lingyun Wu, Lanjuan Li, Bo Li,
  • An Evaluation Method of Human Gut Microbial Homeostasis by Testing Specific Fecal Microbiota,
  • Engineering,
  • Volume 29,
  • 2023,
  • Pages 110-119,
  • ISSN 2095-8099,
  • https://doi.org/10.1016/j.eng.2023.03.007.