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近日，中国水产科学研究院珠江水产研究所渔业资源调查与评估创新团队在国家二级保护野生动物红魾（Bagarius rutilus）全基因组研究领域取得重要进展。该研究采用PacBio HiFi、Oxford Nanopore超长读长与Hi-C技术相结合的混合测序策略，成功构建红魾首个高质量染色体级别基因组图谱。该基因组大小为618.3 Mb，Contig N50达21.06 Mb，Scaffold N50为25.46 Mb，基因组覆盖度98.17%，经BUSCO评估完整性达97.5%，共注释出29,106个蛋白质编码基因，是目前鲇形目鱼类中最完整、连续性最高的接近端粒到端粒（T2T）基因组，为后续相关研究奠定了坚实基础。
红魾是我国云南元江—红河流域特有的大型底栖肉食性鱼类，具有重要的生态与科研价值。然而，受过度捕捞、水电开发、水质污染及外来物种入侵等多重因素影响，其种群数量急剧衰退，保护形势严峻。在物种保护层面，此次基因组组装为红魾的精准鉴定、种群监测及遗传管理提供了关键工具，未来可通过环境DNA技术追踪其分布与数量变化。同时为评估种群遗传健康状况、制定科学的人工增殖放流策略（如规避近亲繁殖风险）提供了核心科学依据。在生态适应机制研究层面，基因组信息揭示了红魾适应急流、低氧等特殊生存环境的潜在遗传机制，有助于深入解析其对繁殖水温、流量脉冲等特定水文条件的依赖特性。这一成果为河流水电站生态调度优化、河岸生态系统修复提供了重要理论支撑，对推动红魾种群恢复与栖息地保护具有关键指导意义。
相关研究结果以“Near complete T2T genome assembly of the banded goonch （Bagarius rutilus）”为题，发表于国际知名学术期刊《Scientific Data》（JCR 1区，IF=6.9）。该研究得到了农业农村部财政专项（西南重要水域渔业资源与环境调查）、国家自然科学基金青年基金项目（32503195）和珠江渔业资源调查与评估创新团队项目（2023TD10）等项目联合资助。珠江水产研究所为该论文第一完成单位，刘亚秋博士为论文第一作者，李捷研究员、陈蔚涛副研究员及长江水产研究所刘明典研究员为该论文的共同通讯作者。
该研究成果也得到了新华社、人民网、中国日报等多家新闻媒体关注报道。
日期：2026-02-22
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