2021年，东京大学和国立遗传学研究所一起完成了古代日本人遗骸的全基因组测序，对象是12具遗骨，结果发现现代日本人的基因里，绳文人占13%，弥生人占16%，剩下71%来自古坟人，这些古坟人在公元3到6世纪大量迁入日本，他们的基因与中国华北、东北的古代人群非常接近。
这组数据一出来，就把徐福东渡的老故事给戳破了，根据《史记》记载，秦始皇派方士徐福带上三千童男童女、工匠和各种五谷种子出海寻找仙药，后来据说他们到达了日本九州，现在日本不少地方还有徐福祠，每年举行祭典，许多当地人相信他就是神武天皇的原型，是把大陆文明带到日本的那个人，然而基因检测发现，徐福带去的三千人没有在后代中留下可识别的遗传痕迹，就像往大海里倒了一杯水，连一点涟漪都没有泛起。
一个没有留下后代的人，被日本人供奉了几千年，这不是因为大家愚昧，而是日本贵族当时需要一个体面的出身故事，早期日本社会结构松散，缺乏完整的统治叙事，突然出现一位来自强大秦朝的使者，他会建造船只，懂得医术，带来技术，还带着童男童女，这种设定很适合充当文明引路人，比承认祖先是以打猎采集为生的绳文人听起来更高级，徐福就这样被包装成文化英雄，不是因为他真的做了多少大事，而是他刚好填补了心理上的空缺。
真正改变日本的是古坟时代的大规模移民潮，2023年理化学研究所测试了3256个现代日本人的基因，结果更明确地显示日本人并非单一起源，而是由多批人群混合形成，古坟人到来后带来了铁器、马具和等级制度，并将稻作农业推广得更深入，他们与先前弥生人留下的基础相结合，国家的雏形才逐渐显现，徐福那次航行更像一次失败的探索，连长期据点都未能建立，谈不上有系统性影响。
NHK在2021年拍了一部纪录片，叫《日本人起源之谜：DNA调查》，这部片子第一次用大家都能听懂的方式告诉大家，日本人的单一祖先说法根本站不住脚，现在学术界基本都接受绳文时期打基础、弥生时代种地、古坟时代建国这个三阶段模型，民间虽然还在拜徐福，但越来越多的人知道那只是文化仪式，不是认祖归宗，我去过和歌山的徐福公园，当地人一边烧香一边聊旅游收入，没人真觉得自己的祖上是秦朝人。
说白了，人类记录历史有个习惯，总爱听有头有尾的故事，不喜欢那些复杂、缓慢又没主角的过程，像徐福那样有船队、有皇帝命令、还有神秘结局的传说，听起来就带劲，而真实的历史是几百万人慢慢迁徙、互相通婚、逐渐融合，既没有镜头也没有台词，基因不会骗人，但它讲的事情太平淡，所以大家宁愿相信徐福那套说法，我翻过几本地方志，发现连徐福具体在哪儿上岸的说法各地都不一样，这说明人们早就不在乎真假了，想要的不过是那种“我们曾被高等文明选中”的感觉。
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