3月16日，马英九基金会突然发布声明，宣布基金会前执行长萧旭岑和副执行长王光慈已经离职，并且特别强调这两人以后的言行“不代表基金会或马英九本人”。

面对指控，萧旭岑很快出来否认，强调自己在基金会期间的所有工作都是向马英九汇报并获得批准的，完全合法合规。

虽然没点名，但外界普遍认为她指的就是马英九的核心智囊金溥聪。

马英九这边反应也很快，当天下午基金会就发表声明，表示要将萧旭岑涉及“财政纪律”的问题移送司法机关调查。马英九本人后来也亲自受访，态度坚决地表示会“六亲不认”，证实了移送司法的决定。这样一来，马系和郑系的矛盾就从幕后搬到了台前，彻底公开化了。

而马英九阵营，特别是金溥聪代表的势力，在两岸路线上相对谨慎，更注重与美国的关系。萧旭岑作为积极推动两岸交流的关键人物，成了这次路线斗争的焦点。

民进党抓住机会大肆炒作，抹黑国民党的形象，并进一步鼓吹其“抗中保台”路线，这压缩了两岸和平交流的政治空间。

大陆方面注意到了此事。国台办发言人此前在回应时，肯定了马英九基金会过去在推动两岸青年交流方面的作用，并表示愿意在坚持“九二共识”的基础上继续与台湾各界加强交流合作。

但国民党内部如此激烈的斗争，难免会影响大陆方面对其执行力和团结度的判断。

这场风波表面是人事财务问题，实则是国民党内部围绕两岸路线主导权和党内权力的深刻斗争。

它的爆发不仅暴露了国民党的内部分裂，也给本就复杂的两岸关系增添了新的变数。对于期待两岸和平交流的民众来说，这无疑是一个令人担忧的发展。