如今,质谱早就成了科研里的常用工具,但在实际课题中还是经常会遇到问题:复杂样本不好处理、低含量物质测不准、结果没法重复……想做出高分研究并不容易。为了帮大家用好质谱,我们拆解了多组学、复杂样本分析等多种应用场景案例:
案例一:单细胞代谢组学、癌症精准分型
应用难点:针对单细胞体积极小、代谢物含量极微、前处理流程复杂且易引入误差,以及细胞异质性导致分型困难的问题,通过全自动单细胞前处理技术与高分辨质谱联用,实现单细胞代谢物的高灵敏、无偏差检测与精准分型。
采用了 SinCell-100 全自动单细胞分析系统与 Orbitrap Exploris 240 质谱联用平台。自动化完成单细胞定位、皮升液滴萃取与电喷雾离子化,最大程度减少人为误差;质谱系统以 240,000 FWHM 高分辨率、DIA 非靶向采集模式及正/负离子切换功能,实现低丰度代谢物的高效捕获。成功检测出 295 种内源性代谢物,实现癌细胞与正常细胞的精准区分,筛选出 94(AGS vs GSE)和 85(HGC vs GSE)种差异代谢物,精氨酸、赖氨酸等成为潜在胃癌标志物。
案例二:代谢组学标准化、靶向定量检测
应用难点:针对临床代谢组学研究中实验流程不统一、基质效应干扰定量准确性、大样本批次间稳定性问题,通过构建稳定同位素标记内标体系、优化色谱-质谱参数、建立多维度质控流程,实现目标代谢物的标准化精准定量。
以三重四极杆(QqQ)质谱为核心平台,采用信息驱动或全面谱图分析两种策略构建靶向代谢物面板。优先选用 13C/15N 标记内标,早期加入样本以校正提取效率和基质效应;通过色谱分离适配不同极性代谢物,结合驻留时间优先级(DTP)优化,保障低丰度代谢物的检测灵敏度。同时设置系统适用性样本、混合 QC 样本和参考样本全程监控数据质量,有效降低样本间变异,成功实现大规模临床样本的标准化定量。
案例三:肥胖模型脂质组学、复杂生物样本高重复检测
应用难点:针对血浆等复杂生物样本基质干扰强、脂质种类多且易受基质抑制,以及实验结果重复性难保障的问题,通过优化前处理流程、质谱采集模式和数据处理方法,实现脂质的高灵敏、高重复鉴定与定量。
以饮食诱导肥胖小鼠为研究对象,采用单步异丙醇提取法处理血浆样本,添加 SPLASH Lipidomix 内标保障检测稳定性;借助质谱的 120,000 高分辨率和智能采集技术,自动排除背景和冗余信号,聚焦样本特异性脂质的碎片化分析;同时结合 Compound Discoverer 和 LipidSearch 双软件进行数据整合,最终鉴定出 610 种独特脂质分子,成功筛选出高脂饮食组与正常饮食组的差异脂质。
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内容策划:邹礼平
内容审核:吴军
题图来源:自己做的
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