乾隆二十二年二月，乾隆皇帝见准噶尔叛乱迟迟未平，果断调整前线统帅，下定决心调集重兵，彻底清剿所有叛乱势力，全歼阿睦尔撒纳及其党羽。
清廷重新任命成衮扎布为定边将军，兆惠为定边右副将军，车布登扎布为定边左副将军，调集满洲、索伦、蒙古、察哈尔、吉林等地的精锐兵马，兵分两路，向准噶尔叛军发起最后的总攻。
就在清军大举进兵的同时，准噶尔境内爆发了大规模的天花疫情。
兆惠等将领抓住战机，率领清军分路推进，对参与叛乱的台吉、宰桑及其部属展开全面清剿，叛军各部接连溃败，主要叛乱首领相继被擒或被杀。
乾隆二十二年七月十八日，辉特汗巴雅尔在逃窜途中，被清军前锋富德派遣的侍卫海兰察率军擒获，随后被押解至京城处置。
同年八月十六日，清军将领由屯率部抵达哈什河，通过侦察得知布鲁古特台吉尼玛藏匿于阿尔察图山口，随即派兵封锁山口两翼，亲自带队发起进攻。
尼玛占据山崖居高临下开枪抵抗，双方相持半日，尼玛见突围无望，率部强行突围，被清军四面围堵，尼玛父子当场被擒，其家眷也在混战中中箭身亡，尼玛随后被打入木笼，押解进京。
绰罗斯台吉扎那噶尔布失去叛军支持后，众叛亲离，被其手下达瓦和珲奇设计诱斩，首级被献给清军，以示归顺。
至此，准噶尔境内的主要叛乱势力基本被肃清，仅剩阿睦尔撒纳率残部逃窜。
阿睦尔撒纳见各路叛军纷纷败亡，清军势不可挡，自知无力抵抗，从博罗塔拉河向西仓皇逃窜，兆惠率领清军穷追不舍，一路追击至哈萨克汗国境内。
乾隆二十二年七月中旬，清军追至爱呼斯地区，兆惠派侍卫顺德讷率军向额克特山进发，阿睦尔撒纳率三百亲信据守抵抗，被顺德讷一举击溃，最终仅带领二十余人逃入哈萨克汗国。
此时哈萨克汗阿布赉早已与阿睦尔撒纳产生嫌隙，且畏惧清军的强大兵力，不愿因庇护阿睦尔撒纳与清廷为敌，随即派遣使者前往清廷，表示愿意配合清军，擒拿阿睦尔撒纳献给清廷。
阿睦尔撒纳抵达哈萨克后，阿布赉立刻派人收缴了其一行人马匹，试图将其控制。阿睦尔撒纳察觉情势不妙，连夜仓皇逃逸，最终仅带领八名亲信徒步逃离哈萨克，进入俄罗斯境内。
乾隆二十二年九月，逃入俄罗斯的阿睦尔撒纳感染天花，不治身亡。俄罗斯方面在清廷的多次交涉下，于乾隆二十三年正月，将阿睦尔撒纳的尸体送至恰克图，清廷派遣官员前往验明正身，确认其身份无误，持续数年的阿睦尔撒纳叛乱彻底宣告终结。
参考资料
1. 《平定准噶尔方略》，清傅恒等撰
2. 《清高宗实录》
3. 《圣武记》，清魏源著
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