人类与狗之间的感情，堪称自然界最为持久稳固的伙伴关系之一，但这种关系究竟何时开始一直是个谜。
早期驯化的家犬和灰狼长得几乎一模一样，光看骨骼大小和外形，根本难以精准区分，之前的研究要么仅能获取破碎的线粒体DNA片段，要么只能依靠骨骼形态进行推测，如此一来，研究所得出的结论往往引发巨大争议，始终无法得出确凿无疑的定论。
直至近期（2026年3月25日），发表于《自然》杂志的一项研究，研究人员借助最为前沿且可靠的古基因组技术，成功揭开了欧洲前农业时代早期家犬基因组的演化进程。
不仅如此，该研究还刷新了凭借全基因组数据，得以证实欧洲地区家犬的最早纪录。
此样本亦是当前全球范围内有全基因组数据支撑的最早家犬样本之一。
这次研究团队一口气分析了216具远古犬科遗骸，其中181具都来自欧洲旧石器时代和中石器时代，也就是农业还没出现、人类还靠狩猎采集为生的年代。
但远古骨头里的DNA降解太厉害，95%的旧石器和中石器时代样本里，属于犬科本身的内源DNA不到5%，79%的样本甚至连1%都不到，剩下的几乎全是微生物污染。
为攻克这一难题，研究团队运用了专业的全基因组靶向捕获技术，将目标DNA的含量直接富集至原来的10到100倍。
最终，成功为141具遗骸完成了精准的狼或狗的遗传身份鉴定。
不仅如此，还对其中7个样本开展了深度全基因组测序。
最后，将所获取的遗传数据与上千组现代及古代犬科的基因组进行了全面比对。
此项研究最为重大的成果，源自瑞士凯斯勒洛克遗址中一具距今14200多年前的犬科遗骸。
基因检测确凿证实，这是目前有全基因组数据支撑的最早家犬，属于冰河时期的马格德林狩猎采集文化。
更关键的是，它和后来全球各地的家犬共享同一套祖先谱系，直接推翻了欧洲旧石器时代的狗完全来自本地灰狼独立驯化的假说，也就是说，那些陪伴欧洲原始人类的早期家犬，并非由欧洲本地灰狼驯化而来，研究并未检测到同期欧洲晚冰期灰狼对它们存在可检测的遗传贡献。
同期于《自然》杂志发表的配套研究，同时揭示了亚洲地区家犬古基因组的关键发现，为欧亚大陆家犬起源与扩散这一拼图补上了至关重要的一块。
目前，经全基因组测序证实的亚洲地区最早家犬，是来自安纳托利亚半岛（今土耳其境内）皮纳尔巴什遗址、距今15800年前的犬科遗骸。
这也是目前全球范围内有全基因组数据支撑的最为古老的家犬，其年代相较于欧洲凯斯勒洛克遗址的样本，早了1600年。
这一发现确凿地证实，早在1.5万年前，家犬便已在欧亚大陆东西两端同步完成了稳定的种群分化，并与不同地区的狩猎采集人群构建起了稳固的共生关系。
至于东亚地区，目前有全基因组数据支撑的最早家犬样本，一是来自东南西伯利亚哈蒂斯特尔洞穴、距今9682年前的个体，二是俄罗斯若霍夫岛、距今9515年前的家犬遗骸。
相关基因组研究成果于2025年发表在《科学》期刊上。
中科院昆明动物研究所团队完成的中国首个古代家犬全基因组测序工作，获取了14个来自中国河西走廊、新疆、内蒙古地区，年代跨度从9700年至870年前的家犬全基因组数据。
这是目前东亚大陆最为系统的古代家犬基因组数据集。
而在更早期的遗存研究中，中科院古脊椎动物与古人类研究所团队在2024年《分子生物学与进化》发表的研究里，获取了中国黑龙江哈尔滨遗址、距今12900年前家犬的高质量线粒体全基因组。
这是目前东亚地区有遗传学数据支撑的最早家犬遗存，属于旧石器时代末期的狩猎采集文化，其年代仅晚于欧洲和安纳托利亚的全基因组家犬样本，有力地证实了东亚地区在冰河时代末期已出现稳定的家犬种群。
从时间线对比来看，目前全球有全基因组确切证据的最早家犬纪录，是来自亚洲安纳托利亚半岛、15800年前的样本，早于欧洲14200年前的家犬纪录；东亚地区有遗传学数据支撑的家犬遗存，最早可追溯至12900年前，同样处于冰河时代末期的前农业社会，仅略微晚于欧洲最早的全基因组家犬样本。
基因比对还有个颠覆认知的发现：这些1万多年前的欧洲家犬，与同期生活在欧洲的本地灰狼几乎没有亲缘关系，反而与欧亚大陆东部的晚冰期灰狼有更强的遗传亲缘性。
而且早在14200年前，欧洲家犬的种群遗传分化就已经清晰出现，这也说明，狗的驯化时间必然比这个时间点还要早几千年，不然根本来不及形成稳定的种群遗传差异。
而东亚家犬的线粒体基因组与核基因组数据，均显示出极高的遗传多样性，进一步印证了家犬的祖先谱系核心起源于欧亚大陆东部，随后伴随人类迁徙向西扩散至欧洲的演化路径，这也正是欧洲早期家犬与东亚灰狼亲缘性更强的核心原因。
这次研究还解开了农业革命对狗种群的影响。
1万年前西亚的农耕人群进入欧洲，当地狩猎采集人群的血统被替换了70%到80%，但狗的命运完全不同。
数据显示，西亚农耕人群带来的家犬血统，对欧洲本地狗的血统替换比例最高也只有66%，多数地区仅在20%左右。
也就是说，欧洲本土狩猎采集部落所饲养的狗，并未随着人类族群的更迭而消逝，相反，它们大量融入了农耕时代的犬群之中。甚至在如今的欧洲犬种里，约有一半的血统源自这些早在冰河时期便陪伴人类左右的忠实伙伴。
而在东亚大陆，家犬的血统延续性更为稳定：全新世以来，东亚家犬的核心血统始终占据主导，仅在青铜时代出现少量欧亚草原西部家犬的血统渗入，并未发生大规模的种群替换，中国北方黄河流域距今7000年至2000年的家犬线粒体谱系，至今仍能在东亚本土家犬种群中找到遗传痕迹。
有意思的是，此次研究有力地纠正了以往的认知偏差。
例如，比利时戈耶特洞穴中一具距今13700年前的遗骸，此前因体型较小、存在人工改造痕迹以及红色染色痕迹，被学界广泛认定为早期家犬，然而，此次基因检测确凿证实，其遗传成分完全属于狼。
同样的认知修正也发生在亚洲考古领域：此前西伯利亚阿尔泰山地区距今3.3万年前的犬科遗骸，曾被依据形态学特征认定为最早的驯化犬类，但后续的古基因组分析显示，其遗传谱系仍属于灰狼分支，并非完成驯化的家犬，再次印证了全基因组技术在早期家犬鉴定中的不可替代作用。
从15800年前的安纳托利亚半岛，到14200年前的欧洲大陆，再到12900年前的东亚大地，从冰河时代的狩猎采集营地，到如今的千家万户，狗和人类的陪伴从来都不是一时的缘分。
这份刻在基因里的羁绊，不仅熬过了冰河时期的严寒，也扛过了人类文明的剧烈更迭，直到今天，依然在每个有狗的家庭里，温暖地延续着。
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