尽管美以联军在过去六周内对伊朗军事基础设施进行了猛烈打击，美国中央司令部称其打击了超过13000个目标，以色列方面则报告打击了约4000个目标，但伊朗的弹道导弹威胁依然存在。
在为期两周的停火协议宣布前夕，德黑兰仍持续向以色列及周边地区发射弹道导弹。尽管战争期间导弹发射频率大幅下降，从首日的约80枚降至后续每周每日约10到20枚，但持续的攻击引发了外界对于近期冲突及去年6月首轮战斗中打击效果的质疑。
美国国防部长劳埃德·奥斯汀曾表示，美以的轰炸行动已“从功能上摧毁”了伊朗的导弹计划，使其军事力量在未来数年内“丧失作战效能”。
以色列国防军表示，由于伊朗部分设施深埋地下，美以仅部分削弱了其导弹项目，虽减缓但并未显著阻断伊朗武器库存的重建。
随着美伊停火谈判于周二重启，以色列方面担忧弹道导弹议题被排除在谈判桌外，导致伊朗获得继续扩充导弹储备的空间。伊朗一名高级消息人士表示，包括导弹计划在内的“防御能力”不在与美国的谈判范畴内。
根据以色列国防军情报部门的评估，伊朗目前仍拥有约1000枚弹道导弹，较战争初期的约2500枚有所减少，且伊朗具备在短期内恢复库存扩充的能力。
以军数据显示，约60％的伊朗弹道导弹发射装置被摧毁或瘫痪，其中约200个发射装置在空袭中被直接摧毁，另有80个因以色列空军打击了地下设施入口而无法使用。
此类评估与2025年6月为期12天的冲突后情况相似。当时以色列官员曾称伊朗半数导弹及八成发射装置被毁，但伊朗随后表现出的补给能力证明了其韧性。
以色列于2026年2月28日联手美国对伊朗开战，旨在摧毁其弹道导弹及核浓缩能力，并寻求政权更迭。以军指出，战争中最重要的战果在于打击了伊朗的武器生产工业，目前伊朗已无法制造新导弹。
军方高级官员在周五的简报中评估认为，伊朗将很快尝试恢复部分制造能力。军事情报局分析称，若无此次战争，伊朗本可在一年半内建立起约8000枚导弹的储备，这将对以色列防空系统构成巨大挑战。
前以色列国防军发言人及防空部队前司令兰·科哈夫向《以色列时报》表示，伊朗许多导弹发射装置和弹药库位于地下，难以彻底摧毁。空军通常采取“封堵”法，通过打击地下设施入口将其封死。
美国保卫民主基金会战略研究员乔纳森·鲁赫指出，这种攻击的效果往往是暂时的，伊朗已在着手清理受损设施。卫星图像显示，美以打击后的48小时内，伊朗便开始清理部分设施。
后续报道显示，伊朗人员通过挖掘废墟，在受袭后数小时内即可恢复部分地下掩体和发射井的运作。即使在4月8日停火协议生效后，此类修复工作仍在继续。
卫星图像证实，在塔布里兹和霍梅尼等地的导弹基地，伊朗正使用自卸卡车清理被封堵的隧道入口。此外，伊朗的移动式导弹发射车具有高度灵活性，且多基于商用卡车改装，成本低廉且易于分散部署，即便导弹库存受损，伊朗也能快速补充发射平台。
除了常规地下设施，伊朗还拥有深埋于扎格罗斯山脉和厄尔布尔士山脉深处的“导弹城”，这些设施作为指挥控制中心，深度远超普通导弹基地。
科哈夫解释称，以军在战争中仅打击了位于“合理深度”的设施。更深层的目标需要美军特有的“掩体粉碎机”等重型钻地弹，但即便如此，部分设施深埋地下500米，已超出此类武器的穿透极限。
此外，伊朗的气候条件也增加了打击难度。每年11月至次年4月的雨季带来的云层、降雨和雾气严重影响了卫星及光电系统的侦察精度。
科哈夫指出，由于伊朗地势高且多山，恶劣天气使得情报收集和目标锁定变得极具挑战。鲁赫补充道，伊朗广阔的国土面积和复杂地形使其能够将导弹分散部署在美以打击范围之外。随着伊朗导弹计划处于“受损但未出局”的状态，未来美以可能需要再次采取军事行动以进一步削弱其能力。鉴于伊朗在压力下展现出的战术调整与适应能力，未来的军事行动能否取得更大成功仍存在不确定性。
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