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上海交通大学医学院

人工智能蛋白质设计课题组

课题组介绍

课题组网站

https://aiproteindesign.org/

课题组长简介

张海仓，上海交通大学医学院药学AI系PI、研究员、博士生导师。博士毕业于中国科学院计算技术研究所计算机专业，曾先后在字节跳动担任人工智能算法工程师、美国哥伦比亚大学担任博士后科学家、中国科学院计算技术研究所担任副研究员。研究方向聚焦人工智能算法及“AI + 生命科学”交叉领域，尤其在 AI 蛋白质设计 与 AI 药物设计方面有长期积累。课题组已经开发了 CarbonDesign、CarbonNovo 等蛋白质从头设计算法，gMVP、MVP 等蛋白质定向进化设计算法，以及 AbX、AbNovo、DiffAffinity 等抗体设计专用算法。学术成果以第一作者或通讯作者身份发表在Nature Machine Intelligence (2022、2024两篇)和Nature Communications (2021)等国际期刊，以及 NeurIPS 2023、ICML 2024（两篇)、ICLR 2025 等人工智能顶会上。曾入选2022年中科院青促会人才项目，主持国自然面上和国家军科委等国家级项目2项，中科院院级项目1项，上海市人工智能跃升计划1项。

课题组研究方向

1.人工智能驱动的蛋白质设计

基于前沿生成式AI模型，建立可编程、高可控、模块化的蛋白质从头设计方法，设计受温度、磁、光照、离子和小分子等外部刺激调控的蛋白质；开发蛋白质原创药物，例如抗体、纳米抗体、肽和小蛋白等。

2.人工智能驱动的计算免疫学

构建AI 底座模型，解码 TCR-抗原识别规则；结合 AI 模型与高通量湿实验系统，加速CAR-T、TCR-T等免疫疗法的开发。

3.下一代生成式AI

开发新一代生成式AI模型；基于强化学习的模型对齐。

招聘岗位要求及待遇

招聘岗位1:助理研究员1名

【岗位要求】

1.具有人工智能、免疫学、数学、物理、生物信息学、或相关研究背景；有博士后研究经历（或者国外一流院校获得博士学位）或相当科研经历，年龄不超过40周岁。

2.以第一作者身份发表过SCI期刊论文或人工智能顶会(ICML, NeurIPS, ICLR)论文，能独立完成文章的撰写等工作。

3.具有一定的基金申请经历，参与或者独立撰写过国内外基金申请。

4.为人乐观友善，积极向上。

【岗位职责】

1.在课题组长指导下，完成相应科研任务。

2.协助课题组长撰写基金和申报课题等相关工作。

3.协助课题组长管理实验室和相关行政事务，指导学生。

【薪资待遇】

应聘者一经录用，其工资、福利和社会保险等相关待遇按上海交通大学医学院有关规定执行，具体情况面议。

招聘岗位2：博后4名（基础医学院、柔性医疗机器人重点实验室、思源博后）

【岗位要求】

1.获得包括但不限于计算机科学、数学、免疫学、生物信息学或者相关专业方向的博士学位，年龄不超过 35周岁。

2.热爱科研，有自我驱动力和快速学习新领域知识的能力。

3.以第一作者身份发表过SCI期刊论文或人工智能顶会(ICML, NeurIPS, ICLR)论文。具有良好的英文阅读、写作能力，能独立完成文章的撰写工作。

4.积极乐观，善于沟通交流，有良好团队协作精神。

5.熟悉Linux环境，Python编程，熟悉Pytorch或Tensorflow。

【岗位职责】

1.在课题组长指导下开展课题研究、论文撰写等相关科研工作。

2.协助课题组长指导学生。

3.协助课题组长撰写基金和申报课题等相关工作，鼓励申请博后基金。

【薪资待遇】

（一）基础医学院博后待遇

1.提供有竞争力的薪酬，相关待遇按上海交通大学医学院有关规定执行，具体情况面议。

2.支持申报各级基金及人才计划，符合条件者可申请交大医学院博士后激励计划、上海市“超级博士后”激励计划、“博新计划”等。

3.按规定缴纳相关社会保险，协助办理落户事宜，参照事业编制人员标准享受体检待遇，享有学校公共资源及住房相关服务。

（二）柔性医疗机器人重点实验室博后待遇

1.参照国内/国际同等岗位优秀人才，提供有竞争力的薪酬；入站博士后根据综合评估（学术水平、工作计划、创新能力、发展潜力等），可享受上海市“超级博士后”待遇（年薪40万元起）或优秀博士后待遇（年薪30万元起），提供免费公寓住宿。

2.鼓励依托本单位申报各级各类科研基金或激励计划，配套相应科研启动经费；鼓励开展国际合作和参加国际会议。

3.按规定缴纳相关社会保险，协助办理落户事宜。

4.学术成果根据单位科研绩效管理办法获得医院相应的奖励。

5.海外博士入站可协助申请上海市及长宁区等各类补贴。

6.博士后期满出站，经考核和专家评议优秀者，优先考虑留院工作，认定或评审通过后可取得相应专业技术资格和职称证书，按要求协助申请上海市及长宁区等各类补贴及安家费。

（三）思源博后待遇及申请条件

待遇：

1.博士后在站期间可以申报国家自然科学基金青年科学基金项目、面上项目、地区科学基金项目。按照不重复支持的原则，在站期间可以申报国家高层次人才特殊支持计划青年拔尖人才项目，可以申报“长江学者奖励计划”青年学者项目等。

2.资助标准为30万元/年，资助期3年，给予一次性安家费3万元。

申请条件：

1.拥护中华人民共和国宪法，遵守国家法律法规，不得反对中国共产党的领导和中国特色社会主义制度，品行端正。

2.具有较强的科研创新潜力，从事国际前沿领域研究。

3.博士学位所属学科为业内公认的世界一流学科，或博士导师为国际公认的一流专家。

4.年龄一般不超过35周岁（1991年1月1日以后出生）。

5.目前尚未回国(来华)或2025年1月1日后回国（来华）。

6.须全职回国(来华)从事博士后研究。

招聘岗位3：实习生4名

【岗位要求】

1.硕士或者博士在读或者已经完成学位，年龄不超过35岁。可来课题组客座实习>=4个月。

2.热爱科研，充满好奇心。

3.熟悉Linux环境，Python编程，熟悉Pytorch或Tensorflow。

4.积极乐观，善于沟通交流，有良好团队协作精神。

【岗位职责】

1.参与课题组科研工作，承担相应科研任务。

【薪资待遇】

一经录用，其工资等相关待遇按上海交通大学医学院有关规定执行，具体情况面议。

应聘材料及方式

请将下述材料按照以下任一方式投递至邮箱 ，请在应聘材料标题中注明“应聘者姓名+应聘职位”。应聘者应提供个人简历、申请信（简述科研兴趣及科研计划，不超过2页）及至少2名推荐人的联系方式。

对于实习生，只需将个人简历发送至上述邮箱。

对于符合要求并通过初审者，将通过电话或邮件的方式发出面试邀请。申请者信息和相关材料将严格保密。我们热诚期待您的加盟！该招聘自发布之日起长期有效，额满为止。

投递简历请选择：上海交通大学医学院人工智能蛋白质设计课题组

简历投递方式（可选任一）：

1. 扫描二维码投递简历；

3. 点击链接投递简历：https://data.bioart.com.cn/f/p0EB2y（复制链接至浏览器投递简历）

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制版人：半夏