Cell Host & Microbe综述丨系统总结抗病毒治疗对共生病毒组潜在影响及其对机体健康的影响|163

人体病毒组是一个动态且极为复杂的生态网络，主要由共生真核病毒、噬菌体（原核病毒）以及内源性逆转录病毒元件组成，其中噬菌体含量最丰富。这些病毒成员通过与人体细胞、共生细菌群以及免疫系统发多层次互作，在维持免疫平衡、塑造微生态结构以及影响疾病易感性方面发挥关键作用。抗病毒药物是目前全球使用最广泛的抗感染治疗手段之一，已在 HIV 感染的长期控制、流感及肝炎病毒的临床干预中得到普遍应用，并深刻融入现代医疗体系。但是，抗病毒药物对人体整体的共生病毒的影响以及由此对机体健康的影响不清。

2026 年 5 月 13 日，中山大学附属第六医院左涛教授团队联合呼吸疾病国家重点实验室赵金存教授团队在 Cell Host & Microbe 上发表了题为 Potential impacts of antivirals on the virome 的文章，系统总结了抗病毒治疗对共生病毒组潜在影响及其对机体健康的影响，由此提出了一个关键概念框架：抗病毒药物不仅靶向作用于病原病毒，同时也可能直接或间接重塑共生病毒组。

1. 抗病毒治疗的作用机制

抗病毒药物主要通过干预病毒生命周期的关键环节来发挥作用，例如抑制病毒进入（融合 / 受体抑制剂）、复制（ DNA/RNA 聚合酶抑制剂、逆转录酶抑制剂、核苷类似物）、整合（整合酶抑制剂）以及病毒组装、成熟与释放（蛋白酶抑制剂、组装抑制剂、神经氨酸酶抑制剂）等，从而有效控制病原性真核病毒的复制与传播。值得注意的是，抗病毒治疗不仅影响既定靶病毒，也可能对人体不同部位的共生病毒组产生特异性重塑，这一潜在影响值得深入关注。

2. 共生病毒对机体健康的意义

共生病毒组在维持机体稳态中发挥关键作用：部分真核病毒（如 Astrovirus 、 Orthoreovirus T1L ）可调节巨噬细胞与 B 细胞功能，促进机体适应性免疫应答；内源性逆转录病毒可通过 cGAS-STING 通路参与维护皮肤稳态；噬菌体也可经 TLR9 等途径调控免疫并影响疾病进程。由此看来，抗病毒药物长期使用所引发的非预期病毒组扰动，可能损害宿主免疫稳态，扰乱共生病毒组平衡，并增加疾病发生风险。

3. 抗病毒药物对共生病毒组的双重影响

抗病毒药物可通过直接与间接两种路径重塑人体共生病毒组。在直接作用方面，由于不同病毒在结构或酶活性位点具有保守性，导致抗病毒药物能对非靶向病毒产生广谱效应：如用于治疗丙肝病毒（ HCV ）的 RNA 聚合酶抑制剂（ sofosbuvir 等）可广谱影响其他 RNA 病毒；治疗 HIV 的逆转录酶抑制剂（ zidovudine 等）能抑制内源性逆转录病毒 K (HERV-K) ；甚至部分作用于真核病毒的核苷类似物也可以干扰噬菌体的 DNA 复制。在间接作用方面，抗病毒药物可通过调节宿主免疫状态（如抗逆转录病毒治疗后 Anellovirus 变化与 CD4 ⁺ T 细胞相关）或改变细菌微生物群（抗病毒药物具抗细菌活性，通过细菌 - 噬菌体生态耦合重塑噬菌体组）来重构共生病毒组。此外，抗病毒药物是否能够诱导前噬菌体进入裂解周期，仍有待进一步研究。

总结

该概念框架指出，共生病毒组在抗病毒治疗中并非静止的背景因素，它既可维持人体免疫功能和内环境稳态，也能成为抗病毒治疗的非预期作用对象，从而凸显出病毒组与抗病毒疗效之间系统且复杂的双向关系。研究视角也因此从“单一靶病毒抑制”拓展到“宿主—微生物—病毒生态网络调控”。考虑到共生病毒组在维持宿主健康及影响疾病进程中的关键地位，未来迫切需要开展多层面、机制导向的系统性研究，深入阐明抗病毒治疗与共生病毒组之间的交互网络。对这一复杂关联的深入理解，将为后续实现更精准的抗病毒策略以及优化微生态稳态管理提供重要的理论支撑。