美国当局正将此案作为一起可能的仇恨犯罪调查。美国联邦调查局表示，袭击南加州最大清真寺的两名少年意在制造大规模屠杀。
美国联邦调查局通报，两名分别为17岁和18岁的少年在对圣迭戈伊斯兰中心发动武装袭击前，先在网上相识。随后，他们前往这座南加州最大的清真寺，杀害3人后自尽。联邦调查局称，这两名少年受种族仇恨驱使，企图在一处当时有140名儿童的场所杀害“很多人”。
圣迭戈联邦调查局办公室负责人马克·雷米利在记者会上说：“我们目前认为，他们是在网上认识的，并在电子交流过程中发现彼此都住在圣迭戈地区，之后成了朋友和同伙，某个时候还在线下有过接触。但至于他们是如何被激进化的，我们现在还不知道。”
执法部门在与嫌疑人有关的住所执行3份搜查令时，查获了30多支手枪、步枪和霰弹枪，同时还缴获了战术装备、弹药和电子设备。
圣迭戈警方在查看清真寺监控录像后，还原了袭击发生的时间线。前不久，两名少年抵达现场，与试图阻止他们进入并启动紧急预案的安保人员发生交火。该安保人员中枪后死于伊斯兰中心入口处。
当时，建筑内的人已经躲避起来。圣迭戈警察局局长斯科特·沃尔在记者会上说：“他们从一个房间转到另一个房间。监控录像显示，他们去了那些幸好没有人的区域。”
其中一名少年透过窗户看到停车场里有两个人在行走，两人随即外出将其杀害。不久后，他们听到警车警笛声，便驾车逃离现场，并在几条街外自尽。沃尔就伊斯兰中心园区内学校的情况表示：“我认为，这救了里面的140名孩子。”
圣迭戈伊斯兰中心伊玛目塔哈·哈桑说：“孩子们以及学校里所有人的生命都保住了，我对此心怀感激。”他还表示，未来两周将停课。“我们遭受了沉重打击。”
枪击发生前数小时，其中一名枪手的母亲曾报警称，她担心自己的儿子——她形容其有自杀倾向——拿走了她的3支枪和她的汽车，可能是要去制造一场大屠杀。她还看到儿子与另一名年轻人同行，两人都穿着迷彩服。
事实证明，她的担心并非多余。两人正前往实施屠杀途中，曾朝一名园丁随机开枪。子弹击中其头盔，但这名园丁幸存。联邦调查局已确认，枪击案中使用的武器属于其中一名袭击者的母亲，也就是拨打911报警的那位母亲。
目前，当局表示，并不存在针对伊斯兰中心的任何具体威胁。雷米利说：“我们正在分析所有证据，检查所有可能提供答案的电子设备。但我能说的是，他们显然是想袭击很多人。”
两名少年的社交媒体账号已成为调查关键。联邦调查局表示，仍在寻找他们发布内容中可能存在的意识形态激进化证据，以及“他们完整计划究竟是什么”的相关细节。“清真寺的殉难者”
清真寺安保人员阿明·阿卜杜拉在试图阻止两名持枪少年时身亡。根据当局说法，他避免了更大的悲剧发生。沃尔在记者会上说：“他的行为是英勇的。”他还补充说：“毫无疑问，他救了人命。”
阿卜杜拉和该清真寺的两名礼拜者，均在这起发生于宗教中心的枪击案中遇难。该中心内还设有一所学校，有数十名儿童就读。
当地时间上午11时41分，枪手抵达清真寺并开火。阿卜杜拉是这处场所的主要安保力量。众筹平台“发起善举”上的一项募款活动写道：“他挡在枪手和建筑内所有人之间。就在当天下午，警方安全疏散了楼内教师、工作人员和十多名儿童，牵着他们的手把他们带离现场。他们之所以还活着，是因为阿明履行了自己的职责。而他为此付出了生命代价。”
这项发布在“发起善举”平台上的募款已筹得超过160万美元，用于支付阿卜杜拉的丧葬费用，并为其家人提供经济支持。
募捐发起方包括伊斯兰中心和美国——伊斯兰关系委员会圣迭戈分会。他们将阿卜杜拉称为“殉难者”和勇敢的人。募款页面写道：“他没有逃跑，而是坚守岗位……他不只是一个保安，他是迎接每一个走进大门之人的那个人，也是最关键时刻的最后一道防线。”
阿卜杜拉身后留下遗孀和8名失去父亲的孩子。他是家里的主要经济支柱。发起方表示，部分善款将用于解决眼前需求，包括食物、房租和水电开支，也将用于支付孩子们的教育费用，并为他们提供“长期的经济稳定”。
另外两名遇难者已确认为曼苏尔·卡齐哈和纳德尔·阿瓦德，两人都是该宗教中心的礼拜者。卡齐哈平时帮助维护场地设施，也在园区便利店帮忙；阿瓦德的妻子则在园区内学校任教。
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