近日,华南农业大学国家植物航天育种工程技术研究中心团队在Nature Communications期刊上发表题为“Multiomics analysis of the molecular and single-cell responses of rice after deep-space flight on Chang'e-5”的研究成果。农学院已毕业博士生孙凯为第一作者,郭涛研究员和陈志强教授为通讯作者。
深空环境会对植物基因组稳定性、基因表达、表观遗传修饰和细胞分化造成重要影响。本研究采用多组学分析方法,研究水稻经绕月飞行后在分子和单细胞水平上的变化。研究发现,经过绕月飞行后,水稻基因组变异大量增加、DNA甲基化和RNA m6A修饰水平提升。同时,本研究将基因组变异与单细胞RNA-seq结合,系统分析了携带变异细胞的分化,鉴定出NAC家族转录因子SVT1(suppressor of variation transmission 1)可能通过负调控MAPK通路基因来影响携带突变的细胞分化。
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