马克·马奎斯在匈牙利大奖赛排位赛中力压赛前大热佩德罗·阿科斯塔，以1分36秒791的惊人单圈拿下杆位。这位卫冕世界冠军在Q2开局阶段遭遇摔车，却能在最后时刻逆转战局，继续保持在巴拉顿公园赛道的排位赛不败金身。

阿科斯塔一度将标杆推进到1分37秒以内，领先全场超过半秒。但马奎斯在最后五分钟换上全新软胎后，跑出了足以锁定杆位的成绩。阿科斯塔回应圈仅做出1分36秒838，而马奎斯随后再度刷新至相同成绩，彻底扼杀悬念。格雷西尼车队的费尔明·阿尔德格尔抢下前排第三位。

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杜卡迪阵营统治力尽显，法比奥·迪詹南托尼奥拿下第四，从Q1突围的厂队车手弗朗西斯科·巴尼亚亚位列第五，前五名中占据四席。阿普利亚方面表现低迷，马尔科·贝泽基仅排第六，落后杆位圈速超过零点六秒。Trackhouse车手劳尔·费尔南德斯和队友豪尔赫·马丁紧随其后，本田车手卢卡·马里尼同样从Q1杀出，排名甚至压过Trackhouse的另一台赛车。

Q2关门线竞争激烈，霍安·米尔虽在排位赛初期领跑，却被队友马里尼挤出前十二，只能从第十三位发车。他将与Tech3的埃内亚·巴斯蒂亚尼尼和雅马哈厂队车手法比奥·夸塔拉罗共享第五排。外卡参赛的世界超级摩托车明星伊克尔·莱库奥纳驾驶格雷西尼杜卡迪位列第十六，KTM车手布拉德·宾德排在其后。马奎斯此役拿下个人赛季第二杆，此前他曾在赫雷斯的西班牙大奖赛中获得排位赛第一。