一支哈佛大学主导的研究团队把硅芯片做成了DNA合成器。他们不再依赖传统化工厂式的大规模设备,只需要电流和普通的水环境,就能在指尖大小的芯片上同时“编写”64条不同的DNA链。这项成果已发表在《自然·电子学》杂志上。

目前全球绝大多数定制DNA都采用磷酰胺酯化学法合成。这种方法成熟、并行度高,能一次性产生数百万条序列,但它有一个绕不开的代价——大量使用有毒有机溶剂,而且生产高度集中在专业设施里,难以化整为零。相比之下,酶促DNA合成是在水中进行的,更贴近活细胞组装遗传物质的方式,被视为一种更温和、更绿色的路径。若走向实用,它有望让DNA合成设备变得更小、更安全,甚至进入普通实验室和医疗现场。

打开网易新闻 查看精彩图片

可惜酶促路线长期被一个短板拖住:并行能力远远落后于传统化学法。此前的酶促系统最多只能同时合成十几条序列,离实际需求还很远。哈佛团队一举把这个数字拉到64条,每条序列的长度可达39个核苷酸,为并行酶促DNA合成树立了新的性能标杆。

在化学合成中,DNA链是逐核苷酸添加上去的。每加上一个核苷酸,就会被临时“封端”——一个阻断基团防止链不受控制地延长。要让下一个核苷酸接上去,必须先把阻断基团脱掉,这一步叫作脱保护。芯片的巧妙之处在于用电信号精准完成脱保护。研究人员在硅表面布置了64个DNA合成位点,每个位点中央固着DNA链,外围环绕着两圈同心圆电极。需要脱保护时,电极产生电流,在特定位点瞬间营造出低pH的酸性微环境,触发脱保护反应,而其他位点丝毫不受影响。整个过程完全在水溶液中进行,不需要切换有机试剂。

领导这项研究的Donhee Ham教授来自哈佛大学约翰·A·保尔森工程与应用科学学院。他所在的团队一直在探索半导体技术与生物学的交叉地带。从神经活动监测、DNA测序再到现在的DNA制造,硅芯片正跨越计算领域的边界,成为生命科学里越来越趁手的工具。