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在《星际迷航》里，探索往往伴随着风险，也伴随着回报。明明心里没底，也敢闯进未知区域，同时还随时准备应付任何情况，这是一位优秀船长的标志。然而，当星际舰队的船长，光有勇气不够，还得有比银河系最聪明的人更聪明的头脑。
战术、机动操作、外交和科学知识都是星际舰队船长职责的关键方面。在面对陌生的变量和物种时，他们必须快速且有创造性地思考，这需要的不仅仅是平均水平的智力。在整个《星际迷航》系列中，五位船长明显脱颖而出，成为最聪明的人。
派克船长是一位杰出的战术家
几十年来，克里斯托弗·派克船长的成就一直被詹姆斯·柯克所掩盖，柯克在《星际迷航：原初系列》早期接替派克成为企业号船长。直到这个角色在《星际迷航：发现号》中重新引入该系列，粉丝们才更清楚地了解了派克船长的才智和领导团队的能力。
作为星际舰队中功勋最卓著的军官之一，派克在一些看似最不可能完成的任务中脱颖而出。即使目睹了自己不可避免的苦难，他仍然选择按照既定的未来前进，尽管他知道自己黑暗的命运。一个人要在与自己的命运抗争的同时，仍然走在通往命运的道路上，这需要极大的自律。
探索星际舰队已知范围之外的新世界，需要伟大的头脑和依靠船员优势的意愿。派克船长做过的最聪明的事，就是利用与他共事的人们的技能。他没有独自承担解决所有遇到问题的责任，也从未因为是船长就将自己置于船员之上，以高级成员自居。
这不仅仅是谦逊；这是明智之举，因为当全体船员与舰长共同面对宇宙中的未知变量时，这能在他们之间建立深厚的信任。
本杰明·西斯科的情商可与皮卡德相媲美
每位星际舰队舰长的职业生涯经历都是其领导才能发展的重要因素，而这一点在本杰明·西斯科舰长身上体现得最为突出。西斯科带着沉重的感情包袱接任了深空九号指挥官一职，而这塑造了他作为一个男人、父亲和领袖的形象。
与在导致西斯科失去妻子的事件中扮演关键角色的皮卡德舰长颇为相似，西斯科也是一个由高情商驱动的人。他还拥有精神层面的智慧，这种智慧甚至在他生命的后期才被他自己所理解，而这种精神智慧常常指引着他最重要的决定，尤其是在与贝久相关的事务上。
西斯科的个人损失和经历，加上他后来成为贝久先知使者的身份，并不是展现他极端情商的唯一例证。他做出的每一个决定，以及那些近乎疯狂、濒临失控却又思维最为清晰的时刻，都不可否认地体现了这一点。
西斯科总是先凭内心感受思考，然后退后一步，用理智去分析这些感受。他在深空九号任职期间，这种独特的方式带来了不少开创性的发现。
詹姆斯·T·柯克船长的智慧与反叛
当《星际迷航》的粉丝们想到詹姆斯·T·柯克船长时，脑海中浮现的往往是撕裂的衬衫、挥舞的拳头，以及各个外星种族女士们倒在他强健臂弯里的画面。但柯克远不止大家从外表看到的那副肉体形象。他是一个全面发展的人，拥有足以与斯波克在进取号上最深刻的思想交锋中一较高下的智慧头脑。
粉丝们有时会忘记，柯克在学院时的一位老同学曾形容他“像一摞长着腿的书”。他也是星舰学院历史上最年轻的舰长，这意味着尽管他天性叛逆，但他知道何时该专心攻读，完成任务。
他的聪明才智还使他成为一名杰出的战略家和极其精明的谈判者，让他常常看似仅凭直觉就能预判结果。敏捷的思维能够娴熟地处理信息，从而做出明智的决策，以适应并驾驭突发状况。柯克船长也许常常凭浪漫的内心行动，但他的头脑足以支撑他做出那些广为人知的恶作剧和叛逆行为。
让-吕克·皮卡德船长的高情商使他成为杰出的领袖
要成为杰出的星际舰队船长，需要的不仅是书本智慧和科学才能（这两点皮卡德船长都有），还要有极强的同理心和高情商，才能赢得船员的尊重。这些能力还让他在执行探索与发现的核心使命时，能和新文明乃至潜在敌人周旋谈判。
皮卡德智力超群，但并不张扬。他沉思默想，是一位极其深沉、内省的领导者，凡事深思熟虑。在每场冲突中，他首先寻求和平，而不是诉诸激进的战斗和炫耀武力。
归根结底，皮卡德从不只为自己。他是一个想让银河系比他发现时更美好的人。仅这一点就需要非凡的情商，而皮卡德恰恰拥有过人的情商。
凯瑟琳·珍妮薇船长联合对立势力，完成不可能的归家之旅
凯瑟琳·珍妮薇童年时与父亲关系亲密，这培养了她的好奇心，并激发了她对科学的热爱，为她日后作为联邦星舰航海家号船长所面临的意外灾难做好了准备。被困在银河系另一侧未经探索的德尔塔象限，珍妮薇别无选择，只能联合两个对立的派系，以确保她幸存的船员和叛逆的马奇队员能够活着回到联邦空间，讲述这段故事。
珍崴的科学思维使她能够在人类尚未遇到的复杂情境中游刃有余。在执掌航海家号之前，她担任科学官的经验，让她具备了不仅是在未知太空中导航，更是要在其中生存下来的适应能力。
她的外交手腕赋予了她必要的优势，使她能够管理合并后船员中彼此对立的成员，并与航海家号在三角洲象限遇到的每一个新物种进行沟通。虽然人们常常将博格人与皮卡德联系在一起，但珍崴舰长和她的船员对博格集合体造成的伤害要大得多。珍崴用一种病毒感染了他们，迫使博格女皇为了确保自身生存而吞噬整个蜂巢，从而为他们的最终灭亡埋下了伏笔。
在重重困境中，珍崴带领航海家号比预计返回时间提前数十年回到了阿尔法象限，而且她是利用科学和博格人来做到这一点的。每一位星际舰队舰长都有自己的优点，不可否认的是，要获得这一职位的任命，一个人必须极其聪明。尽管如此，鉴于她在《航海家号》之前、期间和之后所取得的诸多成就，珍崴舰长无疑是所有《星际迷航》舰长中最聪明的一位。
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