2026 年 8 月 6 日，Arc 研究所/斯坦福大学 Brain L. Hie 团队在国际顶尖学术期刊 Science 上发表了题为：Generative design of bacteriophages with genome language models 的研究论文。

该研究使用在数百万个天然基因组上训练的生成式 AI 模型，首次实现了完整噬菌体基因组的生成式设计，且这些 AI 设计生成的噬菌体能够存在、特异性感染细菌宿主，还能够迅速克服对天然噬菌体产生抗性的细菌。这项研究为基于 AI 的全基因组尺度生物功能设计奠定了基础。

在这项研究中，Brain L. Hie 团队利用他们开发的基因组语言模型——Evo 1 和 Evo 2，生成了具有真实遗传结构并能特异性感染细菌宿主大肠杆菌的完整噬菌体基因组。

以天然噬菌体 ΦX174 为设计模板，研究团队成功生成了多种具有目标宿主特异性和不同适应性特征的可存活噬菌体，冷冻电镜证实，其中一种生成的噬菌体在其衣壳中使用了一种进化上相距较远的 DNA 包装蛋白。此外，多种生成的噬菌体混合物能够快速克服对天然噬菌体 ΦX174 具有抗性的大肠杆菌菌株，展示了 AI 生成噬菌体疗法应对快速进化的细菌病原体的可行路径。

论文链接：
https://www.science.org/doi/10.1126/science.aec2657

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