微山县是国内少有的“因湖设县”，设立初衷就是统一治理南四湖（南阳、独山、昭阳、微山，统称微山湖），解决苏鲁两省数百年湖区纠纷。

一、建县前背景

明清至民国，南四湖湖面、滩地分属山东、江苏两省共6个县（山东：嘉祥、鱼台、凫山、峄县、薛城；江苏：沛县）分管。

湖水随汛期涨落，湖界飘忽不定，渔业、湖田、防汛排涝多头管理，两省沿湖群众经常发生矛盾冲突，很难统一调度治理、治安、救灾。

抗战时期这里有沛滕边县等抗日临时政权，但属于战时建制，建国之后即撤销，湖区依旧分割管理 。

二、过渡阶段：湖区办事处（1949‑1953）

1949年12月，设立湖区办事处，驻地夏镇，隶属于台枣专区，临时管辖整个南四湖水面、沿湖部分村庄与水上渔民乡，用来缓冲湖区矛盾 。

办事处只是派出机构，不是正式县级政权，权限有限，无法彻底解决跨省边界、土地归属等根本问题，因此中央筹划正式设县。

三、正式建县（1953年）

1. 1953年8月：政务院正式批准设立微山县。

​2. 1953年10月，微山县正式成立，隶属于济宁专区（今济宁市）。

划取范围：苏鲁两省6县划出4镇、302个村庄、4个水上渔民乡，把整片南四湖全部纳入微山县管辖，县名取自湖中的微山岛（商代微子葬于此），县政府驻地夏镇 。

建县之后，结束南四湖几百年来“一湖分属多县”的局面，湖面统一归微山县管理，统筹防汛、渔业、治安、湖产资源开发。

四、建县后版图逐步定型

1. 1956年，凫山县、薛城县撤销，部分沿湖区域划入微山；同时少量村庄划归江苏徐州。

​2. 后续1957‑1960年，滕县（原济宁）、济宁县、峄县（现枣庄）部分村庄陆续调整划入。

​3. 1984年8月，为彻底理顺苏鲁省界，江苏沛县14个沿湖自然村划入微山县，至此，今天微山县完整疆域基本定型。

​4. 1983年济宁地区撤地设市，微山县隶属济宁市至今。