近日,山东农业大学联合中国科学院昆明植物研究所及西双版纳热带植物园等单位在《自然—通讯》在线发表类禾基因组的研究成果,系统重建了禾本科祖先核型演化历程,确认ρ-WGD的发生时间与异源多倍化性质,并为小穗的起源提供了新的基因组学证据。
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该研究利用Nanopore长读长测序、二代测序和Hi-C技术获得了类禾高质量染色体水平参考基因组,并结合禾本科主要支系和单子叶植物鸭跖草类多个外类群的基因组开展了比较基因组学分析。研究确认类禾与其它禾本科植物共享了ρ-WGD,并推断该事件发生于约1.04亿年前,略早(或接近)于类禾与其它禾草的分化时间(约 1.02 亿年前)。进一步分析发现两套亚基因组间呈偏向性基因保留,且这种偏好性在加倍之后随即建立并被禾本科各支系继承延续,从而支持ρ-WGD源于一次古老的异源四倍化事件。
山东农业大学刘云龙教授、中国科学院版纳植物园郭岑副研究员、中国科学院大学博士生高舒扬为论文共同第一作者,山东农业大学李德铢教授、刘云龙教授和中国科学院昆明植物研究所马朋飞研究员为共同通讯作者。
论文链接:
https://doi.org/10.1038/s41467-026-76979-2
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