大语言模型与视觉基础模型已经验证了一条重要路径:先在大规模、多样化数据上预训练,再通过微调、提示或上下文学习适配下游任务。但在金融风控、能源预测、推荐系统、分子发现等真实场景中,真正支撑决策的往往不是自然语言或像素,而是表格、时间序列与图等结构化数据。与文本和图像相比,结构化数据面临更复杂的问题:表格依赖 Schema,时间序列具有明确的时间顺序与动态过程,图则依赖节点、边与高阶拓扑关系。它们不仅结构差异巨大,甚至连什么算一个 token都没有统一答案。

近期,Sun 等人推出综述 A Survey on Foundation Models for Structured Data: Tabular, Time Series, and Graphs,系统梳理 150+ 个代表性方法,并从 Tokenization、Architecture、Pre-training、Adaptation 等维度,将 Tabular、Time Series 和 Graph 三条长期相对独立的发展路线放入同一分析框架。本文将围绕这套统一视角,对结构化数据基础模型的发展脉络、代表性方法及未来方向进行梳理。

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论文标题:
A Survey on Foundation Models for Structured Data: Tabular, Time Series, and Graphs
论文链接:
https://doi.org/10.20944/preprints202605.1532.v1
仓库链接:
https://github.com/RingBDStack/awesome-structured-data-FM

一、为什么结构化数据

需要自己的基础模型?

基础模型在语言和视觉中的成功,依赖几个重要前提:输入表示相对统一、存在较规范的 Tokenization,并且可以利用较稳定的归纳偏置进行大规模预训练。结构化数据则明显不同。

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图1:非结构化与结构化数据对比

综述指出,结构化数据会系统性地打破这些假设:数据异质导致归纳偏置碎片化,表格单元格、时间点和图节点又缺少像文本 Token 或图像 Patch 那样规范的 Tokenization,结构语义还与任务高度耦合。因此,结构化基础模型的核心问题便是:如何同时实现统一表示与结构归纳偏置保留。

二、一套贯穿三类数据的统一分析框架

不同于以往分别讨论表格、时序或图的单模态综述,该综述将三类数据放在同一套框架下比较。

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图2:结构化数据基础模型的统一分析框架

该综述从 Tokenization、Architecture、Pre-training、Adaptation 四个维度统一梳理现有方法。从这一视角看,Tabular、Time Series 与 Graph 虽然结构不同,但实际上都在回答类似的问题:如何将复杂结构抽象为可学习表示,并让预训练得到的知识跨数据集、跨领域、跨任务复用。

三、表格基础模型:

从“每张表训练一个模型”走向迁移与 ICL

Tabular Foundation Model(TFM)的目标,是从大规模表格或任务分布中学习可迁移知识,并在面对新的 Schema、数据集和任务时快速适配。代表性方法的数据来源、预训练目标、Tokenization 与适配方式如下表所示。

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图3:代表性表格基础模型

值得注意的是,TFM 正在逐渐改变传统表格机器学习的使用方式。 以 TabPFNv2、TabICL 等为代表的方法可以直接将训练样本和标签作为上下文,在一次前向传播中对新样本进行预测,而无需针对每个数据集重新训练完整模型。这使得表格学习从传统的:新数据集 → 重新训练模型逐步出现另一种范式:预训练模型 + 上下文样本 → 直接完成新任务。对于小样本、标签昂贵或任务频繁变化的场景,这类 ICL 能力尤其值得关注。

四、时序基础模型:

Point、Patch 还是 Temporal Feature?

Time Series Foundation Model(TSFM)希望从大规模时间序列中学习可迁移的时间先验,并跨领域、跨数据集甚至跨任务泛化。现有预训练数据仍以金融、能源、交通、气候等真实多域时间序列为主,也有 ForecastPFN 等工作使用合成数据扩大预训练分布。

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图4:代表性时序基础模型

从中可以看到,Tokenization 粒度(Point、Patch 或 Temporal Feature)和架构选择(Transformer-based 或 LLM-based)共同决定了模型如何看见时间结构。不过,目前多数 TSFM 仍首先聚焦 Forecasting。能够同时支持分类、插补、异常检测等多类任务的模型相对更少,因此跨任务统一仍是当前的重要挑战。

五、图基础模型:

如何让结构本身成为可迁移知识?

Graph Foundation Model(GFM)需要在分子图、引文网络、社交网络、知识图谱等不同类型的图之间学习可迁移表示。 与表格和时序相比,图的结构空间更加开放。不同图中的节点、边和子结构语义可能完全不同,因此 GFM 的关键问题之一是:什么样的结构单元可以成为跨域迁移的 Token?

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图5:代表性图基础模型

现有方法在 Tokenization 上覆盖图结构 Token、辅助抽象 Token 和语言/序列 Token,架构上则形成 GNN-based、LLM-based 与 GNN–LLM Hybrid 三条路线。 GFM 的另一个明显趋势是不断降低下游适配成本。Prompt、轻量微调、Instruction Tuning、ICL,以及 OpenGraph、ZeroG、GraphAny 等 Zero-shot / Adaptation-free 路线都在探索:能否在面对未见过的新图时,尽量不重新训练模型。

近期,GFM 还开始进一步进入图推理与 GraphRAG 场景。相关研究从结构化知识上的上下文推理,逐渐发展到使用预训练 GFM 检索关键子图、支持多跳关系推理,再与 LLM 结合完成更复杂的推理任务。这使得 GFM 的角色开始从“通用图编码器”,扩展为结构化检索与关系推理模块。

六、三类 Foundation Model

的共性与差异

将三类结构化 Foundation Model 放在一起,可以得到如下对比:

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从现有工作来看,表格、时序和图基础模型并不是三条完全独立的技术路线。它们虽然采用不同的结构表示和模型架构,但都需要解决通用预训练与结构特性保留之间的平衡问题。

七、开放挑战与未来方向

综述最后讨论了结构化数据基础模型的几个开放问题,主要包括 Scaling Law、统一建模,以及与 LLM、VLM 和 Agent 系统的协同。

7.1 Scaling Law

结构化数据具有明显的 Schema 依赖、时间动态和关系拓扑,其扩展规律可能不同于语言和视觉模型。后续研究需要进一步分析模型规模、数据规模与结构复杂度、归纳偏置之间的关系,并关注 Grokking、突然泛化等训练现象。

7.2 统一的 Structured Foundation Model

目前 Tabular、Time Series 和 Graph Foundation Model 仍大多分别发展。统一建模需要进一步解决三方面问题:一是设计能够表示行、时间戳、节点、边等对象的统一 Token 接口;二是构建可组合时间编码、关系推理和特征交互模块的架构;三是探索能够跨模态共享的结构预训练目标。 已有工作开始尝试不同结构模态之间的迁移,例如使用 Tabular Foundation Model 处理图任务,或将 Graph Foundation Model 用于时间序列分析。

7.3 与 LLM、VLM 和 Agent 系统协同

目前常见做法是将结构化数据序列化后输入 LLM,但这一过程可能损失原有的 Schema、时间约束和关系信息。 后续研究可以进一步探索不同 Foundation Model 的协同方式:LLM 和 VLM 提供语义理解与感知能力,Structured Foundation Model 则负责关系推理、约束建模和时间动态分析。在 Agent 场景中,这类结构建模能力还可以用于状态追踪、规划和工具协调。

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