如果把传统药物靶点比作一个"有口袋的锁",那蛋白-蛋白相互作用(Protein-Protein Interaction,PPI)就是两把"锁在一起的手"——界面又大又平,没有现成的深口袋可钻。长久以来,PPI 被认为是"不可成药"的代名词。但近二十年的突破证明,PPI 恰恰是肿瘤、炎症、免疫等重大疾病里最诱人的靶点富矿:KRAS、p53/MDM2、Bcl-2 家族、PD-1/PD-L1……这些明星靶点,本质上都是 PPI 靶点。

PPI"难成药"的根子,在于它的界面特性。酶和受体有明确、深凹的活性口袋,小分子嵌进去就能起效;而 PPI 界面通常是一大片几百到上千平方埃的平坦接触区,结合能分散在多个松散的"热点"残基上,单个小分子很难同时覆盖。更麻烦的是,PPI 的互作双方往往是两个大蛋白,构象会动态变化,静态的口袋模型根本套不上。早期针对 PPI 的筛选屡屡失败,让"PPI 不可成药"一度成为行业共识。转折点来自两个方向:一是识别出 PPI 界面上少数贡献主要结合能的"热点"残基,小分子只要占据这几个关键点就能有效阻断;二是发现某些蛋白表面存在"隐性口袋",在结合或变构时才会打开,成为可被小分子利用的突破点。

要开发 PPI 抑制剂,第一步是把"这两只手到底握得有多紧、在哪里握"测量清楚——这正是 PPI 检测技术的用武之地。不同的技术回答不同层次的问题:SPR 等生物物理方法,能在无标记条件下定量两个蛋白的结合亲和力与动力学,是 PPI 验证的"金标准";TR-FRET 均相检测,利用荧光共振能量转移,在溶液中高通量地读出两个蛋白是否靠近,适合筛选;NanoBiT 技术则把荧光素酶拆成两半、分别融合到两个互作蛋白上,一旦互作发生、两半靠拢就恢复发光,能在活细胞内实时监测 PPI 的动态;NanoBRET PPI 检测更进一步,通过生物发光共振能量转移,在活细胞原生环境里定量 PPI 的强度与药物抑制效果。这些技术各有侧重,组合使用,才能把一个 PPI 靶点从"定性互作"做到"定量抑制"。

拿到 PPI 的检测手段后,抑制剂的发现策略也就清晰了:可以走传统的"直接阻断"路线,用小分子或拟肽占据界面热点;可以走"变构调控"路线,在远离界面的隐性口袋下手,远程干扰互作;还可以反其道而行之,用"稳定 PPI"的分子胶或诱导邻近策略(PROTAC 本质上也利用了 PPI)来重定向蛋白的命运。无论哪条路线,一个可靠的 PPI 检测平台都是底层刚需——它决定了你能不能确认"药物真的把这两只手掰开了",以及掰开的程度有多大。

爱思益普在 PPI 检测上提供了多技术并行的能力组合:NanoBiT 与 NanoBRET PPI 检测,在活细胞层面实时监测蛋白互作;FRET/TR-FRET 检测服务提供高通量均相筛选方案;SPR 亲和力检测服务则以无标记方式精确读出结合动力学。对聚焦 PPI 靶点、KRAS 这类难成药靶点,或蛋白降解剂这类依赖三元复合物互作的团队来说,这套多维度 PPI 检测能力,是把"不可成药"重新变成"值得一搏"的第一块跳板。

打开网易新闻 查看精彩图片