CD8+T细胞丰度不足以评估抗肿瘤免疫，在预测乳腺癌预后和免疫治疗反应方面表现不佳，可能是由于CD8+T细胞功能的复杂性。虽然单细胞RNA测序（scRNA-seq）可以剖析CD8+T细胞的多方面功能，以更好地评估其免疫功能，但其临床应用受到限制。
2024年12月23日，中山大学宋尔卫及陈凯等团队合作在Cancer Immunology Research在线发表题为“Profiling Multiple CD8+T-Cell Functional Dimensions Enhances Breast Cancer Immune Assessment”的研究论文，该研究通过对scRNA-seq和匹配的整体RNA-seq数据的综合分析，开发了基于整体RNA-seq的FuncDimen模型，从5个方面评估CD8+T细胞的功能：肿瘤反应性、细胞毒性、IFN-γ分泌、增殖和凋亡。
利用免疫荧光和成像细胞计数技术在乳腺癌队列和外部数据库中验证了量化CD8+T细胞不同功能维度的FuncDimen模型。研究人员通过对所有5个FuncDimen模型的加权聚合来计算FuncAggre评分，以概括整体抗肿瘤免疫。在乳腺癌队列和外部数据库中，FuncAggre评分在乳腺癌预后（曲线下时间依赖面积[AUC]: 0.56-0.70）和免疫治疗反应（AUC: 0.71-0.83）方面表现出优于其他免疫生物标志物的预测性能，无论乳腺癌分子亚型如何。总之，FuncDimen模型在临床中提供了CD8+T细胞介导的抗肿瘤免疫的精细评估，增强了乳腺癌的预后预测和帮助个性化免疫治疗。
另外，2024年12月25日，iNature总结了2024年中山大学宋尔卫团队在Nature，PNAS及Cell子刊等发表了10篇文章。
CD8+T细胞在肿瘤免疫中的关键作用，提示了评估CD8+T细胞丰度的潜在临床价值。然而，CD8+T细胞丰度在乳腺癌预后和免疫治疗反应中的预测价值在不同的研究中有所不同，表明仅丰度不足以评估CD8+T细胞介导的抗肿瘤免疫。每个CD8+T细胞在关键功能维度上表现出不同的活性，如细胞毒性、IFN-γ分泌、肿瘤反应性、增殖和凋亡，共同促进抗肿瘤免疫。因此，定量、全面地分析CD8+T细胞的多个功能维度可能更直接、更好地评价抗肿瘤免疫。
单细胞RNA测序（scRNA-seq）已成为分析CD8+T细胞多个功能维度的有前途的工具。然而，由于scRNA-seq的成本高、样品处理复杂，其临床应用受到限制。在临床环境中，Bulk RNA-seq具有更多的优势和应用。然而，目前尚不清楚BulkRNA-seq是否可以用于量化CD8+T细胞的多个功能维度，以更好地进行免疫评估。
研究设计概述（图源自Cancer Immunology Research）
该研究开发了基于RNA序列的大量模型，称之为FuncDimen模型，以描述CD8+T细胞的多个功能维度，包括肿瘤反应性、细胞毒性、IFN-γ分泌、增殖和凋亡。该研究证明了所有5种FuncDimen模型的加权聚集（FuncAggre评分）可以更好地评估CD8+T细胞介导抗肿瘤免疫的整体能力，并更好地预测乳腺癌预后和免疫治疗反应。
该研究还使用FuncDimen模型来探索不同药物的免疫调节作用，并预测潜在的免疫诱导策略以增强免疫治疗反应。总的来说，该研究已经建立了基于RNA序列的FuncDimen模型可以在临床中识别免疫治疗应答者，并有助于个性化免疫治疗。
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