《诛仙》中，正魔两道势不两立，是一对永恒的仇敌。
在八百年前，魔教由黑心老人统治时期，就与正道结下了血海深仇。当时的正道以青云门青叶真人为首，还有手持天琊神剑的散仙枯心上人等强者，重创了魔教各大派，黑心老人也是身受重创而死。而随着黑心老人去世，魔教各派系也分裂，各自为战，传承下来。
直到近百年来，魔教又发动了三次围攻青云门之战。
仇忘语为首的魔教势力
自黑心老人之后，仇忘语是又一个统一魔教的教主。
仇忘语也是一个奇才，因在蛮荒圣殿得到机遇而修行大进，一统魔教。在魔教统一两年之后，仇忘语就集长生堂、万毒门、鬼王宗、合欢派等魔教，攻打青云门。
这一战中，魔教精锐尽起。仇忘语身负天魔策奇术手持异宝血魔幡叱咤风云，万毒门门主毒神、鬼王宗宗主鬼王、长生堂堂主段候、合欢派门主月华仙子各负奇宝异术，还有青龙、白虎、真雩、郑通、玄武、万毒子、端木铁、吸血小妖等全部到青云门进行参战。
青云门作为正道领袖，底蕴也是十分深厚。掌门天成子的修为深不可测，小竹峰首座真雩、大竹峰首座郑通两人也是修为深厚，还有道玄、万剑一两个少年英才修为也是不凡。
不过，青云门的高手相比魔教还是差了很多。在魔教的攻击下，天成子被仇忘语打得重伤，青云门败相毕露。
危急时刻，天成子强行使用了诛仙剑。天成子本已重伤，使用诛仙更是七窍流血，但依然一剑洞穿仇忘语，又是斩月华仙子一条胳膊，重伤鬼王，劈死段候，打败了魔教。
经过这一战，魔教势力大挫。随着仇忘语身死，魔教再次四分五裂，竟然被万剑一、苍松、田不易、曾叔常、商正梁五人在蛮荒圣殿大闹了一番。自此，魔教四大门派也开始休养生息。
青云门一方也是损失惨重，门人弟子死伤众多。天成子也因为强行使用诛仙剑遭遇反噬而入魔，被道玄和万剑一所杀。不过，新任掌门道玄比天成子更出色，又有苍松、田不易、商正梁、曾叔常、水月、天云成为新的首座，青云门很快振兴起来。
玉阳子为首的魔教势力
在第一次围攻青云门后，魔教四大门派宗主只有万毒门的毒神安然无恙，其他三派分别由鬼王、玉阳子、三妙仙子成为新的门主。
百年之后，魔教四大派系再次杀上了青云门，要一雪当年之耻。
这次四大门派的围攻，还牵连着青云门龙首峰首座苍松道人。当年苍松也是跟随万剑一杀入蛮荒圣殿的人，万剑一曾救过他，也是毫不藏私的传授修行经验，让他大是感激。后来，万剑一被青云门判死，苍松道人发誓要为他报仇，甚至不惜勾结魔教。
在大战开始之前，苍松道人已经率先发难。苍松先是以七尾蜈蚣暗算了道玄，又是捅了他一刀。再加上苍松道人本就是青云门除道玄之外最有权势的人，负责青云门的防卫，魔教四大门派在他的安排下，直接攻打到玉清殿才被发现。
这一次的魔教四大门派，推举了长生堂门主玉阳子为主事人。魔教百年积蓄的精锐基本全部参战，包括四大宗主、青龙、朱雀、百毒子等高手。
青云门的实力自然也不可小觑，还有天音寺高僧也在场。不过，大战还没开始，天音寺方丈普泓为首的僧人都被假扮焚香谷中人的魔教人暗算，只剩下了普空和法相少数几个没受伤的。
双方大战一爆发，就是无比惨烈。青云门七个首座除苍松背叛又战死了商正梁、天云，二十五个长老死了十四个，弟子更是死了一半还多。道玄强撑着重伤使用诛仙剑，才算击退了魔教，但还是让魔教众多高手逃了出去。
又因为碧瑶留在青云山，魔教四大门派再次杀了个回马枪。这一次，还是道玄强使诛仙剑，打退了四大门派。
这一战，青云门损失极其惨重。魔教也是折损了众多精英，尤其是长生堂高手几乎全军覆没，玉阳子也是断了一臂，自此长生堂无力与其他三大门派争雄。
这一战，也是诛仙中最为重要的一战。道玄的最后一剑劈向了张小凡，致使碧瑶以痴情咒为他挡死，也使得张小凡变成鬼王宗的鬼厉。
修罗鬼王攻打青云门
十年之后，魔教再次攻打青云门。
这一次之时，长生堂、万毒门、合欢派已经覆灭了。魔教四大门派只剩下了一个鬼王宗，而且青龙消失于南疆，幽姬离去，普通弟子也在毒蛇谷损失了一半。不过，此时的鬼王已经炼就四灵血阵，被修罗附体了。因此，这一次又是一场恐怖的灾难。
鬼王笼罩在一片巨大的红影红芒中，一路杀向青云门。这一路上，只要被鬼王红影笼罩的人，无论普通人还是修道者都变成了没有心智的活死人，供他驱使，足足有着十数万人。更厉害的是，四灵血阵能激发普通百姓十倍的潜能，修道士更是实力大增。
这一战，比兽妖之祸更恐怖。而青云门中的掌门道玄因入魔不知所踪，其余六脉首座只剩下了曾叔常和水月两个老一辈的首座。天音寺虽然前来青云山助阵，但在十万魔教大军的攻打下，正道覆灭在即，天下苍生危矣。
最后一刻，是领悟了四卷天书的张小凡握住诛仙剑，击败了拥有修罗之力的鬼王。至此，魔教基本覆灭，正道也是大伤元气。
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