来源:丁香学术

科学家发现,转运 RNA (tRNA) 能够决定信使 RNA(mRNA)在细胞中的寿命,导致某些 mRNA 被稳定保存并翻译成更多的蛋白质,而另一些 mRNA 则被降解,从而限制蛋白质的生成量。

在 COVID-19 疫情期间,因为 mRNA 的疫苗技术挽救了无数生命,所以让 mRNA 这个分子变得家喻户晓。人们逐渐认识到,这种将遗传信息转化为蛋白质的分子对生命过程的重要性。然而,除了决定合成哪些蛋白质外,mRNA 还能控制生成蛋白质的数量。

「了解这一调控机制至关重要,这不仅有助于我们弄清基因表达的控制原理,还可能为设计更优的 mRNA 治疗手段提供帮助,」 霍华德休斯医学研究所研究员(HHMI Investigator)Joshua Mendell 说道。「如果我们能够让 mRNA 以可编程的方式在细胞中维持特定时间,并产生理想的蛋白质数量,那么未来治疗方法的潜力将会更大。」 例如,疫苗 mRNA 需要长时间保持稳定,而基因编辑的 mRNA 则可能只需短暂存在即可完成任务。

2024 年 11 月 21 日,美国德州大学西南医学中心的 Joshua Mendell 实验室和 Jan Erzberger 实验室合作揭示了一种决定 mRNA 稳定性的全新机制。他们发现,翻译 mRNA 为蛋白质的过程可以显著影响 mRNA 的寿命,其中一个关键因素是氨基酸中的精氨酸。该研究成果或将为肥胖、癌症以及线粒体相关疾病提供新的治疗方向。这一发现发表在Science杂志上

(https://www.science.org/doi/10.1126/science.adq8587)。

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蛋白质的合成过程

为了合成蛋白质,细胞首先将 DNA 中的遗传信息转录为 mRNA,随后在核糖体中将其翻译为蛋白质。

在翻译过程中,核糖体沿着 mRNA 移动,不同的 tRNA 根据自身携带的三联体「反密码子」与 mRNA 中的互补「密码子」结合,同时携带相应的氨基酸。通过这种方式,tRNA 将氨基酸逐一运送到核糖体,以合成蛋白质。

当 tRNA 与 mRNA 结合后,会位于核糖体的三个特定位置:A 位、P 位和 E 位。tRNA 首先进入 A 位,随后在 P 位延长蛋白质链,最终移动到 E 位并离开核糖体。该循环反复进行,直到 mRNA 上的「终止」密码子指示翻译停止。

揭示新的 mRNA 降解机制

Mendell 团队早已知晓 mRNA 序列会影响其稳定性,但在哺乳动物细胞中的具体机制尚未明确。此前,酵母研究表明,当翻译减慢时,核糖体仅剩下一个位于 P 位的 tRNA,而 A 位和 E 位空置。此时,CCR4-NOT 复合物降解 mRNA,导致蛋白质的生成减少。「在酵母中,A 位密码子的缓慢解码对这一过程起关键作用,但在哺乳动物细胞中,我们意外地没有观察到类似现象,」朱晓强博士说。这一发现揭示了酵母与哺乳动物之间的关键生物学差异。朱博士现为 Joshua Mendell 实验室的博士后研究员,是该研究的第一作者。

尽管早期结果令人失望,朱博士随后发现 P 位 tRNA 的身份是关键。「核糖体翻译速度变慢时,CCR4-NOT 复合物会尝试插入核糖体的一部分,检测 P 位上的 tRNA 类型,」Mendell 解释道。

研究人员发现,携带特定精氨酸密码子的 mRNA 更容易与 CCR4-NOT 结合并被降解。「让人意外的是,精氨酸的六种密码子中,仅有三种在这一机制中表现突出,」Erzberger 指出。这表明不同的密码子可能导致 mRNA 被降解的速度存在差异。Jan Erzberger 实验室的研究科学家 Victor Cruz 的工作帮助阐明允许或阻止 CCR4-NOT 与核糖体结合所需的 tRNA 结构特性。

「这是一篇令人兴奋的论文,其中的观察结果非常令人惊讶,」 约翰霍普金斯大学霍华德休斯医学研究所研究员 Rachel Green(未参与此项研究)说道。「该系统的复杂性令人印象深刻。」 她补充道,这项研究解释了如何利用遗传密码和蛋白质合成的基本原理,以一种出乎意料且复杂的方式对 mRNA 进行协调调控。

新发现的调控机制被称为「P 位 tRNA 介导的 mRNA 降解(PTMD)」,它是线粒体的重要调控因子,而线粒体在代谢中起着关键作用。因此,这一发现可能为研究人员开发治疗肥胖的新疗法提供帮助。此外,线粒体还在癌症等多种疾病中发挥重要作用,该团队的研究见解可能对这些疾病研究产生深远影响。

PTMD 的发现打开了许多新的研究方向,团队计划进一步探索。Erzberger 表示,其他密码子可能对翻译产生类似的影响,而 Mendell 希望进一步研究 CCR4-NOT 与核糖体结合的调控细节及其生理作用。

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「这项工作真正表明,tRNA 还有一种额外的功能,它不仅能够解码 mRNA 并运送氨基酸,还能够在翻译过程中与其他复合物相互作用,以调控翻译的数量和 mRNA 的稳定性,」Mendell 说道。「这真的非常令人兴奋。」

参考文献:
Xiaoqiang Zhu, Victor Emmanuel Cruz, He Zhang, Jan P. Erzberger, Joshua T. Mendell. 「Specific tRNAs promote mRNA decay by recruiting the CCR4-NOT complex to translating ribosomes.」

Science (https://www.science.org/doi/10.1126/science.adq8587)

审核:朱晓强

正文部分转载自:

HHMI NEWS(https://www.hhmi.org/news)

图片来源:Science、图虫创意

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