运输及房屋局提交立法会的文件表示，港铁(00066)已就高铁香港段出现的问题，截至去年底，处理97宗申索，涉及逾10亿元，政府相信项目早前预留的54亿元应急费用，足以应付高铁总站北工程，因为地基及地盘平整工程施工期间，有未能预计的地质情况，出现申索开支。

文件指政府委托港铁兴建高铁段工程项目，高铁总站最南端部分的挖掘工程，已完成超过7成，但总站北工程遇上未能预计的地质情况，港铁正与承建商商讨可行措施，以恢复目标进度，希望不影响高铁工程的完工时间。

文件又指，去年底政府已批出超过448亿元的合约，截至3月底，累计开支已达过244亿元。