第二季打开数码世界大门紧接上一集太一他们回来，辅京织各回家。当天晚上一代立刻重聚商讨今天所发生的事，毕竟有人想统治数码世界、数码宝贝不能进化不是什么小事了。美美缺席，嘉儿提起美美在美国，前阵子还寄信过来担忧巴鲁兽，算是个不错的细节，虽然远在他乡，但心中依然牵挂着自己的搭档，也给美美一个合理的交代。阿助大哥有了新发型，大和还是那么帅气，素娜没有再戴以前的帽子。众人商议明天要去数码世界调查一番，阿和因乐团的事不便出行，阿助老哥因学业繁重（哈哈，你懂得）……

第二天放学后大家如约而至，二代也一同前往，正要动身前出现一位老熟人“藤山老师”。不知道各位有没有印象，他就是当年太一一行人参加夏令营的负责老师，跟太一的关系也很要好，如今成了电脑社的顾问，为了方便其他人前往只好借问问题名义支开他

进去以后辅京织的惊讶、相互调侃，素娜不禁发出感慨，其实虽然他们是被选召的孩子，但表现也是正常人该有的行为，并没有因为是“天选之子”就被设定得很高人一等。然后V仔他们赶过来，比丘兽、甲虫兽和素娜、光子郎重逢，看到这我心中感到无比欣慰，01大结局一代与搭档数码宝贝们依依不舍挥泪告别，终于在这里又重逢了。

暴龙改造者直接派出螳螂兽、钻地兽、毛人兽进行突袭，大辅和V仔双双被捉（好一对难兄难弟），其他人只好先战略转移，暴龙改造者也随后现身。

素娜她们逃来到一座金字塔遗迹，看到这猛然有种熟悉感，想到ds里放置七魔王之一贝尔菲兽封印的遗迹，不知道当时制作ds这段时是不是有参考。（当然，也可能是我想多了）

众人进去发现爱心装甲和知识装甲，素娜、光子郎跟太一一样拿不起装甲，之后小京、伊织轻松拿起（这里武嘉的惊讶，好有夫妻相～(￣▽￣～)~，虽然画面有点微崩），麻鹰兽、穿山兽也随之现身，期间用了bgm《勝利善のテーマ》，颇有新生命初生的意味。

麻鹰兽表示要与小京并肩作战，而小京却表现出退怯，虽然是被选召的孩子，但来到这个世界主要是受好奇心驱动，并没有什么特殊目的，面对这个未知世界，眼前这个未知生物，自己脑海是一片茫然的，为何而战？如何去战？让她不知所措。旁边的素娜见状后以过来人的身份开导小京，通过简单举了自己和美美的例子温和地告诉小京与数码宝贝一起冒险的珍贵，勉励小京（咳咳，片场时间不多，所以说得比较简要，可能没有你想得那么有说服力，大家自行体会理解就好），这里素娜简直就是个善解人意温柔端庄美丽的大姐姐哎。光子郎通过诱导式的方法询问伊织对数码世界世界的看法，试图激发他的好奇心和求知欲，告诉伊织随时可以向他求助，一同探索（光子郎也成一个热心且富有经验的学长）。这部分也体现出素娜、光子郎的成长，履行作为前辈该有的职责

在两个前辈的劝导、勉励下，小京、伊织终于鼓起干劲也给搭档数码兽致敬进……装甲进化！铁鹰兽、钢钻兽现身，然后大伙赶回去救大辅

路兽回归高冷模式单扛暴龙改造者，虫虫上前护驾被一拳打飞，虽说没有神圣尾戒力量大减，但怎么说也是成熟体，对付一个成长期还是绰绰有余。而虫虫与暴龙改造者的碰撞致使神圣计划飞落，后重归大辅手中。随后V仔也进化，烈焰兽他们与螳螂兽一伙展开1V1模式，还是不大费力地击碎了黑色魔轮使螳螂兽他们恢复正常

等他们重回学校已经是夜晚了，数码兽也跟着回来（额…迪路兽好像被压在下面了），而甲虫兽和比丘兽则决定留在数码世界以便及时为孩子们提供必要信息。