消毒：
天然水体和城市污水、工业废水中都含有大量病原微生物，消毒的目的就是将这些病原微生物杀灭。
次氯酸类消毒剂
次氯酸，一种氯元素的含氧酸，化学式为HClO，结构式H－O－Cl，其中氯元素的化合价为+1价，是氯元素的最低价含氧酸，但其氧化性在氯元素的含氧酸中极强，是氯元素含氧酸中氧化性第二强的酸。它仅存在于溶液中，浓溶液呈黄色，稀溶液无色，有非常刺鼻的、类似氯气的气味，而且极不稳定，是一种很弱的酸，比碳酸弱，和氢硫酸相当。次氯酸也有极强的漂白作用，它的盐类可用做漂白剂和消毒剂。
液氯是迄今为止最常用的方法，其特点是液氯成本低、工艺成熟、效果稳定可靠。
氯溴异氰尿酸能释放次溴酸(HOBr)和次氯酸(HOCL)，次溴酸的活性是次氯酸的四倍，有强烈的杀灭细菌、真菌的能力。
二氯异氰尿酸钠为白色粉末状或颗粒状的固体，是氧化性杀菌剂中杀菌中广谱、高水平、低毒、中等刺激性的消毒剂，也是氯代异氰尿酸类中的主导产品。
三氯异氰尿酸钠是一种极强的氧化剂和氯化剂，具有高效、广谱、较为安全的消毒作用，对细菌、病毒、真菌、芽孢等都有杀灭作用，对球虫卵囊也有一定杀灭作用。在相同的有效氯浓度下,三氯异氰尿酸的杀菌效果都比二氯异氰尿酸钠要好。
二氧化氯（ClO）是一种黄绿色到橙黄色的气体，是国际上公认为安全、无毒的绿色消毒剂。二氧化氯是净化饮用水的一种十分有效的净水剂，其中包括良好的除臭与脱色能力、低浓度下高效杀菌和杀病毒能力。二氧化氯用于水消毒，在其浓度为0.5～1mg/L时，1分钟内能将水中99%的细菌杀灭，灭菌效果为氯气的10倍，次氯酸钠的2倍，抑制病毒的能力也比氯高3倍，比臭氧高1.9倍。
非氯消毒剂
臭氧消毒 技术是1840年一位德国的化学家C.F.舍拜恩发明的消毒技术，于1856 年被用于水处理消毒行业。
活性氧（臭氧）灭菌消毒作用体现在它的强氧化性上，是全球公认的绿色广谱高效的消毒灭菌剂。广泛用于饮用水消毒，医疗卫生机构空气消毒，臭氧会在30-40分钟后自动还原成氧气，没有化学残留二次污染。
高铁酸钾是极好的氧化剂。具有高效的消毒作用，为一种新型非氯高效消毒剂。高铁酸钾已成为新型的绿色环保水处理材料。
高铁酸钾是含有FeO42-的一种化合物，其中心原子Fe以六价存在，无论在酸性条件，还是碱性条件下高铁酸盐都具有极强的氧化性，可以广泛用于水和废水的氧化、消毒、杀菌。因此，高铁酸盐是倍受关注的一类新型、高效、无毒的多功能水处理剂。在饮用水的处理过程中，集氧化、吸附、絮凝、沉淀、灭菌、消毒、脱色、除臭等八大特点为一体的综合性能，是其他水处理剂不可比拟的。K2FeO4对于废水中的BOD、COD、铅、镉、硫等具有良好的去除作用，可将水中三氯乙烯去除85.6%，萘的去除率达100%。用多功能的复合药剂强化与拓宽现行常规给水处理工艺的净水效能，可以不改变现有工艺流程，不增加大的附属设施，适合中国国情的饮用水消毒技术，具有广阔的研究开发前景，并可能成为消毒技术研究的一个主要方向。
物理消毒
紫外线杀菌消毒是利用适当波长的紫外线能够破坏微生物机体细胞中的DNA（脱氧核糖核酸）或RNA（核糖核酸）的分子结构，造成生长性细胞死亡和（或）再生性细胞死亡，达到杀菌消毒的效果。将水中各种细菌、病毒、寄生虫、水藻以及其他病原体直接杀死。
有处理后的水无残留的特点。
超声波消毒是指利用超声空化效应进行消毒杀菌的水处理技术。在一定功率的超声波的辐射作用下，水溶液发生超声空化效应，使得水分子裂解为OH、H等自由基，从而氧化水中的有机物，并进人细菌体内，达到杀菌消毒的功效
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