在我国2016年3月公布的“十三五”规划中,精准医疗被政府列为最重要的科技领域之一,并斥资数百亿支持精准医疗的相关研究。强有力的政策和资金的扶持,也使得以基因测序为基础的精准医疗迎来了快速发展,同时中国基因测序行业和技术也进入了快速发展的通道。

政府导向和技术的飞速发展给整个行业带来的最直观的影响是基因测序和应用的成本逐步下降、测序的研究/应用的场景更加丰富。而大量的、多维度的研究/应用就像一个放大镜,不仅放大了测序技术带来的好处,也放大了基因测序行业存在的“难题”。

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图1:行业难题示例图

为什么会产生这些难题?这跟一直以来的企业或机构自己购买设备、购买服务器、开发单一系统的习惯有关。事实上,这样不仅会耗费生信研究人员大量的精力,同时设备的升级、维护和折旧也会消耗巨大的成本,另外在面临突发的业务需求和急剧增加的数据量状况时,生信企业和机构也很难及时灵活应对。

对此,深圳市达仁基算科技有限公司凭借着多年来在云计算和生信分析等领域的经验,开发出了可面向生信和基因组领域作为完善解决方案的Atlas OS云操作系统,其内置的生信云分析App模块,从根本上解决了基因生信分析的成本高、效率低、流程多、运维难的问题。(打开http://dwz.date/czqD 查看Atlas OS生信云分析App操作视频。)

Atlas OS生信云分析App功能和优势

一、部署在云上,浏览器中即开即用(降低采购/运维成本>90%);

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图2:Atlas OS登录界面

Atlas OS云操作系统部署在云上,浏览器中即开即用,无需购置设备服务器,无需安装任何软件和插件,有电脑和网络的地方,都可以随时调动云端计算资源和生信分析App。

二、标准化分析流程,分析效率提升>70%(最快6分钟可完成一次分析);

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图3:生信云分析App分析流程界面

Atlas OS生信云分析App内置了7大领域、约60+种常见的生信和基因组标准分析流程,用户仅需“选择领域-选择项目-选择分析流程-添加样本数据”即可开始数据分析,中英文可视化界面,支持多个分析任务同时并行,大大提高了数据/样本处理与分析效率;

三、降低分析成本>70%(分析成本低至0.2元一次);

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图4:生信云分析App功能和费用示图(部分)

目前人工单次分析成本在百元甚至千元以上,Atlas OS生信云分析App单次(单样本/单任务)分析成本已经优化到零点几元到几十元不等(取决于分析应用的种类和输入数据的类型);

四、生成可视化结果报告,帮助快速理解分析结果;

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图5:生信云分析App结果展示图

五、支持用户自行开发分析流程:使用Atlas OS内置的分析App部署功能,用户可以自建分析流程,仅需一个人2-4天就能在Atlas OS上部署一个带图形界面的新分析应用。

六、内置“AWSLinux + BioConda”和“AWS Linux + RStudio + BioConda”生信云主机,帮助开发生信分析流程需求的生信科研机构、生物企业和高校,快速搭建测试环境和以及培训环境。

通过以上介绍可以看出,相较传统的自购设备、服务器、开发单一系统的方式,Atlas OS生信云分析App不仅可以大大降低生信企业和机构的采购、人力成本,还能通过60+种标准化分析流程满足用户快速、高效分析的需要(未来还将陆续发布更多分析App)。Atlas OS内置的分析流程开发功能,更能让用户快速部署和使用一个新分析应用。同时,AtlasOS直接提供用户在浏览器中立即可用的生信云主机,能更好地满足日常科研工作中复杂多变的生信项目的需求。

不仅如此,生信云分析App作为Atlas OS云操作系统的一个功能模块,还能与Atlas OS 自有的文件系统、加密模块、团队管理、云主机等功能深度配合使用,助力生信企业和机构快速上云。

即日起,Atlas OS生信云分析App诚邀用户使用,如果您有相关需求欢迎登录atlas.daren.io免费试用,或联系达仁基算团队ddeng@daren.io了解更多。心动不如行动喔~