引言

我们知道,目前上市的大部分小分子药物都靶向蛋白质靶点,但蛋白靶向药物的研究一直受到目标蛋白”不可成药“或者”难成药“的掣肘。在这种情况下,不少研究者开始把目光转向了广阔的RNA领域。有观点认为,RNA靶向药有望成为继小分子药物、抗体药物之后新药的第三次浪潮。

“可转录的RNA比翻译的蛋白质更多,包括非编码RNA都可能是新靶点。"专注靶向RNA疗法领域的公司Arrakis的创始人兼CSO Jennifer Petter曾说。非编码RNA在人类基因组中占比高达70%,这为开发新型疗法带来了巨大的机遇。

无论未来发展如何,mRNA技术凭借着疫苗的东风已经进入大众视野。而靶向RNA小分子药物的研发,也并非没有可喜的开端。全球第一款上市的靶向RNA的小分子药物Evrysdi(Risdiplam),由PTC Therapeutics、非营利组织SMA Foundation 和Roche三方联合开发,于2020年8月获FDA批准。Evrysdi是一款治疗脊髓性肌萎缩症(SMA)的药物,是全球第一个被批准作为RNA剪接修饰的小分子制剂。

随着RNA靶向药物的兴起,相应的技术开发也引起了研究人员的关注。

目前的研究发现,存在多种类型的RNA(包括mRNA、miRNA和长链非编码RNA等)与各种疾病的发病机制有关。过去,研究人员常使用反义寡核苷酸 (ASO) 和小干扰 RNA (siRNA) 来靶向降解 RNA,虽然这类药物目前也有在临床上使用的案例(例如Patisiran、Inotersen、Nusinersen等),但不可忽视它们仍然存在细胞摄取差、组织特异性递送低(肝和肾除外)、内体逃逸差以及在某些情况下特异性毒性的问题。因此,开发可以靶向RNA又不受寡核苷酸疗法限制的新方法,是未来开发靶向RNA药物的重中之重。

RIBOTACs

近期,来自Scripps研究所的研究团队在Journal of the American Chemical Society上发表了一项最新研究。该团队利用一种被称为核糖核酸酶靶向嵌合体(RIBOTAC)的小分子药物技术,将一款酪氨酸激酶抑制剂改造成了靶向RNA的小分子降解剂,并在动物试验中取得了抑制了肿瘤增长的成果。

但这项技术并不是Scripps研究所团队的首创。2018年,美国斯克里普斯研究所的Matthew D. Disney及其团队开发出一种基于小分子的工具,这种方法作用于RNA上,可以选择性地剔除某些基因产物。相关研究结果于2018年5月24日在线发表在Journal of the American Chemical Society,论文标题为“Small Molecule Targeted Recruitment of a Nuclease to RNA”。

这项技术的创新之处在于将一种经设计后能够特异性结合RNA的分子,与常见的RNA降解酶结合在一起,这种小分子/酶复合物结合目标RNA后,就可以通过正常的RNA酶的降解作用将RNA降解。Disney将这种技术命名为RIBOTAC,即“核糖核酸酶靶向嵌合体(ribonuclease-targeting chimeras)”的缩写。听起来是不是很耳熟?是的,该技术的原理与PROTAC类似,连命名也是一脉相承接。PROTAC利用的是泛素-蛋白酶体系统(Ubiquitin-Proteasome System, UPS)对靶蛋白进行降解。PROTAC分子一端与靶蛋白结合,另一端与E3连接酶结合形成三元复合物,使靶蛋白泛素化,之后被细胞内的蛋白酶体降解。而解离的PROTAC 分子可以继续结合下一个靶蛋白。

和靶向蛋白药物面临的问题一样,基于RNA结构的靶向技术有其局限性,因为并不是所有的分子结构都是功能性的,即使筛选出一种可结合的小分子,也可能不会产生任何生物效应。RIBOTAC和PROTAC都在这方面解决了靶向RNA/蛋白药物开发的难题,靶向嵌合体与目标RNA/蛋白结合的一端仅仅只需要对靶点做一个标记,降解目标RNA/蛋白分子的步骤,将由招募的RNase/蛋白酶体来完成。因此利用RIBOTAC和PROTAC开发的靶向药物,不再要求小分子结合目标的功能位点。

RIBOTAC利用细胞内源性的核酸降解机制局部消除目标RNA,而不是简单地进行结合和抑制,对于遗传性疾病的治疗有更大的改善作用。

(PROTAC和RIBOTAC的机制对比 图源:[2])

RIBOTAC技术对于未来开发靶向RNA疗法和需要调控RNA的实验研究都很有意义。

文献来源:

[1] Reprogramming of Protein-TargetedSmall-Molecule Medicines to RNA by Ribonuclease Recruitment. J. Am. Chem. Soc. | https://doi.org/10.1021/jacs.1c02248

[2] RIBOTACs: Small Molecules Target RNA for Degradation. Cell Chemical Biology | https://doi.org/10.1016/j.chembiol.2019.07.015

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