在2023年12月8-10日的“2023羊业发展高级研讨会”上,中国农业大学动物科技学院韩红兵团队、天津奥群牧业有限公司、华智生物技术有限公司联合发布了绵羊40K液相育种芯片——“白泽一号”。该芯片覆盖了澳洲白、杜泊羊、湖羊和东弗里升羊等主流种用绵羊品种,包含了40000多个高质量SNP位点,可在绵羊遗传多样性评估、遗传图谱构建及基因定位、种质资源鉴定、亲缘鉴定、全基因组关联分析、全基因组选择等不同场景中深度应用,开展重要经济性状改良,加速绵羊育种进程。

1、降低全基因组选择育种成本

2、提高品种改良育种效率

3、精准鉴定种质资源潜力和品种亲缘关系

4、应用的绵羊品种广泛,包括澳洲白、杜泊羊、湖羊和东弗里升羊等品种

1、位点多态性好、基因组分布均匀

通过对多样性丰富的主流种用绵羊品种进行全基因组重测序,筛选获得高多态SNP位点20,730个,平均MAF值为0.37;挖掘整合遗传效应显著位点和品种特异位点20,381个,共同构成绵羊40KcGPS液相育种芯片;位点均匀分布于染色体(见图1)。

图1 绵羊40KcGPS液相育种芯片SNP标记在染色体上的分布

2、功能位点及品种特异性位点丰富

芯片包含澳洲白、杜泊羊、湖羊和东弗里升羊等品种特异性位点,涵盖生长、肉质、繁殖、体型、毛发、抗病、屠宰、产奶等多类功能分子标记位点20,381个(见图2),可进行生长、肉质和抗病等重要性状基因的挖掘利用。

图2 绵羊40KcGPS液相育种芯片功能位点统计

1、绵羊遗传多样性评估

2、种质资源和亲缘关系鉴定

3、分子设计育种

4、遗传图谱构建及基因定位

5、全基因组关联分析

6、全基因组选择

1、中国农业大学动物科学技术学院韩红兵团队

中国农业大学动物科学技术学院韩红兵团队长期以来从事羊遗传育种研究。主要围绕羊生长、抗病等重要经济性状功能基因挖掘,基因编辑与基因组育种技术,以及肉羊品种培育开展研究工作,在eLife、Microbiome、Commun Biol等权威杂志发表SCI论文60余篇,授权发明专利14件。

2、天津奥群牧业有限公司

天津奥群牧业有限公司是国家高新技术企业,国家种业阵型企业,多年来,深耕于肉羊育种领域,潜心服务于中国“种业振兴”伟大战略,倾力打造中国未来羊业“芯片”。

3、华智生物技术有限公司

华智生物是在农业农村部倡导以及国家发改委、科技部、湖南省等相关部省委支持下,由中信农业、隆平高科等十余家龙头种企和专业机构共同组建的、我国领先的第三方生物种业关键共性技术平台和国家级分子育种创新服务平台,入选国家农作物、畜禽、水产三大类种业阵型专业化平台企业和首批20家种业打假维权种子检测机构推荐名单。

华智生物融合生物技术(BT)与数据技术(DT),为客户提供基因型鉴定、种质资源鉴定评价、性状基因创制挖掘鉴定、生物信息分析、种质创新创制、分子和智能育种、生物智能大数据管理和应用、品种测试评价、种子质量/土壤环境/农产品安全检验检测、生物技术法规服务等全链条、一站式综合解决方案。华智生物的产品和技术服务贯穿种业全产业链,覆盖了农作物、畜禽、水产、果蔬、林木、花草、中药材、微生物等200多个物种领域,每年为近800家单位和团队提供服务,年完成服务合同1,000余份,年检测样品超过100万份。