凡纳滨对虾因其经济价值高、适应范围广、抗病力强等特点，目前是我国乃至世界范围内养殖最广泛的甲壳类动物。过去二十年多的时间里，我国研究人员采用传统选育手段，使凡纳滨对虾遗传改良取得显著成效。然而，基于传统育种方法的遗传改良存在选育周期长、选育成本高和选择准确性低等问题。因此，引进新的选育手段对加快凡纳滨对虾遗传改良进程具有重要意义。

中国科学院海洋研究所与华智生物技术有限公司合作，利用华智生物自主研发的cGPS（Genotyping byPinpointSequencing ofcaptured targets）靶向测序分型技术，开发了凡纳滨对虾10KcGPS液相育种芯片“中科芯2号”。该芯片兼具遗传检测和病原检测的优势，可用于凡纳滨对虾的性别鉴定、种质资源遗传多样性评估和亲缘关系鉴定、基因定位及挖掘鉴定、全基因组关联分析、分子辅助选择、全基因组选择育种等多个应用场景。

1、位点多态性高、基因组分布好

基于中国科学院海洋研究所相建海、李富花团队多年精心研发的南美白对虾基因组数据和600K高密度SNP芯片分型结果，从中优选获得10K高多态性SNP位点，位点基因组覆盖度和分布好，高重组交换区域和重要经济性状区域标记密度高（图1）。

2、性状基因关联位点丰富

该芯片含有对虾生长、性别、AHPND抗性、耐高盐等重要经济性状关联分子标记和9种主要病原的检测标记，可以在进行遗传检测的同时完成主要病原体的检测。

3、产品技术参数优良

经样本测试，芯片位点检出率高，平均检出率>99.2%（图2）；芯片稳定性好，重复样本基因型一致率>99.7%（图3），产品整体性能优良。

1.凡纳滨对虾种质资源和品种鉴定评估等（图4、图5）

2.凡纳滨对虾遗传图谱构建、基因定位以及全基因组关联分析

3.凡纳滨对虾分子标记辅助选择、全基因组选择育种等

4.凡纳滨对虾重要性状基因的挖掘鉴定和功能解析等

1、中国科学院海洋研究所李富花团队

研究团队聚焦于虾类基因组学和遗传育种研究，在国际上首次破译了凡纳滨对虾和中国明对虾基因组图谱，建立了国际首个凡纳滨对虾600K高密度SNP固相芯片和高密度遗传连锁图谱，鉴定了对虾性别、生长、抗性性状关键基因和标记，建立了对虾全基因组选择育种技术。通过产学研结合培育出凡纳滨对虾“科海1号”、“广泰1号”和“渤海1号”3个对虾新品种，并已在辽宁、天津、河北、山东、江苏等地推广养殖，经济和社会效益显著；培育出富含虾青素的脊尾白虾国审新品种“科苏红1号”，展示了很好的应用前景。

团队在Nature Communication、PLoS Biology等高水平期刊发表SCI收录论文200余篇；获国家发明专利授权30余项，国际PCT专利授权2项，研究成果获得大北农科技奖、山东省科技进步奖一等奖、山东省自然科学奖二等奖等省部级奖励5项。

2、华智生物技术有限公司

华智生物是在农业农村部倡导以及国家发改委、科技部、湖南省等相关部省委支持下，由中信农业、隆平高科等十余家龙头种企和专业机构共同组建的、我国领先的第三方生物种业关键共性技术平台和国家级分子育种创新服务平台，入选国家农作物、畜禽、水产三大类种业阵型专业化平台企业和首批20家种业打假维权种子检测机构推荐名单。

华智生物融合生物技术(BT)与数据技术(DT)，为客户提供基因型鉴定、种质资源鉴定评价、性状基因创制挖掘鉴定、生物信息分析、种质创新创制、分子和智能育种、生物智能大数据管理和应用、品种测试评价、种子质量/土壤环境/农产品安全检验检测、生物技术法规服务等全链条、一站式综合解决方案。华智生物的产品和技术服务贯穿种业全产业链，覆盖了农作物、畜禽、水产、果蔬、林木、花草、中药材、微生物等200多个物种领域，每年为800余家单位和团队提供服务，年完成服务合同1,000余份，年检测样品超过100万份。

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