瑞士洛桑联邦理工学院领导的团队创建了一个基于AI的工具RENAISSANCE,其可结合各种类型的细胞数据,准确描述细胞代谢状态,从而帮助人们更精准地理解细胞功能。RENAISSANCE是计算生物学的一项重大进步,为健康研究和生物技术创新开辟了新途径。
现代生物学生成了有关各种细胞活动的大量数据集。这些数据集提供了对不同细胞功能的洞察,例如基因活动和蛋白质水平。然而,如何整合和理解这些数据集以了解细胞代谢,一直是一项高难度挑战。
动力学模型通过对细胞代谢的数学表达,提供了一种解读复杂数据的新方法。它们可充当详细的地图,描述分子在细胞内如何相互作用和转化,以及物质如何随着时间的推移转化为能量和其他产物。
此次团队利用RENAISSANCE创建了准确反映大肠杆菌代谢行为的动力学模型。该工具成功生成了与实验观察到的代谢行为相匹配的模型,模拟了细菌在生物反应器中如何随时间调整其代谢。
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