关于转基因食品潜在风险的相关说法，目前仅在民间外行间存在一定争议，不过众多科学研究和权威机构观点表明，经严格安全评价获批上市的转基因食品是安全的，自媒体营销号所说的潜在风险多为没有科学依据的谣言。具体如下：
- 关于过敏反应：转基因技术会对转入基因进行严格筛选，确保其表达的蛋白质不会引发过敏。而且在安全评估中，也会专门进行致敏性评估，所以不存在因转基因而增加过敏风险的情况。 - 关于营养成分改变：转基因食品的营养成分与传统食品基本相同，不会因转基因技术而发生显著改变。 - 关于抗生素耐药性风险：现在转基因技术已尽量避免使用抗生素抗性基因，即使有少量存在，在人体消化道中也会被降解，不会导致人体产生抗生素耐药性。 - 关于长期健康影响：全球数十亿人长期食用转基因食品，流行病学数据显示，癌症、不育症等疾病的发生率并未因转基因食品消费而上升。美国三大科学院2016年发布报告称，转基因食品与癌症、胃肠道疾病等无直接关联。欧盟委员会整合500个独立研究组25年的研究成果，得出“转基因技术不比常规种植更有风险”的结论。