洪武二十六年(1393年)， 朱元璋为加强集权借口凉国公蓝玉欲图谋反，大肆株连杀戮功臣名将的重大政治案件。因蓝玉案被株连杀戮者逾1.5万。朱元璋以蓝玉案为契机，不仅诛杀蓝玉一门，连傅友德、冯胜、王弼等公侯在内，一律牵连。说朱元璋通过“胡惟庸案”，如愿以偿地铲除了相权，那么通过“蓝玉案”，他又消除了如芒在背的“将权”，把能征善战的将领基本上都杀光了。以至于后来燕王朱棣造反时，朱元璋的继任者——建文帝朱允炆无将可用，只能用了个纨绔子弟李景隆，引来了灭顶之灾。从这点上说，朱元璋是“聪明反被聪明误”，他把能伤人的利器都毁了，可当强敌来时，朝廷再无可用的利器御敌，真是呜呼哀哉。

蓝玉是安徽定远人，开平王常遇春的妻弟、常遇春是太子朱标的岳父，蓝玉是太子妃舅父,因极力维护太子的储君地位 ,与早已觊觎皇位的燕王交恶。当初隶属于常遇春的帐下，对敌作战勇敢，是个常胜将军。常遇春多次在朱元璋面前称赞他。他跟着朱元璋打天下的时候，年龄比较小，但智勇双全，能征善战，屡立战功，深受朱元璋和名将常遇春的喜爱，常遇春还娶了蓝玉的姐姐。明朝建立后，年长成熟的蓝玉更加出众。他跟随征西将军傅友德出征四川，攻克锦里（今成都）；在朱元璋组织的第二次北伐中，他作为先锋官，击败北元名将王保保；他率军攻占兴和（今河北张北），俘获元国公；他与沐英一起剿灭西蕃叛乱，巩固了明朝边防。因为功劳大，蓝玉在1379年被朱元璋封为永昌侯。1381年，蓝玉、沐英跟随征南将军傅友德征讨云南，将盘踞云南的残元势力彻底消灭，平定了云南全境，蓝玉在此战中功劳最大。

后来邓愈、李文忠、徐达等名将陆续去世，蓝玉的军事实力得到体现，在明朝武将中的地位和作用更加突出。在1387年，他被任命为征虏左副将军，跟随大将军冯胜北征，一举擒获北元实力派人物——太尉纳哈出，并使其属下全部归附。冯胜在此期间获罪，蓝玉升任大将军，俨然成为军界第一人。1388年，蓝玉率领15万大军北伐，他找了蒙古人当向导，出其不意地直捣北元朝廷老巢，北元皇帝脱古思帖儿仓皇出逃，途中被手下所杀，其次子地保奴及北元亲贵、朝廷官员近3000人被俘，北元的官员体系被摧毁，北元残余势力遭受了毁灭性打击。这一战使得蓝玉声名远扬，获得朝廷的赞赏。

蓝玉的战功赫赫，朱元璋封其为凉国公，让自己的儿子——蜀王朱椿娶了蓝玉的女儿为正妃，蓝玉的外甥女（蓝玉姐姐蓝氏和常遇春的女儿）还是太子朱标的正妃。这样一来，蓝玉不仅是一位手握兵权的将军，又是一位皇亲国戚，这时的蓝玉可是风光无限。渐渐的变得飞扬跋扈，目中无人，同时也做了许多伤天害理的事。

蓝玉渐渐地骄傲自满，畜养了很多庄奴，这些人都仗着蓝玉的威势暴虐凶横。蓝玉曾经抢占了东昌的民田，御史查究追问此事，蓝玉大怒，赶走了御史。

蓝玉北征元军回来时，半夜敲击喜峰关关门，关吏没有及时开门接纳，蓝玉纵容士兵打破关门长驱直入。太祖听说这件事很不高兴。

他俘虏了元主的妃子，竟敢将其强暴，致使元妃羞愧自杀；他当了太子太傅，仍嫌官小，狂傲地说“我难道不能做太师吗！”这一系列的恶行让朱元璋心生不悦，但一直没有动他。

朱元璋为他的儿子朱标留了当时明朝超一流的武人集团班底，作为儿子继承大统彻底清除北元的主力兵团，这是第一步。心慕汉高唐太的他需要一个让王朝雄视六合、让子孙福奕万代的都城，这是第二步。以朱标为姻亲枢纽，以常、蓝为首的武人集团配合关中地区的天险地利可以对岭北产生巨大的威胁，而且有黄河护卫没有北京必须时刻囤积重兵的弊端。而北京因为地理位置以及漕运之利依然会是攘夷藩王坐镇的军事巨镇，与关中新都齿矣。奈何太子朱标壮年而逝，白发人送黑发人，年近七十的朱元璋受到沉重的打击，再也没有精力和心情考虑迁都的事情。

年迈的朱元璋伤心之余，心态发生了很大变化，他十分担心孙子朱允炆不能驾驭蓝玉、冯胜、傅友德这样的骄帅悍将，于是杀心顿起。其实纵观历史，在帝王手下任职的，只有像徐达、汤和、邓愈这样很听话、很小心、很低调的人，才可能得以善终。而像蓝玉傲慢，放纵不知收敛的能臣即使能力再强，也不得善终。

次年，也就是1393年，朱标去世后的第二年，蓝玉就被人告发谋反。下狱审讯后，蓝玉招供，还供出了一大串同盟者。

蓝玉至少犯了三大罪:第一，骄横跋扈，不仅炮轰喜峰关，而且还和元妃有染。第二，目无法纪，蓝玉的义子多达几百人，蓝玉的家人不仅侵占民田，滥杀无辜，而且蓝玉还屡放厥词，认为朱元璋给他的封赏太低了。第三，意图谋反，锦衣卫指挥蒋瓛找到了蓝玉谋反的证据。

朱元璋以谋反罪将蓝玉剥皮实草，诛灭三族，并大兴株连，诛杀了1万5 千多人，将他认为有威胁的文臣武将屠戮一空。其实，像胡惟庸、李善长、蓝玉等人，按照明朝律令，确实有被惩处的理由，但朱元璋不该搞株连、搞“扩大化”，滥杀无辜之人，把一个近似“空心化”的朝堂交给了朱允炆。从某种程度上说，“胡惟庸案”“蓝玉案”的最大受益者是后来造反成功的朱棣。