公元1259年元宪宗蒙哥汗去世，忽必烈在与自己的亲弟弟阿里不哥经过了长达4年多的汗位争夺战后，终于在1264年战胜阿里不哥，取得政权。

忽必烈政权初期，在以“潘府旧臣”为主体的儒臣的帮助下，实行了卓有成效的汉化政策，逐步稳定政权，初步奠定了立国规模法度。具体表现在：像汉人朝庭一样：建元表岁、改元“中统”依照中国传统的制度设立中书省重用儒臣，地方也多任命汉人官员。还根据汉臣的建议，建立起一支不分蒙古人还是汉人的混编军队，还任命了一些握有兵权的汉人的军将：史天泽、廉希宪等。

·由此可以看出，忽必烈政权之初对汉族士大夫还是比较重用和信任的。

然而，随着忽必烈的政权越来越稳固，“中统三年”李璮的举兵叛变，让忽必烈对汉人不信任感越发的明显起来，也渐渐体现在他之后的用人政策中。他先是罢地方诸侯，收汉人军将兵权，重用色目贵族以牵制汉人。

然而这些措施，都对元王朝中央集权政治建立的中后期，蒙古、色目贵族与汉族官僚之间矛盾的发展，产生了重大影响。

李璮本是当时益都地方豪强李全的养子，李全去世后，他承袭其养父亲的职位，成为益都行省，也就是今天的山东省， 北宋被金灭了后，这片地盘就归了金，后来成吉思汗打败了金，这片地盘就分封给他的第三个儿子窝阔台，窝阔台继承汗位后，就又把这片地盘分封给成吉思汗的幼弟铁木格斡赤斤。李璮为了巩固和加强自己辖境的实际统治权，主动向蒙古投降纳贡示好，并且娶了铁木格斡赤斤后王塔察儿的妹妹为妻，在蒙古势力最强盛的时期，通过政治联姻方式与黄金家族中“东诸侯”之长缔结起“肱脾相依”的关系。

然而李璮呢，虽然向蒙古国称臣并与黄金家族结为姻亲，却不愿意听从蒙古国的调派。当时益都地处蒙宋对峙的战略要冲，却经常被李璮利用来扩充自己的军事势力。

《元史·李璮传》记载：李璮“恫疑虚喝，挟敌国以要朝廷，而自为完缮益兵计”

到了蒙哥汗时期，蒙哥几次向李璮征调兵力，李璮都只请罪不出兵，而他自己却趁蒙宋对峙私自出兵，直逼淮南东路攻打南宋，攻占了海州。攻下海州后，他又向蒙古朝庭称臣索要军饷，哪怕当时运输不便成本高到“十之损七八“也在所不惜。

再后来，蒙哥汗死于攻打南宋的前线战场上，黄金家族内部随即爆发了忽必烈、阿里不哥兄弟争夺汗位的战争。

1260年，忽必烈北征，''群臣躬履牧圉''。李璮的益都有精兵七、八万，他却以御宋为由不发一兵一卒跟随忽必烈。忽必烈听从汉人士大夫的建议，为了稳定李璮，加封他为江淮大都督，并对他的上述活动隐忍不发，只是明旨告诉他：现在需要集中火力对付阿里不哥，对宋采取和平策略，不许在边境挑衅。

此事开始，李璮违抗忽必烈的态度就越发明显起来。他在忽必烈明令不得挑衅宋边境的时候多次带兵侵宋；还在忽必烈派出使团与宋议和的时候，暗中加以破坏，导致使团被宋扣押。

1261年十月，忽必烈再次北征阿里不哥。李璮趁这个机会联络各方诸侯策动叛乱。不料十二月忽必烈却又忽然回朝。如箭在弦上的李璮不得已在没有充分时间准备的情况下，杀境内的蒙古士兵并献两座城池给宋，公开反叛。

忽必烈对李李璮的反叛虽然生气却并不惊讶，迅速派出十七路大军，以速战速决的方式解决李璮。

而此时的李璮本以为，他一反叛，华北的汉人世族也会趁机起来反抗蒙古人。令李璮没有想到的是，并没有汉人世族响应他，甚至还有很多的世族会跟蒙古人一起攻打他。

独军奋战的李璮区区几万兵力，怎么可能是曾经纵横西域的蒙古铁骑的对手。同年五月中旬，蒙古军将济南城层层包围，李璮深陷孤城，不得复出。七月下旬李璮就被蒙古军活捉。随后就被处死。

李璮之乱虽然被平息，益都之地也复归蒙古人所有，但李璮之乱对以后元朝的影响却非常深远。

事后忽必烈以：惩青、徐之乱“为由下诏实施了一系列削弱汉人世族势力的举措。比如：汉人不能担任重要官职更不能有军职。有官职的汉人去世后，子孙不得承袭父职。传说元朝时期的汉人分四等也是从这时候开始的。

这些举措一直延续至元朝灭亡。