做实验好比做菜,可以按照protocol做,但是不同人做出来的味道是不一样的。根据protocol,每个步骤可以酌情改变。做菜的protocol可以百度,实验却不行(容易被带到沟里)。到哪里去找靠谱的protocol呢?
Protocol Exchange
https://www.nature.com/protocolexchange
Protocol Exchange是Nature Protocols打造的开放平台,包括生物化学、微生物、植物学、医学、分析化学等35个领域。
进入Browse版块,可输入关键词或主题搜索protocol,在页面左侧可根据研究领域、实验室、相关期刊、日期等筛选结果。
点击某一protocol,可查看reagents,procedure等相关内容,print按钮可保存为PDF文件或直接使用DOI号下载。
Bio-protocol
https://cn.bio-protocol.org/cn/default.aspx
Bio-protocol是一个开放获取的平台,该平台的实验方案均经过已发表科研论文的验证。
可根据研究主题搜索关键词,如DNA与蛋白互作:DNA-protein,返回EMSA、CHIP等方法。
该平台对初学者很友好,可使用中文检索。
Morimoto laboratory
http://groups.molbiosci.northwestern.edu/morimoto/
Morimoto laboratory是美国西北大学 Morimoto 实验室创建的分享平台, 除了展示实验室的成就,还有许多经过实践检验的protocol和技术工具。
Current Protocols
https://currentprotocols.onlinelibrary.wiley.com/
Current Protocols涉及分子生物学、生物医学、生物化学、农业等19个学科,其中17个学科保持更新。每个实验室指南保存不同阶段的实验记录,每年更新4次,每个实验室指南每年至少更新500页内容,以保证各个指南都能跟上各自领域的最新发展。
实验指南不仅有材料清单,还有一些实用的tips和图表(有的地方还有视频),帮助用户设计并实施实验。每一篇文章里还有很多讨论,例如Critical Parameters(实验的关键部分)、Troubleshooting(如何解决实验无效的问题)、Anticipated Results(实验顺利的情况下能得到的结果)。
但是Current Protocols是收费的。遇到想要下载的protocol可以先用sci-hub试试。还有一些高校可能会开通Current Protocols。
类似的网站还有:Springer Protocols,Cold Spring Harbor Protocols,Nucleic Acids Research Methods,Biotechniques等,其搜索方式与查找文献类似。
JoVE
https://www.jove.com/
JoVE( Journal of Visualized Experiments),该网站是专门收集实验操作和视频的学术网站。视频由专业技术人员录制,每一步实验都有关键提醒,PDF文件也可以下载。
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