γ-变形菌纲—着色菌目

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γ-变形菌纲

着色菌目

着色菌目（学名：Chromatiales）是变形菌门下的一类能够进行光合作用的细菌，也被称为紫硫菌（purple sulfur bacteria）。着色菌目的细菌是厌氧生物，常生活在硫磺泉或静水中。绿色植物和藻类行光合作用时会将水作为还原剂，使水被氧化成氧气，紫硫菌则是将硫化氢氧化成颗粒状的硫，再被氧化为硫酸。

着色菌目分两个科：着色菌科和外硫红螺菌科，其区分在于它们是内部还是外部产生硫颗粒，此外其内部的膜也有区别。盐硫杆状菌科也属于着色菌目，它只有一个属，而且不能进行光合作用。

着色菌目细菌一般生存在湖泊有光的无氧区域或者硫化氢聚集的水域，比如在硫磺泉，在这些地质化学和生物导致的硫化氢环境中着色菌目甚至会大量繁殖，导致水变色。着色菌目必须需要无氧环境来进行光合作用。在有氧环境下它们无法生存。

最容易产生着色菌目细菌的湖泊是分层湖。这些湖泊的下层有比较重的水（一般盐水），表面水比较轻（淡水）。假如在周围土壤中有足够硫酸盐渗透进入无氧水层的话这里可能形成密集的着色菌目细菌层，一般它们与绿色的光合作用的细菌混在一起。

下属科：

着色菌科（Chromatiaceae）

外硫红螺旋菌科（Ectothiorhodospiraceae）

颗粒状球菌科（Granulosicoccaceae）

盐硫杆状菌科（Halothiobacillaceae）

1.着色菌科

着色菌科（着色杆菌科、Chromatiaceae），是着色菌目的一科光合细菌。有12个属，其中有8个属是19世纪就描述过的，是人们认识最早的一类光合细菌。细胞有球形、卵形、杆状、弧形或螺旋形。

（1）可变杆菌属

可变杆菌属 （Amoebobacter），是光合细菌下的着色杆菌科的一种革兰氏阴性菌。单个细胞圆形。生长于含硫化氢的池塘和湖泊的泥及静止水体中；在含有可降解有机物的废水氧化塘中可与桃红荚硫菌一起成为水华的主体菌。

该属的模式种也是惟一种为玫瑰色可变杆菌（Amoebobacterroseus）。

（2）着色菌属

着色菌属（Chromatium）也称红硫菌属，是光合细菌下的着色杆菌科的一种革兰氏阴性菌。细胞呈杆形或卵圆形，直或稍弯。

形态描述：杆形或孵圆形，直或稍弯曲，末端圆。二分分裂，极生鞭毛单个或多个。单个或成对存在，或者粘连在一起形成块状物。革兰氏阴性。光合色素为细菌叶绿素a和1～4群类胡萝卜素，位于囊泡状光合内膜上。不含有气泡。

生存条件：厌氧条件下，所有的种都能以硫化氢或硫元素作为电子供体进行光能化能自养生长；元素硫作为中间氧化产物以高折光性硫粒形式储存在细胞内。硫酸盐是最终氧化产物。分子氢也可能用作电子供体。所有种都可能同化一些简单的有机化合物进行混养生长；醋酸盐或丙酮酸盐使用最广。中温菌，最佳生长温度范围20～40℃。

该属的模式种为奥氏着色菌（Chromatiumokenii）。

（3）闪杆菌属

闪杆菌属（Lamprobacter），是光合细菌下的着色杆菌科的一属革兰氏阴性菌。细胞杆形或卵圆。该属的模式种也是惟一种为嗜中盐闪杆菌（Lamprobacter modestohalophilus）。

（4）闪囊菌属

闪囊菌属（Lamprocystis），是光合细菌下的着色杆菌科的一种革兰氏阴性菌。细胞圆形至卵圆形。生长于含硫化氢的池塘和湖泊的泥及静止水体中；是淡水湖含硫化氢的均温层中最常见的浮游菌。该属的模式种为桃红色闪囊菌（Lamprocystis roseopersicina）。

（5）杆状色菌属

杆状色菌属（Rhabdochromatium），是光合细菌下的着色杆菌科的一属细菌。 大多数细胞为长而直的杆形，也可以见到稍有弯曲的细胞。生长于含硫化氢的池塘和湖泊的泥及静止水体中；是淡水湖含硫化氢的均温层中较常见的浮游菌。

该属的模式种也是惟一种为海洋杆状色菌(Rhabdochromatium marinum)。

（6）荚硫菌属

荚硫菌属（Thiocapsa），是光合细菌下的着色杆菌科的一种革兰氏阴性菌。细胞呈圆形或稍呈卵圆形。

该属的模式种为桃红荚硫菌（Thiocapsaroseopersicina）。

（7）囊硫菌属

囊硫菌属（Thiocystis），是光合细菌下的着色杆菌科的一种革兰氏阴性菌。细胞呈圆形或稍呈卵圆形。生长于淡水、咸水或海洋环境中的水体及其泥样。

该属的模式种为紫囊硫菌（Thiocystisviolacea）。

（8）网硫菌属

网硫菌属（Thiodictyon），是光合细菌下的着色杆菌科的一种革兰氏阴性菌。单个细胞杆形，末端圆形，有时呈锭子状。生长于含硫化氢的池塘和湖泊的泥及静止水体中，是淡水湖含硫化氢的均温层中较常见的浮游菌。

该属的模式种也是惟一种为美网硫菌（Thiodictyonelegans）。

（9）板硫菌属

板硫菌属（Thiopedia），是光合细菌下的着色杆菌科的一属革兰氏阴性菌。单个圆形至卵圆形。生长于含硫化氢的池塘和湖泊的泥及静止水体中；淡水湖含硫化氢的均温层中常见的浮游菌。

该属的模式种也是惟一种为玫瑰色板硫菌（Thiopediarosea）。

（10）硫红球菌属

硫红球菌属（学名为：Thiorhodococcus），是光合细菌下的着色杆菌科的一属革兰氏阴性菌。单个细胞球形。生长于海洋及湖泊含硫化氢的黑色沉积物表层。

该属的模式种为Thiorhodococcusminus。

（11）硫红弧菌属

硫红弧菌属（Thiorhodovibrio），是光合细菌下的着色杆菌科的一种革兰氏阴性菌。单个细胞弧形至螺旋形。生长于海洋及湖泊沉积物表层，含硫化氢的微生物集生体。

该属的模式种也是惟一种为维氏硫红弧菌（Thiorhodovibriowinogradskyi）。

（12）硫螺旋菌属

硫螺旋菌属（Thiospirillum），是光合细菌下的着色杆菌科的一种革兰氏阴性菌。细胞呈弯曲的杆形或螺旋形（S形）。

该属的模式种也是惟一种为耶拿硫螺旋菌（Thiospirillumjenense）。

2.外硫红螺菌科

外硫红螺菌科（Chloroherpeton），是光合细菌的着色菌目的一科革兰氏阴性菌。这群菌最早是由Pelsh于1937年发现的，曾经归为着色杆菌科。现在归于外硫红螺菌科，与着色杆菌科同属于着色菌目。

外硫红螺菌科细胞螺旋形或杆形，依靠细菌叶绿素和类胡萝卜素作光合色素进行厌氧光合作用。

（1）外硫红螺菌属

外硫红螺菌属（Ectothiorhodospirace），是外硫红螺菌科的一属光合细菌。细胞卵圆形或杆形至螺旋形，0.7～1.5μm宽，极生丛鞭毛运动；二分分裂，可能含气泡，革兰氏阴性。片层状光合内膜与细胞质膜相连。光合色素是细菌叶绿素a或b及螺菌黄素类类胡萝卜素。

该属的模式种运动外硫红螺菌(Ectothiorhodospiracemobilis)。

（2）嗜盐红螺菌属

嗜盐红螺菌属（Halorhodospira），是外硫红螺菌科的一属光合细菌。细胞呈螺旋形，有些条件下也呈螺旋形。生长在pH值中性至极端碱性，且含有硫化氢的高盐至极端盐度环境中，如盐滩、盐湖和苏打湖等。

该属的模式种为嗜盐嗜盐红螺菌(Halorhodospirahalophila)。

3.颗粒状球菌科

颗粒状球菌科（学名：Granulosicoccaceae）为着色菌目的一科细菌。此科的模式属为颗粒状球菌属(Granulosicoccus)。

颗粒状球菌属（学名：Granulosicoccus）为颗粒状球菌科的一个属。该属的模式种为南极颗粒球菌（Granulosicoccus antarcticus）。

4.盐硫杆状菌科

盐硫杆状菌科（学名：Halothiobacillaceae）为着色菌目的一科细菌。此科的模式属为盐硫杆状菌属(Halothiobacillus)。

盐硫杆状菌属（学名：Halothiobacillus）为盐硫杆状菌科的一个属。该属的模式种为（Halothiobacillus neapolitanus）。