按照职务职级并行管理规定，实际四级主任科员和三级主任科员，都是属于副科级待遇的职级，在民间将四级主任科员称为小副科，三级主任科员称为大副科。小副科和大副科的区别是工资级别不同，其实都是副科级待遇。

按照公务员法的规定，公务员实行职务职级并行管理，所谓的并行管理，就是公务员在晋升领导职务的同时可以同时晋升职级，现在公务员的职级相当于过去的非领导职务。不同的是，过去凡是担任领导职务的公务员不能担任非领导职务，但实行职务职级并行管理以后，担任领导职务的公务员，可以同时晋升职级。

公务员的职级共分为巡视员、调研员、主任科员、科员四个分类，共12个职级，最高的为一级巡视员，最低的为二级科员。其中四级主任科员为乡科级副职对应最低职级，四级主任科员晋升到三级主任科员也算是职级的晋升，虽然都是对应的乡科级副职领导职务，但是如果四级主任科员晋升的到三级主任科员，更有机会提拔为乡科级领导职务，同时享受的工资待遇是完全不一样的。

从四级主任科员晋升到三级主任科员，那么有没有名额限制呢？按照职务职级并行管理规定，机关越大基本上都没有名额限制，从中央机关来看，只有调研员及其以上的职级有名额规定，省级机关只对四级及其以上的调研员有职级比例的规定；副省级城市的机关也只是对四级调研员及其以上的职级比例有规定。

地市州机关对一级主任科员、二级主任科员占四级主任科员的比例有规定，但没有三级主任科员占四级主任科员的比例；县区机关一级、二级主任科员不超过一级至四级主任科员总数的50%，但是没有三级主任科员占四级主任科员的比例。

在实践中，大机关工作人员入职两年到四年，都能晋升到四级或是三级级主任科员，但是在基层，四级主任科员晋升到三级主任科员虽然没有比例限制，没有名额的限制，但毕竟也是一种晋升，其晋升过程也还是有一定的难度的。特别是要从三级主任科员晋升到二级主任科员，实现从副科到正科的转变，这个难度更大。

综上所述，由于四级主任科员、三级主任科员都是享受的副科级待遇，其主要的区别是工资级别的区别，三级主任科员的级别是二十三级至十七级；四级主任科员的级别是二十四级至十八级；也就是最低和最高只相差一个级别。从某种程度上说，从四级主任科员晋升到三级主任科员，除了职级待遇以外，主要是级别的差距，而且这是没有名额限制的，从理论上来说，只要担任副科级领导职务或是四级主任科员2年以上，都能晋升到三级主任科员。