新生儿感染是全世界发病率和死亡率的主要原因[1]。大肠埃希菌是引起新生儿侵袭性细菌感染的常见病原体,是败血症患者中最常见的革兰氏阴性病原体[1-5]。近年来的临床药敏检测表明耐药的大肠埃希菌感染率正在增加。到目前为止,关于大肠埃希菌耐药性的研究主要集中在成人身上,而对新生儿的研究较少。

近日,首都儿科研究所附属儿童医院王亚娟主任团队发表了一项关于新生儿的大肠埃希菌研究。该研究主要分析了大肠埃希菌对常见抗菌药物的耐药特征,并对采集自新生儿的大肠埃希菌进行了多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)。本研究结果可为新生儿临床合理用药提供依据,也可为我国这一年龄组选择抗大肠埃希菌感染的抗生素提供指导。

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研究于2019年11月至2020年10月期间在中国的7家三甲医院(来自不同省份)采集了新生儿的大肠埃希菌阳性样本。对样本中分离出的大肠埃希菌进行了药敏检测(肉汤微量稀释法)、超广谱β-内酰胺酶(extended-spectrum β-lactamase ,ESBL)检测和MLST。

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大肠埃希菌菌株来源的地理分布

研究中共分离出223株大肠埃希菌,总体耐药率为87.4%,ESBL阳性率为48.0%,多重耐药率为42.2%。在20种抗菌药物中,大肠埃希菌对以下药物的耐药率最高,具体分别为:头孢噻肟(59.2%)、甲氧苄啶/磺胺甲恶唑(56.5%)、强力霉素(39.9%)、环丙沙星(36.8%)和氨曲南(31.0%)

儿童医院的分离菌株对哌拉西林/他唑巴坦、头孢噻肟、环丙沙星、甲氧苄啶/磺胺甲恶唑和碳青霉烯类抗生素的耐药率明显高于妇幼保健院的分离菌株。虽然研究中的大肠埃希菌对替加环素、多粘菌素B类药物、哌拉西林/他唑巴坦、阿米卡星、多粘菌素和碳青霉烯类抗生素的敏感性较高,但由于新生儿已批准的抗生素种类较少,导致新生儿大肠埃希菌感染难以治疗。

大肠埃希菌MLST主要类型是ST1193、ST95、ST73、ST410和ST131。其中,ST1193、ST410和ST131菌株的ESBL产生率和多药耐药率显著高于ST95和ST73菌株。研究发现,儿童医院大肠埃希菌ST1193和ST410菌株的感染率高于妇幼保健医院。在过去20年中,大肠埃希菌ST410中多药耐药性的积累,加上其可以在不同患者间传播,使得该菌株在临床环境中极为危险。因此我们需要密切监测这种菌株[6]。

总之,中国住院新生儿感染的大肠埃希菌的耐药率较高。除多药耐药性外,我们还应注意大肠埃希菌对碳青霉烯类和喹诺酮类抗生素的耐药性。不同分型的大肠埃希菌对抗菌药物的耐药率不同,表明菌株序列分型可以指导临床中抗生素的合理使用。

参考文献

1. Cailes B, Kortsalioudaki C, Buttery J, Pattnayak S, Greenough A, Matthes J,et al. Epidemiology of UK neonatal infections: the neonIN infection surveillance network. Arch Dis Child Fetal Neonatal Ed 2018; 103 (6):F547–53. doi: 10.1136/archdischild- 2017- 313203 .

2. Li JY, Chen SQ, Yan YY, Hu YY, Wei J, Wu QP, et al. Identification and antimicrobial resistance of pathogens for neonatal septicemia in China – A meta-analysis. Int J Infect Dis 2018; 71 :89–93. doi: 10.1016/j.ijid.2018.04.794 .

3. Okomo U, Akpalu ENK, Le Doare K, Roca A, Cousens S, Jarde A, et al. Aetiology of invasive bacterial infection and antimicrobial resistance in neonates in sub-Saharan Africa: a systematic review and meta-analysis in line with the STROBE-NI reporting guidelines. Lancet Infect Dis 2019; 19 (11):1219–34. doi: 10.1016/S1473-3099(19)30414-1 .

4. Salipante SJ, Roach DJ, Kitzman JO, Snyder MW, Stackhouse B, Butler-Wu SM, et al. Large-scale genomic sequencing of extraintestinal pathogenic Escherichia coli strains. Genome Res 2015; 25 (1):119–28. doi: 10.1101/gr.180190.114 .

5. Cole BK, Ilikj M, McCloskey CB, Chavez-Bueno S. Antibiotic resistance and molecular characterization of bacteremia Escherichia coli isolates from newborns in the United States. PLoS One 2019; 14 (7):e0219352,. doi: 10.1371/journal.pone.0219352 .

6. Roer L, Overballe-Petersen S, Hansen F, Schonning K, Wang M, Roder BL, et al. Escherichia coli sequence type 410 is causing new international high-risk clones. mSphere 2018; 3 (4):e00337-18. doi: 10.1128/mSphere.00337-18 .