“志库生智”旨在结合实例介绍生物志库的功能,打开用户思路,活用数据库。

本期主题——批量查询物种的解决思路

导览:

  1. 批量检索模块介绍

  2. 拉丁名检查的隐藏用法

  3. 实例应用

在做某一地区物种调查的时候,经常会面临要一次性查询很多物种中文名/拉丁名的场景,而生物志的“批量检索”模式应运而生。此外拉丁名检查功能也有隐藏用法,可以帮助用户完成“批量检索”,一起来了解一下吧。

1 批量检索模块介绍

批量检索目前仅在植物子库开放,检索的底层数据是《中国植物志》及Flora of China这辆套权威丛书。入口如下:

使用时,请先下载模板,按模板要求填写内容:

点击搜索按钮,即可得到搜索结果。下图为演示的搜索结果,其中有关物种名称的黑色字体表示上传的内容,绿色字体表示系统匹配出的内容,后面的分布以及来源也是系统匹配出的结果。

但看系统匹配内容,即检索结果,可以看出大致有三种情况。

①浅绿色框所示,系统既没有匹配到一致的中文名,也没有匹配到一致的拉丁名。

②红色框所示,系统匹配到了中文名和拉丁名。

③蓝色框所示,系统根据上传的拉丁名匹配到了拉丁名,同时也给出了拉丁名对应的中文名。

如果此结果符合预期,则可以点击页面右上方的“导出excel”,将结果下载至本地,做进一步分析研究。

2 拉丁名检查的隐藏用法

关于拉丁名检查功能的用法,了解生物志库的用户应该都比较熟悉,不了解的也可以点击此处,详细了解。这里我们来讲讲拉丁名检查功能的一个批量检索的用法。

拉丁名检查的底层逻辑是:

系统首先识别文档(.docx)中的拉丁名,再用拉丁名去词库中匹配,如果匹配到完全一致的值,则再进一步往拉丁名前面寻找最近的中文名称与词库中的中文名进行比对,完全一致则标记为绿色,不一致则以批注的形式返回词库中的中文名,具体可参见以下流程图。

因此,将想要查询的内容转成.docx文档,就能使用拉丁名检查的功能进行批量检索了。

除此之外,检查成功的文件包会附一份识别的excel表格,这也是将文档中拉丁名提取出来的好方法。

3 实例应用

掌握了工具,下面代入实际场景尝试一下。

实例一:仅有拉丁名/中文名

如果待查询的内容仅有物种的拉丁名或中文名,则推荐使用“批量检索”功能。

效果如图:

优势:方便、快捷、准确(以植物志和FOC为比对数据库)

局限:仅限植物,并需购买生物志库权限才可使用。

实例二:既有中文名又有拉丁名

在实际应用过程中,更多情况是不确定物种的中文名或者拉丁名,此时可以将物种整理为“中文名+空格+拉丁名”的形式,存入word文档,保存为.docx的格式,再使用拉丁名检查的功能,就能核对出物种的正确名称。

优势:全物种类群(植物、动物、真菌、藻类、海洋生物);免费提供(注册并实名认证后即可使用)。

局限:仅有拉丁名的情况,系统仅比对拼写是否正确,无法给出匹配中文名的建议;仅有中文名的情况,系统无法识别。

欢迎有需求的伙伴多多使用。针对批量检索和拉丁名检查功能,在词库的扩充方向上有意见也有建议的用户,欢迎随时留言。祝使用愉快。

更多生物志库使用技巧,欢迎持续关注。