撰文丨王聪

编辑丨王多鱼

排版丨水成文

2023年，中国科研机构作为第一单位共发表51篇Cell研究论文（另有大约10篇国内科研机构作为非第一单位合作发表的论文未计入统计），这也是首次国内年度发表Cell研究论文数量突破50篇，相比之下，2022年是30篇，2021年是35篇，2020年是43篇。

以下是对这些Cell论文的介绍（按论文上线时间排序）：

论文题目：The Human Pre-replication Complex is an Open Complex

通讯作者：翟元梁（香港大学）、党尚宇（香港科技大学）、戴碧瓘（香港科技大学）、陈春龙（法国居里研究所）

第一作者：李健、董江清、王纬韬、余大启

论文简介：在真核生物中，DNA复制的启动需要装配和激活MCM2-7 DH，该研究成功 解析了人源MCM2-7 DH-DNA复合物的2.59Å的高分辨率冷冻电镜结构，进而揭示了人细胞DNA复制起始的新机制。

论文题目：Resurrection of endogenous retroviruses during aging reinforces senescence

通讯作者：刘光慧、曲静（中国科学院动物研究所）、张维绮（中国科学院北京基因组研究所）
第一作者：刘晓倩、刘尊鹏、武泽明、任捷

论文简介：该研究首次发现了年轻的内源逆转录病毒（ERV）亚家族在细胞衰老过程中被再度唤醒，提出了古病毒复活介导衰老程序化及传染性的理论，并且创新性地发展出阻断ERV古病毒复活及扩散以实现延缓衰老的多维干预策略。

论文题目：Light modulates glucose metabolism by a retina-hypothalamus-brown adipose tissue axis

通讯作者：薛天（中国科学技术大学）

第一作者： 孟建军、沈嘉伟

论文简介： 该研究发现了光直接通过激活视网膜上特殊的感光细胞，经视神经至下丘脑和延髓的系列神经核团传递信号，最终通过交感神经作用于外周的棕色脂肪组织，直接压抑了机体的血糖代谢能力。这项工作不但在小鼠动物模型上系统回答了光调节血糖代谢的生物学机理，在人体试验上也发现了同样的现象，显示了光调节血糖代谢可能广泛存在于哺乳动物界。

论文题目：Structures of the entire human opioid receptor family

通讯作者：徐华强/庄友文（中国科学院上海药物研究所）、Bryan L. Roth（北卡罗莱纳大学教堂山分校）

第一作者：王悦、庄友文、Jeffery F. DiBerto

论文简介：该研究系统地解析了阿片受体家族四个亚型μOR、δOR、κOR、NOPR和各自的选择性多肽包括内啡肽、内吗啡肽、强啡肽、皮啡肽和痛敏肽的冷冻电镜复合物结构，结合大量细胞水平的功能实验，揭示了多肽类配体和阿片受体的结合模式，阐述了它们的选择性和保守性机制，为“信使-信箱-效能”模式提供了结构和功能支持。

论文题目：Neural Mechanism Underlying Depressive-Like State Associated with Social Status Loss

通讯作者：胡海岚（浙江大学）

第一作者：范郑晓

论文简介： 这项研究揭示了社会地位下降导致抑郁症的神经学机制——社会地位下降会触发负性奖赏预测误差，从而通过激活大脑中的反奖赏中枢外侧缰核（LHb），LHb的激活，既能诱导抑郁样行为，还能抑制负责调控社会竞争力的内侧前额叶皮层（mPFC），进一步加强在社会竞争中的退让。该研究还表明，使用抗抑郁症药物氯胺酮治疗能够增加小鼠在社会竞争实验中的获胜概率，提高竞争失败小鼠的社会地位等级，而通过激活mPFC来恢复社会地位等级，可以迅速改善抑郁样行为。这些发现为主要由社会因利因素引起的抑郁症的干预和治疗奠定了理论基础。

论文题目：Opioid-induced fragile-like regulatory T cells contribute to withdrawal

通讯作者：王科嘉、梁青（厦门大学）

第一作者：朱永生、严鹏

论文简介：流行病学研究发现大部分阿片药物成瘾患者伴随免疫力低下的表现，其机制并不明确，并且在临床和科研工作中经常被忽视。该研究揭示了成瘾人群外周免疫微环境变化，建立起脆弱样调节性T细胞与成瘾戒断行为的免疫学联系，有望通过免疫干预的方式治疗阿片类药物成瘾。

论文题目： Diverse CMT2 neuropathies are linked to aberrant G3BP interactions in stress granules

通讯作者：白戈（浙江大学）、李劲松（中国科学院分子细胞科学卓越创新中心）

第一作者：崔琴琴、毕洪运、吕占云、武琪贵、华剑锋、谷博凯

论文简介：该研究发现，虽然在正常生理状态下不同腓骨肌萎缩症（CMT）致病蛋白在细胞中的定位各异，但在应激状态下这些CMT致病蛋白会表现出相同的细胞定位，进入应激颗粒中并与其核心蛋白G3BP发生异常互作，引起应激颗粒异常，使得周围神经应对环境不良刺激的能力下降，从而导致周围神经病的发生。 该工作揭示了应激颗粒异常是介导不同亚型CMT的共同致病机制 ，为针对多亚型CMT的广谱治疗药物的开发提供了重要理论基础，也为其他疾病遗传异质性的机制研究提供了新的思路。

论文题目：Flux Regulation through Glycolysis and Respiration is Balanced by Inositol Pyrophosphates in Yeast

通讯作者：Jens Nielsen/刘子鹤（北京化工大学）

第一作者： 秦宁

论文简介：该研究解释了焦磷酸肌醇作为能量传感器调控平衡糖酵解和呼吸通量的重要机制，并提供了酵母如何在能量短缺压力下通过调节转录因子影响代谢可塑性的见解，同时，提出焦磷酸肌醇调控酵解和呼吸平衡新机制。

论文题目：A bat MERS-like coronavirus circulates in pangolins and utilizes human DPP4 and host proteases for cell entry

通讯作者：周鹏（中国科学院武汉病毒研究所/广州实验室）、石正丽（中国科学院武汉病毒所） 、胡艳玲（广西医科大学） 、童贻刚（北京化工大学） 、林鑫华（复旦大学）

第一作者：陈静、杨兴娄、司昊睿、宫千淳、阙腾程、李景

论文简介：该研究发现了穿山甲作为蝙蝠病毒跨种的中间及适应性宿主的证据。即穿山甲中流行着一种曾经只在蝙蝠中流行的HKU4相关冠状病毒。与蝙蝠HKU4病毒不同，该穿山甲病毒（MjHKU4r-CoV）有更强的人DPP4受体结合能力，并拥有一个蝙蝠病毒上不含有的弗林酶切割位点，从而使之更适应人细胞的入侵和复制。通过细胞、类器官和动物模型，该研究证实该病毒可以潜在感染人并具备人群传播的风险。作为一个被频繁走私的物种，穿山甲极可能从生态学和病毒学上促进了蝙蝠冠状病毒对人群的跨种感染。

论文题目：Molecular basis of RADAR anti-phage supramolecular assemblies

通讯作者：高璞（中国科学院生物物理研究所）

第一作者：高艺娜

论文简介：张锋团队等鉴定的拥有全新核酸修饰活性的细菌免疫系统RADAR，是目前已知唯一可通过催化RNA的A-to-I（adenosine-to-inosine）脱氨来执行抗病毒功能的细菌防御系统，RADAR在抗病毒免疫和RNA修饰方面展现出多种新颖特点，且有潜力被开发为新型的生物学工具，因此受到领域内的广泛关注。这项研究发现了RADAR不同组分间的互作关系，揭示了其通过形成新型超分子复合体来实现RNA装载、运输和脱氨修饰的精妙偶联机制， 拓展了科学家对细菌-病毒博弈复杂性的认知，并为开发基于RADAR的多种生物学工具提供了思路。

论文题目：β2-microglobulin functions as an endogenous NMDAR antagonist to impair synaptic function

通讯作者：王鑫（厦门大学）

第一作者：高月

论文简介：唐氏综合征，又称21-三体综合征，是先天性智力障碍的最常见原因。除了神经系统的症状，唐氏综合征患者一个典型的病理特征是免疫系统功能异常，表现为自身免疫性疾病、炎症性疾病和血液系统恶性肿瘤的易感性增加。该研究揭示了唐氏综合征中外周免疫参与中枢神经系统损伤的分子机制，发现了β2-微球蛋白（B2M）拮抗NMDA受体的非经典功能，为认知障碍疾病提供了新的治疗思路和药物靶点。

论文题目：The enormous repetitive Antarctic krill genome reveals environmental adaptations and population insights

通讯作者：邵长伟（中国水产科学研究院黄海水产研究所）、范广益（青岛华大基因研究院）、Bettina Meyer（德国阿尔弗雷德•魏格纳研究所）

第一作者：邵长伟、刘凯强、李硕、孙帅、王佳昊、刘群

论文简介： 该研究完成了迄今为止最大动物基因组参考序列—— 南极磷虾 基因组组装，并揭示了南极磷虾适应极端环境和群体历史演化的分子基础。

论文题目：Linking chromatin acylation mark-defined proteome and genome in living cells

通讯作者：陈鹏、季雄、秦芳菲（北京大学）

第一作者：秦芳菲、李伯源

论文简介：该研究发展了在活细胞内“关联解析”蛋白质化学修饰机制与功能的“单位点-多组学”技术——SiTomics，揭示了受染色质酰化修饰介导的丰富的相互作用组学信息，建立了表观遗传调控的蛋白质组与基因组“信息关联”。

论文题目：Sensory circuitry controls cytosolic calcium-mediated phytochrome B phototransduction

通讯作者：钟上威（北京大学）

第一作者：赵晏、施慧、潘颖

论文简介：该研究报道了植物通过“光-钙调控环路”，快速激活两个钙依赖性蛋白激酶，在Ser80和Ser106位点磷酸化phyB，控制phyB入核。该工作同时提出了胞质第二信号钙离子在受体层面解码为特定转导通路的新机制。

论文题目：A thalamic-primary auditory cortex circuit mediates resilience to stress

通讯作者：朱心红（南方医科大学）

第一作者：李环宇、朱旻桢

论文简介： 该研究发现了一个涉及主要听觉区域的微回路——丘脑-初级听觉皮层回路，该回路介导先天心理弹性，该研究还进一步揭示了背后的分子机制。更重要的是，该研究还发现，通过光遗传学模拟MGA1神经元的短期超极化，而不仅仅是激活MGA1神经元和MGPV神经元，可以引发应对压力应激的先天心理弹性机制，在多个动物模型中实现持续的抗抑郁样作用，这表明主要听觉区域，特别是内侧膝状体 （MG） ，可以作为神经刺激的绝佳靶点。

论文题目：Structural basis of membrane skeleton organization in red blood cells

通讯作者：高宁、李宁宁（北京大学）

第一作者：李宁宁、陈思伊

论文链接：该研究成功从猪血红细胞中分离出了膜脂被完全清除、在冷冻电镜条件下具有较好分散度的膜骨架网格，并对这一完整的内源膜骨架系统进行了冷冻电镜结构分析，最终获得了红细胞膜骨架的核心复合物junctional complex的高分辨结构， 揭示了junctional complex和膜骨架组装的分子细节，阐释了其组成因子在膜骨架组装和稳定性维持方面的分子机制。

论文题目：Mesoscale DNA Feature in Antibody-Coding Sequence Facilitates Somatic Hypermutation

通讯作者：孟飞龙（中国科学院分子细胞科学卓越创新中心）、叶菱秀（上海交通大学医学院上海市免疫学研究所）

第一作者：王燕燕

论文简介：该研究系统揭示了抗体基因互补决定区（CDR）偏好性突变背后的生化机制，特别是抗体基因编码序列DNA柔韧性的重要生理作用。这项研究解决了困扰免疫学家40多年的科学难题，为优化现有动物模型及推动下一代抗体基因人源化动物模型的发展提供了全新的见解。

论文题目：Structure of Semliki Forest virus in complex with its receptor VLDLR

通讯作者：向烨（清华大学）、章新政（中国科学院生物物理研究所）

第一作者：曹端方、马丙婷、曹紫怡

论文简介：该研究解析了塞姆利基森林病毒（SFV） 与人源受体VLDLR复合物的高分辨率冷冻电镜结构，鉴定了一种甲病毒全新的受体结合位点，揭示了受体VLDLR的多个相似串联结构域通过协同作用与SFV特异性结合的新型机制。该研究首次阐释了通用受体分子介导病毒实现跨物种传播的分子机制，为抗病毒药物设计及新型疫苗开发提供了新靶点。

论文题目：Neurulation of the cynomolgus monkey embryo achieved from 3D blastocyst culture

通讯作者：王红梅、郭帆、李伟（中国科学院动物研究所/北京干细胞与再生医学研究院）、Nicolas Plachta（宾夕法尼亚大学）

第一作者： 翟晶磊、徐艳红、万海峰、燕蕊、郭敬、Robin Skory

论文简介：科学家一直致力于搭建非人灵长类胚胎体外培养体系。2019年，王红梅团队及国内外同行将食蟹猴胚胎体外培养至胚胎期20天。但要探究灵长类胚胎中晚期原肠运动和早期神经胚发育，还需要进一步延长食蟹猴胚胎的体外发育历程。在这项研究中，研究团队建立了一个可支持食蟹猴胚胎体外发育至受精后25天的3D长时程培养体系，并基于该体系探究了灵长类胚胎中晚期原肠运动和早期神经发育过程中的核心事件和谱系特征。

论文题目：Ex utero monkey embryogenesis from blastocyst to early organogenesis

通讯作者：谭韬/陈永昌/季维智（昆明理工大学）、吴军（德克萨斯大学西南医学中心） 、刘兵（中国人民解放军总医院）

第一作者：公彦栋、白冰、孙念琴、慈百全、邵红莲、张婷

论文简介： 该研究开发了一种3D培养系统——EMEUC， 实现了食蟹猴胚胎体外25天的长时程培养 。利用该平台，研究团队系统研究了原肠运动及造血等早期组织器官发生的的谱系特化轨迹和分子演进规律及其调控机制，这些研究结果将有助于了解人类胚胎发育畸形孕早期流产。

论文题目：Phylogenomic discovery of deleterious mutations facilitates hybrid potato breeding

通讯作者：黄三文（中国农业科学院深圳农业基因组研究所）

第一作者：吴瑶瑶、李大伟、胡勇

论文简介：研究团队收集大量茄科物种资源，通过对100个茄科基因组的比较分析来追踪最长8千万年、累计十二亿年的进化痕迹，在此基础上开发出“进化透镜”来发现马铃薯进化约束及有害突变，绘制了首个马铃薯有害突变二维图谱。利用图谱信息，提出反直觉的自交系培育方法，开发全基因组预测新模型，使马铃薯产量预测达到了前所未有的准确度，加速了杂交马铃薯育种进程。该研究使得我国在马铃薯育种基础理论和技术上站在了世界领先地位。

论文题目：Two-photon synthetic aperture microscopy for minimally invasive fast 3D imaging of native subcellular behaviors in deep tissue

通讯作者：戴琼海、祁海、吴嘉敏（清华大学）

第一作者：赵志锋、周逸亮、刘波、贺敬

论文简介：该研究首次提出了基于空间约束的多角度衍射编码，实现非相干光孔径合成；建立了双光子合成孔径显微术（Two-photon synthetic aperture microscopy，2pSAM），“化点为针”，通过多角度针状光束的扫描在实现高速三维感知的同时，将双光子成像光毒性降低了1000倍以上；融合了戴琼海院士团队2021年同样在Cell上所提出的数字自适应光学架构，具备高速多区域像差矫正能力，即使在恶劣复杂活体环境下依然保持近衍射极限的空间分辨率，并进一步提升了传统双光子成像的穿透深度。

论文题目：WeiTsing, a pericycle-expressed ion channel, safe-guards the stele and confers broad-spectrum resistance to clubroot

通讯作者：陈宇航、周俭民、王伟（中国科学院遗传与发育生物学研究所）

第一作者：王伟、秦力、张文静、唐凌汇

论文简介：该研究综合运用遗传学、生物化学、结构生物学、电生理学等手段，成功克隆了广谱高抗根肿病基因——WeiTsing（WTS，卫青），解析了WTS五聚体的三维结构并揭示了其阳离子通道功能，阐明了WTS介导钙信号激活植物免疫应答的分子机制。

论文题目：Structures of sperm flagellar doublet microtubules expand the genetic spectrum of male infertility

通讯作者：吴建平（西湖大学）、桂淼（浙江大学） 、刘明兮（南京医科大学）

第一作者：周伦妮、刘浩滨、刘思钰

论文简介：该研究首次解析了小鼠和人的精子鞭毛微管二联体复合物的冷冻电镜结构，鉴定了多个精子特异的微管结合蛋白，并由此发现了一类新型的弱精症亚型。该工作为理解精子运动的结构基础以及相关男性不育症的诊断和治疗提供了重要线索。

论文题目：Structural RNA components supervise the sequential DNA cleavage in R2 retrotransposon

通讯作者：刘俊杰、王家（清华大学）

第一作者：邓谱涓、谭顺青

论文简介： 该研究报道了R2逆转座子的mRNA中存在两段结构性的RNA，共同调控DNA双链的顺序性切割，从而保证逆转座的准确进行。此外，该研究还将第二类内含子（Group II intron）、LINE-1逆转座子与R2逆转座子进行了比较，总结了生物大分子进化过程中，以RNA为主导逐渐过渡到以蛋白质为主导的进化趋势，提出了新颖的见解。 这项研究与4月份张锋实验室在Science发表的研究共同 解析了R2逆转座子在基因组上跳跃和切割DNA的分子机制，为开发基于逆转座子的新型基因编辑工具奠定了基础。

论文题目：Gasdermin D licenses MHCII induction to maintain food tolerance in the small intestine

通讯作者：朱书（中国科学技术大学）、Richard A. Flavell（耶鲁大学）

第一作者：何恺鑫、万婷婷、王德财、胡冀

论文简介：GSDMD蛋白作为介导细胞焦亡（pyroptosis）的关键执行蛋白，近年来广受关注。GSDMD在肠道尤其小肠也有着极高的表达量，GSDMD的非焦亡功能以及在肠道发挥什么具体的生理作用也因此成为了亟待探索的科学问题。 这项研究详细阐述了GSDMD在前端小肠中会在食物诱导下形成一个N 13 剪切，该片段在核孔复合物帮助下入核并辅助增强了STAT1对Ciita的转录调节，使IEC的二类分子表达增加，从而诱导Tr1的上调，最终促进食物耐受形成，为维持宿主肠道稳态发挥了重要作用。

论文题目：Large-scale snake genome analyses provide insights into vertebrate development

通讯作者：李家堂（中国科学院成都生物研究所）

第一作者：彭长军、、任金龙、吴东东

论文简介：该研究基于大规模多组学技术与基因编辑等研究手段，全面揭示了蛇类起源及特殊表型演化的遗传机制。 该研究率先启动了蛇类大规模组学研究，解析了其特殊性状的分子机制，对理解爬行动物的演化历史具有重要意义，并将推动脊椎动物演化生物学等相关学科的发展。

论文题目：Discovery of deaminase functions by structure-based protein clustering

通讯作者：高彩霞（中国科学院遗传与发育生物学研究所） 、Kevin Tianmeng Zhao（齐禾生科生物科技有限公司）

第一作者：黄佳颖、林秋鹏、费宏源、贺子欣

论文简介： 该研究创新性地运用人工智能（AI）辅助的大规模蛋白结构预测，建立起全新的基于三级结构的高通量蛋白聚类方法，实现了脱氨酶功能结构的深入挖掘，鉴定到完全区别于已知脱氨工具酶的全新底盘元件，并成功开发了一系列具有我国自主知识产权的新型碱基编辑工具。

论文题目：Circadian Clocks are Modulated by Compartmentalized Oscillating Translation

通讯作者：吝易、杨雪瑞（清华大学）

第一作者： 庄妍榕、李志原、熊诗玥、孙楚杰

论文简介：该研究揭示了细胞中利用相分离协调蛋白质翻译的精细时空调控，从而维持昼夜节律周期的分子机制。该研究中随昼夜节律振荡的相分离系统为未来研究相分离对各种细胞活动的时空调节提供全新的视角。此外，ATXN2是一个与多种神经退行性疾病密切相关的蛋白，因此该研究也对未来的疾病研究具有指导意义，未来相关疾病的治疗应根据文中揭示的ATXN2凝聚体的节律振荡特性仔细考虑诊断和治疗干预的时机。

论文题目：Development of an a-synuclein positron emission tomography tracer for imaging synucleinopathies

通讯作者：叶克强（中国科学院深圳先进技术研究院）、李丹（上海交通大学）、张振涛（武汉大学）

第一作者：项捷、陶友琦、Yiyuan Xia

论文简介： 该研究首次发现一种很有前景的新型PET示踪剂—— [ 18 F]-F0502B ，可在突触核蛋白病中显像聚集神经细胞突触核蛋白α-Syn，该研究已在小鼠模型和灵长类动物模型上得到验证。目前，研究团队正在对新型PET示踪剂[ 18 F]-F0502B展开临床试验，希望可以早日实现临床应用。

论文题目： Single-cell spatial transcriptome reveals cell-type organization in macaque cortex

通讯作者：李澄宇/刘志勇/孙怡迪/沈志明（中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心）、徐讯/刘龙奇/黎宇翔（华大生命科学研究院） 、魏武（临港实验室） 、姚建华（腾讯AI Lab）

第一作者： 陈奥、孙怡迪、雷莹、廖莎、李超、孟娟、柏亦沁、刘振、梁智锋、朱志勇、袁妮妮、杨浩、吴子涵

论文简介：该研究利用我国自主研发的超高精度大视场空间转录组测序技术Stereo-seq和高通量单细胞核转录组测序技术DNBelab C4 snRNA-seq， 成功绘制了猕猴大脑皮层的细胞类型分类树，并揭示了细胞类型组成和灵长类脑区层级结构之间的关系，为进一步研究各类神经元之间的连接提供了分子细胞基础。

论文题目：A natural gene drive system confers reproductive isolation in rice

通讯作者：万建民、吴传银、王海洋（南京农业大学、中国农业科学院作物科学研究所）

第一作者：王超龙、王建、陆佳雨、熊叶辉

论文简介：该研究系统鉴定了引起籼稻和粳稻杂种花粉不育的位点，并对其中一个最主效的位点进行了基因克隆和遗传、分子机制的深入解析，解开了水稻生殖隔离之谜，同时揭示了基因的演化规律以及其在不同水稻种质资源之间的分布。该研究为利用亚种间杂种优势培育高产品种提供了理论和技术支撑。这也是该团队继水稻自私基因之后在杂种不育领域取得的又一突破性进展。

论文题目：Central-cell-produced attractants control fertilization recovery

通讯作者：李红菊（中国科学院遗传与发育生物学研究所）

第一作者：孟姜果、徐银娇、王玮琦、杨菲

论文简介： 被子植物受精过程中的一种极具生命力的现象——受精恢复（fertilization recovery），即雌配子受精失败后，胚珠会吸引额外的花粉管运送来新的精细胞，以确保受精成功的现象。然而，植物如何感知雌配子受精失败进而启动受精恢复，是一个延续百年的科学难题。该成果回答了植物双受精失败后，胚珠为何仍会持续吸引花粉管的科学问题，为了解自然界某些物种在进化中丢失助细胞的原因提供了线索。更重要的是，该发现为人工授粉挽救濒危植物提供了理论支持，对于人工授粉挽救濒危植物的实践具有指导意义。

论文题目：Adaptive evolution of the enigmatic Takakia now facing climate change in Tibet

通讯作者：何奕騉（首都师范大学）、Ralf Reski（德国弗莱堡大学）

第一作者：胡若洋、李学东

论文简介：该研究以藻苔为研究材料，相对全面深入地分析了从藻苔基因组到种群动态特征，提供了一个新的研究范式，揭秘了藻苔在青藏高原的生存法则。为了扩大藻苔种群在青藏高原的繁衍，研究团队在实验室采用组织培养技术快速繁殖藻苔，并移栽到青藏高原实验基地，经过5年多的观察，看到人工新种群正常生长的可喜结果。

论文题目：A pan-cancer single-cell panorama of human natural killer cells

通讯作者：张泽民/王东方/朱琳楠（北京大学）、彭慧（中国科学技术大学）

第一作者：唐非、李金虎

论文简介：该研究以生物信息学数据整合为支撑， 系统刻画了自然杀伤 （NK） 细胞在不同癌症类型和组织之间的异质性，发现了肿瘤微环境 （TME） 特异富集、杀伤功能异常的NK细胞亚类，揭示了NK细胞与微环境中其他组分的潜在调控关系。

论文题目：Airborne transmission of human-isolated avian H3N8 influenza virus between ferrets

通讯作者：刘金华（中国农业大学）、高福（中国科学院微生物研究）

第一作者：孙洪磊、佟琪、李涵、韩琪祺、刘激雨

论文简介：该研究对我国出现的H3N8亚型禽流感病毒公共卫生风险进行了系统的预警研究，揭示了H3N8亚型禽流感在哺乳动物间空气传播的分子机制，为防控新型H3亚型流感病毒人间大流行奠定了理论基础。具体来说，该研究证明了H3N8亚型禽流感病毒能够在由正常人支气管上皮细胞及肺上皮细胞构建的类器官模型中有效感染和复制。与从鸡群中分离的H3N8毒株相比，从人类感染者中分离的H3N8毒株毒力更强，在小鼠和雪貂中引起了严重病理反应。更重要的是，从出现重症肺炎症状的患者身上分离出的H3N8毒株可以通过在雪貂之进行空气传播（气溶胶传播）。该研究进一步证实了H3N8的PB2-E627K突变对于其在雪貂中的空气传播能力至关重要。而人类即使接种了针对人H3N2病毒的疫苗，对这种新出现的哺乳动物适应性H3N8亚型禽流感病毒似乎也没有产生免疫应答，因此需要密切关注。

论文题目：An immune cell atlas reveals the dynamics of human macrophage specification during prenatal development

通讯作者：李汉杰（中国科学院深圳先进技术研究院） 、朱元方（深圳市宝安区妇幼保健院） 、吴雪清（深圳大学总医院） 、Florent Ginhoux（上海交通大学） 、王冠琳（复旦大学）

第一作者：王泽帅、吴志生、冯若轻、陈晓燕、王昊、王冠琳、李沐曦、王双寅

论文简介：研究团队结合单细胞转录组测序、先进的生物信息学手段、多重免疫荧光染色、体外功能实验等技术，构建了横跨18个发育阶段、19种组织的人类胚胎免疫系统发育高分辨率图谱。研究团队重点关注了最具组织特异性的巨噬细胞，鉴定了15种巨噬细胞亚型，其中包括两种新的巨噬细胞亚型，即存在于表皮、睾丸、心脏等外周组织的类小胶质细胞（Microglia-like cells）和具有血管生成促进功能并广泛分布于多个组织中的促血管生成巨噬细胞（Proangiogenic macrophages，PraM）。 该研究通过构建人类产前免疫细胞发育的时空动态图谱，揭示了多种巨噬细胞亚型在发育过程中的分化起源、空间定位、功能特征及转录调控机制。

论文题目： Spatiotemporal insight into early pregnancy governed by immune-featured stromal cells

通讯作者：杜鹏（北京大学）

第一作者：杨敏、翁建莉

论文简介：该研究结合使用单细胞转录组和华大单细胞空间转录组技术首次对小鼠妊娠早期（E5.5-E9.5）着床位点的细胞组成进行了详细定义，并根据不同细胞的空间动态分布，鉴定出妊娠早期着床位点的8个不同功能中心，最终通过比较健康小鼠和复发性流产模型小鼠着床位点功能中心的差异，进而揭示了胚胎着床初期蜕膜微环境建立及稳态维持是成功妊娠至关重要的条件。

论文题目：Host traits shape virome composition and virus transmission in wild small mammals

通讯作者：张永振（复旦大学）

第一作者：陈燕玫、胡书剑、林献丹、田俊华

论文简介： 该研究在国际上首次对人类传染病重要的动物传染源：啮齿类、蝙蝠和鼩鼱等小型哺乳动物进行了全面、系统的病毒的多样性、进化生态学，以及播散规律研究，并从地理生境、类群、种群、个体、组织器官五个维度系统地揭示了宿主特征等生态因子如何影响病毒组组成和跨物种病毒传播。 该研究发现大量的病毒具有跨种间传播能力，这也意味着它们具有突破物种间的遗传障碍感染人的可能 。这些研究结果也为将来建立像天气预报一样准确的新发突发传染病预报预测系统奠定了坚实的理论基础与技术支撑。

论文题目：Systemic immune profiling of Omicron-infected subjects inoculated with different doses of inactivated virus vaccine

通讯作者：瞿介明、诸江、李庆云、陈赛娟（上海交通大学）

第一作者：余山河、林莹妮、李勇、陈仕俊、周丽娜、宋鹤杰

论文简介：该研究以2022年春季上海Omicron变异株爆发为研究对象，建立了由接种了不同灭活病毒疫苗次数的感染者和未感染者组成的研究队列，分析并揭示了接种3次增强剂疫苗通过促进HLA-DRhigh经典单核细胞和非经典单核细胞的活化、Th1-like记忆效应性T细胞的极化，并抑制病理性调节性T细胞（Treg）的扩增等机制发挥免疫保护作用。相关性分析等研究提示：接种3次增强剂疫苗诱导了“训练天然免疫”，它会在Omicron感染时促进单核细胞的活化和成熟，而不是分化为髓源性抑制细胞（MDSCs）， 是一触发系例保护性免疫效应的核心事件。 该研究 首次系统性地描述了新冠病毒灭活疫苗接种对奥密克戎感染者免疫反应的影响，揭示了3次增强剂灭活疫苗通过诱导 “训练天然免疫”促进单核细胞的活化和成熟，从而发挥强有力抗病毒作用的分子机制。

论文题目：Antagonistic RALF peptides control an intergeneric hybridization barrier on Brassicaceae stigmas

通讯作者：瞿礼嘉、钟声（北京大学）

第一作者：兰子君、宋子菡

论文简介： 该研究在分子水平上解析了拟南芥柱头识别并接受自己花粉以及近缘花粉而不接受远缘花粉的机制，提出了柱头-花粉间识别与信号交流的“锁-钥模型”， 阐明了柱头处的种间/属间生殖障碍形成的机理，完美解释了“花粉蒙导效应”。

论文题目：Amyloplast sedimentation repolarizes LAZYs to achieve gravity sensing in plants

通讯作者：陈浩东（清华大学）

第一作者：陈家悦、于仁波、李娜、邓兆国、张欣欣、赵亚冉、曲城甫

论文简介：重力控制着植物的定向生长，120年前就提出了的“淀粉-平衡石假说”是最被广泛接受重力感知理论，也早已被写入教科书，但其中的分子机制，100多年来仍是个“未解之谜”。 这项研究解决了这个存在了100多年的科学难题，揭示了植物感知重力的分子机制，为“淀粉-平衡石假说”提供了分子水平的解释——细胞器运动触发分子极性形成。

论文题目：Live Birth of Chimeric Monkey with High Contribution from Embryonic Stem Cells

通讯作者：刘真/孙强（中科院脑科学与智能技术卓越创新中心）、Miguel Esteban（华大基因研究院）

第一作者：曹静、李杰、李春杨、李文娟、Md. Abdul Mazid、贾雯淇、姜禹

论文简介：该研究在国际上首次成功构建了高比例胚胎干细胞贡献的出生存活的嵌合体猴，并证实了猴胚胎干细胞可以高效的贡献到胚外胎盘组织和生殖细胞。这对于理解灵长类胚胎干细胞全能性具有重要意义，为遗传修饰模型猴的构建奠定了技术基础。

论文题目：Circuit-specific gene therapy reverses core symptoms in a primate Parkinson’s disease model

通讯作者：路中华、戴辑、鲍进（中国科学院深圳先进技术研究院）

第一作者： 陈晔菲、洪泽璇

论文简介：该 研究报道了一种全新的基于逆向腺相关病毒（retrograde AAV）的神经调控策略，这一技术与现有左旋多巴和多巴胺受体激动剂类药物相比最大特点是可以实现对帕金森病累及的基底节神经环路的精准靶向干预，而不影响全脑全身任一其他多巴胺通路和系统，为帕金森病临床治疗提供了潜在的全新精准干预技术。

论文题目：Structural basis for human Ca v 1.2 inhibition by multiple drugs and the neurotoxin calciseptine

通讯作者：颜宁（深圳医学科学院）、高帅（武汉大学）、宋晨（北京大学）

第一作者： 高帅、姚霞、陈姣凤

论文简介：电压门控钙离子通道Ca v 1.2是大脑、心肌和平滑肌L型钙通道的主要亚型，对许多生理与神经活动至关重要，如心肌和平滑肌收缩，以及学习和记忆功能等。Cav1.2功能异常增强与蒂莫西综合症有关，这是一种罕见的常染色体显性障碍，病理表现为心肌病、心律失常、蹼趾和自闭症谱系障碍等。Cav1.2是多种临床常用药物和天然毒素的作用靶标。 该研究揭示了自由状态、多种药物结合、多肽毒素结合的钙离子通道Ca v 1.2的高分辨结构。

论文题目： Structural and signaling mechanisms of TAAR1 enabled preferential agonist design

通讯作者：孙金鹏/杨帆（山东大学）、邵振华（四川大学）、李乾（上海交通大学）、王越（山东第一医科大学）

第一作者：尚攀、荣乃康、姜晶晶、程杰、张鸣晖、康东伟、齐磊

论文简介：该研究系统分析了不同内源性胺类和SEP-363856激活TAAR1多种G蛋白信号的特征，解析了不同胺类激活TAAR1-Gs/Gq通路的分子机制和药理学特征，进而成功开发出同时具有Gs和Gq双重激活活性的TAAR1小分子激动剂——ZH8651，并在小鼠模型中验证了其改善精神分裂的作用。 该研究为靶向TAAR1治疗精神分裂症的候选化合物设计及药物开发改造提供了重要参考。

论文题目：ABLs and TMKs are co-receptors for extracellular auxin

通讯作者：徐通达、杨贞标（福建农林大学）

第一作者：于永强、唐文鑫、林文伟、李围、周翔

论文简介：该研究报道了两个新的质外体定位的生长素结合蛋白——ABL1和ABL2，与生长素结合蛋白ABP1具有相似结构，在细胞膜上形成ABP1/ABLs-TMK生长素共受体感受并传递胞外生长素信号，调控植物生长和发育的分子机制。 该研究 揭开了植物细胞如何感受胞外生长素信号的神秘面纱 ，阐释了细胞膜共受体复合 体传递生 长素 信号调控植物生长发育的分子机制，是植物激素信号转导领域的重要发现。

论文题目：Prolonged sleep deprivation induces a cytokine storm-like syndrome in mammals

通讯作者：张二荃（北京生命科学研究所）

第一作者：桑迪、林可腾、杨旖旎

论文简介： 该研究发现， 长期睡眠剥夺触发小鼠危及生命的细胞因子风暴 ，并进一步阐明了背后的机制——睡眠剥夺诱导PGD 2 在大脑内积累，随后ABCC4转运蛋白介导的脑源性PGD 2 外排穿过血脑屏障，导致促炎细胞因子的过量产生，最终导致细胞因子风暴样表型和多器官功能障碍综合征（MODS）。

论文题目： Choroid plexus mast cells drive tumor-associated hydrocephalus

通讯作者：苏士成（中山大学孙逸仙纪念医院）

第一作者：李怡晔、狄灿、宋世键、张宇博

论文简介：该研究发现了大脑脉络丛中的一个独特肥大细胞群—— 脉络丛肥大细胞 （CPMC） ，进一步揭示了这些细胞在致命的脑转移并发症肿瘤相关性脑积水（TAH）中发挥着至关重要的作用，并为TAH提供了一种有吸引力的治疗方法。

论文题目：Spatiotemporal transcriptome atlas reveals the regional specification of the developing human brain

通讯作者：焦建伟（中国科学院动物研究所）、董骥（广州国家实验室） 、杜鹏/靳蕾（北京大学）

第一作者：李妍昕、李忠秋、王长亮、杨敏

论文简介： 该研究将单细胞测序 （scRNA-seq） 和空间转录组技术（scStereo-seq）相结合，首次解析了迄今为止跨时间点最广（GW6-GW23）、面积最大（最大4cm × 3cm）的人脑多区域时空发育转录组图谱。 该研究鉴定并呈现了发育早期具有特定空间分布特点的异质性放射状胶质细胞亚型，揭示了这些异质性放射状胶质细胞有助于随后不同脑区神经元的特化，同时发现胶质细胞和神经元互作也会促进神经元的区域特化。

论文题目：Snapshot of the cannabinoid receptor 1-arrestin complex unravels the biased signaling mechanism

通讯作者：李晓明、张岩（浙江大学）

第一作者：廖宇莹、张会冰、沈庆亚、蔡晨曦

论文简介：该研究成功从原子分辨率水平解析了大麻素受体CB1的β-arrestin1信号转导复合物的精细三维结构，结合细胞水平功能分析发现了大麻素受体CB1介导β-arrestin信号的关键结构决定因素，阐明了大麻素受体CB1产生下游特定信号谱图的机制，为推动开发精细调控大麻素受体CB1功能信号的合成大麻素奠定基础，从而在保留大麻治疗效果的同时规避其副作用。

论文链接：

01. https://doi.org/10.1016/j.cell.2022.12.008

02. https://doi.org/10.1016/j.cell.2022.12.017

03. https://doi.org/10.1016/j.cell.2022.12.024

04. https://doi.org/10.1016/j.cell.2022.12.026

05. https://doi.org/10.1016/j.cell.2022.12.033

06. https://doi.org/10.1016/j.cell.2022.12.030

07. https://doi.org/10.1016/j.cell.2022.12.046

08. https://doi.org/10.1016/j.cell.2023.01.014

09. https://doi.org/10.1016/j.cell.2023.01.019

10. https://doi.org/10.1016/j.cell.2023.01.026

11. https://doi.org/10.1016/j.cell.2023.01.021

12. https://doi.org/10.1016/j.cell.2023.02.005

13. https://doi.org/10.1016/j.cell.2023.02.007

14. https://doi.org/10.1016/j.cell.2023.02.011

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19. https://doi.org/10.1016/j.cell.2023.04.019

20. https://doi.org/10.1016/j.cell.2023.04.020

21. https://doi.org/10.1016/j.cell.2023.04.008

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49. https://doi.org/10.1016/j.cell.2023.11.001

50. https://doi.org/10.1016/j.cell.2023.11.016

51. https://doi.org/10.1016/j.cell.2023.11.017