氨基甲酸乙酯(EC),是传统发酵食品(如食醋、酱油、泡菜、白酒、葡萄酒、黄酒等)在发酵或酿造及储存过程中形成的2A类致癌物质。由于EC分子结构稳定,形成后难以分解,因此从末端直接消除所有途径中形成EC的直接消减法,理论上是控制传统发酵食品中EC含量的最佳方法之一。目前尚无可高效降解发酵食品中EC的酶,原因是所发现的酶生化特性存在重大缺陷。因此,筛选表征出具有优良性能的、可降解EC的酯酶,可有效解决酶在应用中存在的尿素与EC竞争的难题。
安徽工程大学生物与食品工程学院的刘庆涛、朱司宝、田淑芳*等以文献报道的可降解EC的酯酶氨基酸序列为依据,在NCBI数据库中挖掘出9 个可能具有EC水解作用的酯酶;通过全基因合成及重组大肠杆菌异源表达技术,对9 个酯酶进行异源表达,并对重组酯酶进行EC水解能力鉴定;在此基础上,对具有高EC水解活力的4 个酯酶进行纯化及酶学性质测定。本研究丰富了EC水解酶酶库,同时为酶法降解传统发酵食品中致癌物EC提供了新方法。
1 酯酶挖掘与序列分析
来自于醋酸钙不动杆菌A. calcoaceticus(GenBank No. BAC55927.1)的酯酶具有EC水解酶活力,且其降解EC为无毒的氨、乙醇及CO2。本研究以该酯酶氨基酸序列为模板,进行BLASTp搜索,对获得的蛋白序列构建系统进化树(图1)。选择与模板序列相似度在80%以上的9 个蛋白ES1~ES9,进行氨基酸比对分析。来自于不动杆菌Acinetobacter sp. NBRC 110496(WP_043970715.1)的ES9与模板酯酶氨基酸序列相似度为81.2%。目前结构得到解析的酯酶中,来源于恶臭假单胞菌Pseudomonas putida IFO12996的酯酶(PDB NO. 1ZOI)与ES9具有最高的氨基酸相似度(70%),通过COACH对ES9蛋白EC结合位点进行预测,结果显示,结合位点大约位于蛋白分子的中间,距底物通道入口12 Å,由7 个氨基酸残基(Trp31、Leu33、Thr98、Val124、Phe166、Phe203、Val229)组成(图2)。序列比对结果显示,9 个酯酶都含有“Ser97-Asp227-His256”催化三联体及α/β水解酶超家族大多数成员具有的保守区序列G-H-S97-T-G(图2)。选取1~9号代表性的酯酶为研究对象,进行下一步的实验分析。
2 重组酯酶的表达、EC降解能力鉴定及纯化
9 株重组大肠杆菌经诱导发酵及超声破碎后,进行酶活力测定和重组蛋白表达分析。酶活力测定结果表明(图3),除ES6及ES7仅有极其微弱活力外,其余7 个酯酶对EC均具有水解作用,且ES1、ES5、ES8和ES9在pH 4.5及pH 7.0条件下有相对较高的酶活力;以尿素为底物进行酶活力测定发现,9 种酯酶均未显示酶活力,结果表明酯酶对尿素无水解作用。SDS-PAGE分析结果显示(图4A、B),与不含酯酶的重组大肠杆菌相比,9 种重组大肠杆菌的细胞裂解液上清和沉淀样品都在30 kDa附近均出现了条带,与重组酯酶分子质量理论值(ES1~ES9:30.95、30.99、30.96、30.96、30.98、30.90、31.01、31.06、30.97 kDa)基本相符,由此说明ES1~ES9全部在 E. coli BL21(DE3)细胞内实现了可溶性表达,但ES4表达量较少(图4A、B)。因此,选定ES1、ES5、ES8和ES9进行进一步的Ni-NTA亲和层析纯化,结果如图4C所示,蛋白胶上显示为单一条带,因此4 种酯酶均得到了良好的纯化。
3 重组酯酶的酶学性质分析
3.1 最适反应温度和温度稳定性
如图5所示,ES1和ES5的活力从20~70 ℃一直在增加,在70 ℃时达到峰值,因此它们的最适温度均为70 ℃,远远高于来源于根瘤农杆菌Agrobacterium tumefaciens d3(55 ℃)的酰胺酶和副地衣芽孢杆菌Bacillus paralicheniformis(50 ℃)的双功能脲酶;在反应温度高于70 ℃后,酶的蛋白结构可能被破坏导致酶活力大幅度降低;ES8与ES9最适温度均为55 ℃,高于来源于米曲霉Aspergillus oryzae的酰胺酶(40 ℃);其中ES8随着温度的升高,酶活性丧失较慢,在70 ℃时酶活力降低至50%左右,而ES9在温度仅升高5 ℃的情况下,酶活力降低至50%左右;重组酶ES1与ES5在50~70 ℃范围内相对酶活力在50%以上,而重组酶ES8在45~70 ℃范围内,ES9在45~60 ℃范围内相对酶活力在50%以上。
4 种酯酶分别在不同温度下孵育1 h后在最适反应温度及pH 4.5条件下检测其残余酶活力,结果显示(图6),4 种酯酶均在温度低于40 ℃时较稳定,经处理后其酶活力均可保持90%以上,当温度高于45 ℃后酶活力下降明显,表明4 种酯酶在温度高于45 ℃后空间结构受到较大程度影响。4 种酯酶在65 ℃保温1 h,酶活力仍残余约50%,表现出比可降解EC的酰胺酶及脲酶更好的热稳定性。
3.2 最适反应pH值和pH值稳定性
如图7所示,在pH 3.0~7.0条件下,随着pH值的升高,酶活力逐渐提升,ES8在pH 7.0条件下的酶活力最高,为中性酶;而ES1、ES5与ES9均为碱性酶,随着pH值上升到8.0的过程中,其活力也一直处于上升状态。当pH 6.0~8.0时,4 种酯酶活力均可以保持80%以上,表明在接近中性的条件下可以较好地释放酶活力;当pH值大于8.0时,由于更换缓冲液(20 mmol/L Tris-HCl缓冲液,pH 8.0~9.0和20 mmol/L Gly-NaOH缓冲液,pH 9.0~10.0),4 种酯酶以EC为底物时的酶活力均无法测定出,推测更换的缓冲液会影响测定酶活力时的显色反应。在pH 4.5条件下ES1、ES5、ES8与ES9相对酶活力分别为79.19%、64.22%、69.96%、50.99%,4 种酯酶均具有超过50%的相对酶活力,相较于酰胺类EC水解酶,本研究挖掘出的酯酶可以在pH 4~5条件下发挥活性。
将酯酶在不同pH值条件下4 ℃保温6 h后测定酶活力,结果如图8所示,当酯酶在pH值为7.0~8.0时,4 种酯酶的残余酶活力均保持在90%以上,当pH值小于7或大于8时,残余酶活力明显下降;ES1、ES5、ES8与ES9经pH 4条件下处理后,可分别保持68.65%、42.68%、43.80%、19.87%的酶活力;相较于酰胺类EC水解酶及来源于解淀粉芽孢杆菌B. amyloliquefaciens JP-21的中性脲酶,ES1表现出更好的酸稳定性。以上结果表明,所获得的4 个重组酯酶在pH 6.0~8.0内具有较好的反应活性以及稳定性,适用于弱酸、中性及弱碱等发酵食品中EC降解方面的应用。
3.3 乙醇与氯化钠耐受性
如图9所示,当乙醇体积分数为10%时,ES1、ES5、ES8与ES9的相对酶活力分别为50.48%、48.44%、42.60%、33.59%,当乙醇体积分数为20%时,其相对酶活力分别为40.98%、36.03%、27.97%、22.72%,表明4 种酯酶均具有一定的乙醇耐受性。与来源于赖氨酸芽孢杆菌Lysinibacillus fusiformis SCO2的突变体(21.03 %)相比,在20%的乙醇环境下ES1相对酶活力(40.98%)约是其2 倍,表现出一定的乙醇耐受性,而ES9在含乙醇的环境下酶活性降低较快,结合之前其温度及pH值稳定性结果,推测ES9对环境耐受性较低,结构较不稳定。
由图10可知,当氯化钠质量分数为5%时,ES1、ES5、ES8与ES9的相对酶活力分别为24.09%、20.41%、16.11%、10.73%,当氯化钠质量分数高于5%时,4 种酯酶对EC基本失去催化活力,表明4 种酯酶耐盐性均较差,不具有应用于高盐发酵食品中EC降解的潜力。
3.4 金属离子和化学试剂对酶活力的影响
如图11所示,所检测的大多数金属离子对酯酶活力均有一定的抑制作用。经Cu 2+ 处理后,ES1、ES5、ES8及ES9的相对酶活力分别为12.11%、2.31%、34.69%、37.07%,说明Cu 2+ 对ES5的抑制效应相比ES1、ES8及ES9较强。经Fe 3+ 处理后,ES1、ES5、ES8及ES9的相对酶活力分别为5.81%、5.15%、1.78%、9.98%。经Co 2+ 处理后,ES1、ES5、ES8及ES9的相对酶活力分别为4.79%、7.57%、3.46%、3.39%,结果表明Cu 2+ 、Fe 3+ 、Co 2+ 均可显著抑制4 种酯酶的活性,而Zn 2+ 对ES1有小幅度的激活作用,可激活26.49%的酶活力,推测Zn 2+ 和酯酶ES1结合后可能会形成更稳定的复合物。
在EDTA存在的情况下,酶活力依然在90%以上,证明4 种酯酶为非金属依赖型酶或金属离子包埋在酯酶深处无法被螯合出。当表面活性剂Triton X-100存在时,ES1、ES5、ES8及ES9分别可保持91.03%、111.92%、67.86%、84.35%的酶活力,表明活性剂Triton X-100对ES5有小幅度激活作用,对ES1及ES9影响不大,对ES8活力有一定的抑制作用。
4 重组酯酶的动力学参数
鉴于大多发酵食品(如黄酒、酱油等)均偏酸性(pH<5.0),因此本研究检测4 种酯酶在酸性(pH 4.5)条件下的动力学参数。以EC为底物,在pH 4.5条件下测定重组酶在10~1 000 mmol/L EC浓度下的初始反应速率,然后由Graph Pad将初始反应速率与对应的底物浓度拟合计算,得到ES1、ES5、ES8和ES9的酶促反应参数。结果表明(表1),ES1、ES5、ES8和ES9的K m 值分别为(210.7±9.3)、(213.8±8.92)、(256.2±11.02)、(127.2±6.53)mmol/L;V max 值分别为(87.54±4.19)、(84.14±4.96)、(79.91±3.64)μmol/(min·mg)和(63.44±2.96)μmol/(min·mg);k cat /K m 值分别为(214.31±23.24)、(203.20±21.47)、(161.46±17.43)L/(mol·s)及(257.43±23.89)L/(mol·s)。酰胺类EC水解酶在pH<5.0条件下无催化活性,它们在最适pH值条件下对EC的K m 为0.87~37.2 mmol/L。来源于B. paralicheniformis的双功能酸性脲酶在pH 4.5条件下对EC的K m 及k cat /K m 值分别为1 018 mmol/L及440 L/(mol·s),因此与该酸性脲酶相比,本研究中重组酯酶具有较高的EC亲和力,但重组酯酶催化效率k cat /K m 值与酸性脲酶相比较低。文献[26]未报道来自于A. calcoaceticus的模板酯酶在酸性(pH 4.5)条件下的动力学参数值。
以上结果表明通过基因挖掘得到的酯酶对酸性条件(pH 4.5)下对EC具有较弱的亲和力及催化效率,但从对尿素的非降解的底物特异性和一定程度的乙醇耐受性来看,酯酶作为一种新的EC水解酶仍具有良好的应用前景。因此后续可对重组酯酶进行定向改造以提高其在酸性条件下对EC的亲和力和催化效率。
5 酯酶以EC为底物时动力学参数存在差异的潜在机制
底物通道形状与大小、活性口袋氨基酸的疏水性与净电荷等效应均对酶的底物特异性、最大反应速率等产生一定的影响。将酯酶氨基酸序列分别提交至trRosetta网站进行蛋白质结构建模得到4 种酯酶的蛋白三维结构(图12A~D),用PyMol对获得的酯酶进行结构分析,发现以ES1为模板进行比对时,ES5、ES8和ES9的RMSD值分别为0.26、0.45 Å和0.49 Å,均小于0.5 Å,表明4 种酯酶在高级结构中表现出高的相似性。底物通道入口分析显示,ES1与ES5的入口处被氨基酸残基分隔成两部分;ES8通道入口处形状不规则;ES9的通道入口较为规整,呈椭圆形,没有氨基酸残基凸起阻碍底物进出,因而可能更有利于底物的结合与释放。然而经过对底物通道最宽距离的测量发现,ES9的底物通道相较于另外3 种酯酶最宽的直径缩短了1.3~5.1 Å;对底物通道最窄距离测量结果显示(ES1及ES5取底物通道占比最大口袋测量结果),ES9的底物通道相较于另外3 种酯酶最窄的直径缩短了2.2~3.4 Å。EC的三维分子结构尺寸分别为8.74、6.07 Å与4.62 Å(图12E),ES9的底物通道入口最宽与最窄距离分别为6.9 Å及5.2 Å(图12D),因此EC只能沿着特定取向进入ES9活性口袋,而对于其他3 个酶来说,EC可能沿着更多不同的取向进入活性口袋,由此可能影响了ES9对EC的最大反应速率。
对形成酯酶活性口袋的氨基酸残基计算净电荷与亲水指数。4 种酯酶活性口袋内的净电荷相同,均为3.204×10 -19 C。酯酶ES1、ES5、ES8和ES9活性口袋氨基酸的亲水指数分别为30.3、30.9、30.4、25.1,亲水指数越大疏水性越强,所以ES9催化环境亲水性强于其他3 种酯酶。在水解酶的催化水解反应中,亲水性氨基酸残基有利于与底物形成更多的氢键相互作用,从而固定底物在催化反应中的空间位置、促进酶对底物的催化作用。使用DS软件对酯酶ES8及ES9分别与底物EC进行分子对接,用PyMOL软件分析酯酶与EC复合物结构。结果显示(图12F、G),酯酶ES8与S97之间形成1 对氢键,而ES9分别与S97及H256均形成1 对氢键,较强的氢键相互作用可能使得ES9更易与EC进行结合,致使ES9对EC的亲和力较高。
6 结 论
酯酶可降解EC生成无毒的氨、乙醇及CO 2 ,其不降解尿素的特性,可有效解决酰胺类EC水解酶及脲酶在降解发酵食品中EC时所存在的高浓度尿素干扰酶对EC降解的问题。本研究从NCBI数据库中挖掘到4 种具有EC降解作用的酯酶(ES1、ES5、ES8和ES9),并实现了它们在重组大肠杆菌BL21(DE3)中的异源表达、纯化及酶学性质研究。4 种酯酶最适pH值为7.0,在pH 4.0~5.0条件下均有活力;其中在pH 4.0条件下ES1的稳定性最强,在此条件下4 ℃放置6 h后可保持68.65%的残余酶活力。4 种酯酶对低体积分数的乙醇具有一定的耐受性,ES1对乙醇耐受性最强,它在乙醇体积分数10%时,可保持50.48%左右的相对酶活力,因此具有应用于低酒精度酒精饮料中EC降解的潜力。4 种酯酶不具有高盐耐受性,当氯化钠质量浓度高于5%时,酯酶基本失去活力。4 种酯酶在pH 4.5条件下对EC的亲和力(K m >100 mmol/L)及催化效率(k cat /K m <300 L/(mol·s))均较低,不利于它们对酸性环境中低含量EC的降解。未来可通过蛋白质工程技术,对酯酶进行定向改造,获得在酸性条件下EC亲和力及催化效率提高的酯酶,以促进其在实际反应体系中的应用。对酯酶进行结构分析推测,ES9相对较小的底物通道可能影响了EC的进入,从而影响了ES9对EC的最大反应速率;而ES9高的EC亲和力可能归因于ES9与EC之间强的氢键作用力。本研究获得了具有一定的乙醇耐受性、酸耐受性且EC降解活性的酯酶,不仅丰富了EC水解酶酶库,也为未来控制低酒精度酒精饮料中EC含量提供了新方法。
通信作者
田淑芳,安徽工程大学生物与食品工程学院 讲师。 主要从事 系统生物学的微生物群落分析及功能菌株的筛选 ,包括 传统发酵食品中有害物质的调控、 功能性产物的生物合成等。 主持国家自然科学基金青年基金 、国家级大学生创新创业训练计划 等 项目。 近 5 年,来以第一作者 身份 在《Food Research International》《Food Control》《Bioresource Technology》等 国际 期刊发表SCI论文6 篇;授权发明专利 3 件 。
第一作者
刘庆涛,安徽工程大学生物与食品工程学院 讲师/硕士生导师。 主要从事工业微生物发酵与酶工程领域研究工作,研究方向为传统发酵食品中有害物的酶法消除、工业酶的挖掘与高端定制化。近年来,主持国家自然科学基金青年项目、安徽省自然科学基金青年项目、安徽省高校自然科学基金重点项目等3 项;在《Applied and Environmental Microbiology》《Journal of Agricultural and Food Chemistry》《ACS Synthetic Biology》等期刊发表 SCI 论文1 0 余篇,授权国家发明专利8 项。
本文《降解氨基甲酸乙酯的酯酶挖掘及酶学性质表征》来源于《食品科学》2025年46卷第2期99-107,作者:刘庆涛,朱司宝,王天文,李闯,钱森和,张温清,程凡,田淑芳。DOI:10.7506/spkx1002-6630-20240603-011。点击下方阅读原文即可查看文章相关信息。
实习编辑:李雄;责任编辑:张睿梅。点击下方 阅读原文 即可查看全文。图片来源于文章原文及摄图网
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