仗是打胜了，但“战神”袁崇焕的烦恼很快就来了。

那时，正是魏忠贤势如中天的时候，获得胜利的袁崇焕却并不讨魏忠贤喜欢，所以战后叙功时就出现了匪夷所思的一幕。

功劳最大的是坐镇京师“运筹帷幄”的魏忠贤，其次是魏公公派到前线的监军太监，前线的满桂和赵率教等人得到了应有的赏赐，朝中文武官员因战而加官晋爵的也有数百人。然而，真正的首席指挥官袁崇焕却只官加一级，理由是战争过程中他不发兵援助锦州，作战不积极，像老头子一样的“暮气”。

袁崇焕无奈，只好申请辞官回家。当年七月，朝廷批准了他的辞呈，派王之臣代为督师兼辽东巡抚，驻宁远。

袁崇焕走后，辽东防线上又起了纷争。不少朝臣提出要放弃锦州，从而把对后金的防线向山海关一侧移动。

蓟辽总督阎鸣泰说锦州偏僻，之前修城就是失策，为了那弹丸之地，险些葬送大明的半壁江山。驻守锦州的尤世禄也说锦州城旧，不可久居，申请移师杏山。守塔山的侯世禄说塔山低洼难守，申请移师。实际上，塔山位于锦州和宁远之间，战略地位非同一般。如果放弃塔山、放弃锦州，宁锦防线则不复存在，后金军再入关可就方便多了。

可见，辽东战场上的将领各有自己的小算盘，没有一位强而有力的主帅，根本就没有办法筑起牢固有效的战略防线。

早在信王府邸，朱由检就对袁崇焕的赫赫战绩有所耳闻，见他被魏忠贤排挤，就更加认定他是大明的忠臣良将。所以，朱由检扳倒魏忠贤后，几乎第一时间起复了袁崇焕。

朱由检相信只要有袁崇焕在，大明对后金就无所畏惧，所以他对袁崇焕的起复一上来就铆足了劲。天启七年十一月，擢袁崇焕为右都御史，视兵部添注左侍郎事。没等袁崇焕到任，崇祯元年四月，又命他以兵部尚书兼右副都御史，督师蓟辽，兼督登莱、天津军务。

明朝的官制是这样的：地方上有主管军事的都指挥使，主管民事的布政使，主管刑事的按察使。后来，朝廷常因兵事而派出镇守军事要害地区的总兵官，总兵的职权在都指挥使之上。渐渐临时的派遣变成固定的常驻，总兵基本上就取代了都指挥使原来的地位。

再后来，一有战事，朝廷就派出都御史或副佥都御史巡抚地方，战事结束后回朝，但慢慢巡抚也成了地方的固定官职。巡抚兼管地方的军政大事，于是原来的都指挥使、布政使、按察使、总兵都变成了巡抚的下属。袁崇焕辞官前做的就是辽东巡抚。

景泰年间开始，兵事常涉及几个镇或省，于是在巡抚之上又添设了总督一职，总督通常由都察院都御史或六部尚书出任。总督再往上就是督师，一般都是内阁大学士才有资格当督师，比如之前的孙承宗就是以兵部尚书兼东阁大学士衔督师辽东。

所以，袁崇焕还没回朝就让他督师辽东，不但连升数级，还算是破例，足见朱由检启用袁崇焕之心是多么迫切。

崇祯元年七月，袁崇焕赶到了京城。十四日，他被宣入宫内，朱由检带着一众臣子在平台召见了他。

朱由检对袁崇焕先是热情地慰问了一番，随后向他问起平辽方略。袁崇焕在辽东正准备大干一场的时候被排挤回乡，如今皇帝重新起用并亲自召见，让他不由得热血沸腾地回答： “收复辽东的策略已另有奏疏详加陈述，臣受陛下眷顾，望能假以便宜行事之权，计五年，全辽可复。”

朱由检听了很激动，高兴地说： “如若收复辽东，朕不吝封侯之赏。卿努力解天下倒悬，卿的子孙也会受到恩赐和封赏。”

袁崇焕听闻，连忙叩首谢恩。

此时，首辅韩爌，阁臣李标、刘鸿训、钱龙锡等人也感到欢欣鼓舞，一致称赞袁崇焕识见方略，忠勇可嘉。袁崇焕见皇帝热情、内阁大臣亲切，一时感到很畅快。

当年，袁崇焕的老师孙承宗与天启皇帝师生情深，孙承宗自请督师辽东，天启皇帝当即拨付粮饷八十万。那时候，孙承宗都没有把话说得那么满，而袁崇焕听到几句漂亮话就敢口出豪言，道行真是比他的老师差远了。

召对休息的间歇，给事中许誉卿详细地询问了关于五年复辽的具体策略，而袁崇焕却说： “圣心焦劳，聊以是相慰耳。”许誉卿吓得赶紧小声提醒他说： “皇上英明，怎么可以随便应对。他日如果不能按期收复辽东，怪罪下来，你该怎么办？”

袁崇焕怃然自失，为了挽回些局面，稍后继续召对的时候便上奏说： “五年复辽的计划不容易完成，陛下既然委托给臣，臣怎敢辞难？不过五年内，户部转运军饷，工部供应器械，吏部用人，兵部调兵选将，必须朝廷内外事事配合，才可望成功。”

朱由检当即责成四部的尚书务必按照袁崇焕的意见，从速办理。

袁崇焕又想到从万历年间开始党争不断，言官也动辄无事纷扰，边臣处处掣肘，于是对皇帝说： “以臣之力，制全辽有余，调众口不足。一出国门，便成万里，难免会有忌能妒功的人。虽然不能以权力掣臣之肘，却也能以不同的意见来扰乱臣的谋划。”

朱由检特意站起来倾听，他知道袁崇焕所谓的扰乱谋划实际是指有人会在后方迷惑君王视听，所以毫不犹豫地告诉袁崇焕： “卿不必担心疑虑，朕自有主持。”

大学士刘鸿训等还请皇帝收回之前赐给王之臣、满桂的尚方宝剑，改赐袁崇焕，令其便宜行事。朱由检立刻允准，再次激励了袁崇焕一番。召见之后，还特意在宫中为袁崇焕赐宴。朱由检节俭成性，这可是没几人能获得的恩宠。

出宫后，袁崇焕想起以前熊廷弼、孙承宗都是被人排挤，最后在辽东战场未能施展抱负，就觉得还是有些不放心。离京赴任之前，他再次上疏： “恢复辽东的办法，不外乎臣往年提出的以辽人守辽土，以辽土养辽人，守为正着，战为奇着，和为旁着的策略。法在渐不在骤，在实不在虚，此臣与诸边臣所能为。至于用人的人，与被人选用的人，都是由陛下掌握其中的关键。用人如何能够始终信而不疑？驾驭边臣与廷臣不同，军中可惊疑的事情特别多，只应着眼于成败的大局，不必计较一言一行之微瑕。事情的责任重大，招来怨恨也多，诸有利于封疆者，皆不利于此身。况且图敌之急，敌人亦会从中离间，所以边臣很难做。陛下爱臣知臣，臣何必过于疑惧，但中有所危，不敢不禀明陛下。”

对袁崇焕的再三疑虑，朱由检并未多想，只是好言相慰，告诉他不必担心“浮言”，是战是守皆会按照袁崇焕的部署行事。

君臣间一番别开生面的剿匪总动员到此结束。

朱由检营求中兴之治急切，希望早日平定辽东外患，为迎合他的殷切期盼，袁崇焕许下了五年复辽这样不切实际的宏愿。于是，昔日磊落飒爽的“战神”转眼变成了战战兢兢、絮絮叨叨的边臣。

可惜的是，袁崇焕如履薄冰的心态并没有引起朱由检的重视，他仍一厢情愿地以为，皇权之下，所有袁崇焕提出的问题都将迎刃而解，复辽指日可待。

袁崇焕到任之后，立刻就遇到了一个棘手的问题，那就是兵饷拖欠严重。

其实，早在袁崇焕出山海关之前，驻守宁远的士兵就因兵饷拖欠发生了哗变。当时的辽东巡抚毕自肃向户部请饷，户部拒发，士兵便聚集到巡抚衙门，绑了毕自肃。兵备道郭广新赶到，东拼西凑地筹了几万两白银，补上了一部分欠饷，事态才稍稍平息。巡抚毕自肃因无银发饷，羞愤之下竟在衙门自缢了。

袁崇焕赶到宁远兵营，向郭广新了解情况后，召见了带头闹事的杨正朝和张思顺，他们为了免罪，交代出了其他十几名带头哗变的首领。随即，这十几名哗变首领被枭首示众。袁崇焕还处决了负有直接领导责任的中军部将吴国琦，罢免了其他几位相关将领，这里就有后来与农民军作战十分骁勇的左良玉。

处置了带头兵变的首领，追究了相关将领的领导责任，宁远兵变终于彻底平息。然而，不久锦州又因为欠饷发生了兵变。袁崇焕知道欠饷的问题不解决，各地兵变是压不住的。

经过一段时间的清理计算，袁崇焕汇总了山海关内外积欠军饷的数额，竟有将近八十万两白银之多。袁崇焕赶紧上疏请饷，结果户部仍是拒发，理由很简单，没钱！

当时的户部尚书是毕自严，是已故辽东巡抚毕自肃的亲哥哥。如果户部有钱，毕自严又怎么会让自己的亲弟弟被逼惨死？

朝中户部没有办法，而兵部和一众言官更没有办法。可他们不能解决问题也就罢了，竟还有闲心指指点点。兵部认为欠饷是因为兵士太多而导致军费太巨，朝廷才应付不暇；而言官认为兵饷多是因为兵籍空置而冒领者太多。

兵部与言官的争论于事无补，而户部又没有钱，袁崇焕只好请求皇帝从内帑拨付银两。

天性节俭吝惜的朱由检根本舍不得出钱，只是一味责问户部。户部确实为难，只好说陆续筹款拨付。就是这时，阁臣刘鸿训建议朱由检从内帑出钱而失了圣宠，而礼部左侍郎周延儒说不能一有兵变就给钱而得了圣心。

当日平台召对，朱由检满口答应的全力支持一到真章就立时打了折扣。最后几经商议，朱由检也只忍痛拿出了三十万两白银，还不及袁崇焕提请数额的一半。

朱由检给袁崇焕的支持虽然打了折扣，但对收复辽东的期许却没有减少半分，无怪袁崇焕临出京前万分恐惧。这些事情，到最后成了袁崇焕的夺命利剑。

除了军饷难上加难，袁崇焕还发现辽东早就不是他离开时的样子，那里的形势已经发生了巨大变化。

明朝末年，蒙古大体分为漠西瓦剌、漠北喀尔喀与漠南三大部分。与明朝邻近的是漠南蒙古，察哈尔汗名义上是漠南蒙古的盟主，但仗着兵强马壮横行漠南，各部苦不堪言。

努尔哈赤时代，后金对蒙古各部也是侵扰不断，使各部对后金普遍比较敌视。天启年间，孙承宗督师辽东后，加强对漠南蒙古各部的抚赏，协助调解各部之间的矛盾，所以各部先后与明朝结盟，共同抵御后金。

等到皇太极继承后金汗位后，对漠南蒙古各部改变了以往主战的策略，用联姻、盟誓、封赏等各种手段拉拢漠南蒙古各部。天启七年，袁崇焕离开辽东后，无人主张对漠南蒙古抚赏结盟的战略，朱由检又觉得抚赏太费银粮，便在崇祯元年停止了漠南蒙古各部的赏赐和互市。此消彼长间，漠南蒙古各部纷纷倒向后金。

袁崇焕重新回到辽东，发现后金与蒙古亲善的严峻形势，极力主张修补大明与蒙古的联盟。崇祯二年，明朝恢复了对察哈尔部的抚赏，后来塞外发生饥荒，明朝还卖粮助各部度过灾年。但是，不论怎样，塞外的形势也恢复不到从前，再要与蒙古各部联合抗击后金是怎么也不可能了。

辽东周边形势严峻，后金势力日渐崛起，而明军将士又缺粮少饷，这时候能守住辽东就已不易，再想收复辽东就是逆大势而行，难于登天。但是，袁崇焕一时热血之下已经夸下海口，偏赶上皇帝既不切实际又锱铢计较，如今也只好勉力而为。若想要有朝一日能够主动出击，收复失土，只好尽最大的可能来统一事权，减少掣肘。于是，袁崇焕开始了辽东地区一系列的人事调整。

原来的辽东巡抚毕自肃自杀了，袁崇焕上疏申请不必再派人接任，直接免除这个职位，朱由检同意了。后来，登州、莱州两地的巡抚孙国桢被免职，袁崇焕也建议直接取消登莱巡抚的设置，朱由检也同意了。

人事方面的调整基本没有额外的花费，尤其像这种直接裁人省钱的办法，朱由检基本没有异议。

军事将领方面，辽东地区最初只有一个总兵，后来后金崛起，阉党崔呈秀任兵部尚书时借机安插亲信，在山海关外设置了好几位总兵。为了避免事多掣肘的情况，袁崇焕建议在山海关内外各设总兵一名，调蓟镇总兵赵率教任关内总兵，加官一级，封平辽将军，镇守山海关；同时将宁远、锦州两地合为一镇，统一归原驻守锦州总兵祖大寿管辖，给祖大寿加都督同知衔，封征辽前锋将军，仍旧驻守锦州；中军副将何可纲加都督佥事衔，驻守宁远。

赵率教，河北蓟阳人，努尔哈赤起兵攻打辽东地区时，朝廷发布诏书让被罢官而养有家丁的将领带兵到前线立功，赵率教率众随叔祖赵梦麟出征，受当时的辽东经略袁应泰赏识，被提拔为副总兵，掌管中军事务。

天启元年，辽阳陷落，袁应泰自杀，赵率教潜逃，投到辽东巡抚王化贞门下。这次逃跑的经历成了赵率教的人生污点，一段时间内，无论他到哪里都会被军中的将士耻笑。知耻而后勇，这句话在赵率教身上得到了完美体现，他后来的英勇表现无可指摘，足以冲淡之前的污点。

天启二年，广宁陷落，王化贞准备放弃所有关外的据点，这时，已经做过一次逃将的赵率教不想再跑，他向辽东经略王在晋申请收复前屯卫所。王在晋不支持，赵率教就只带着三十八名家丁前往收复失地。

当时，前屯卫所被蒙古人占据，赵率教便率人停留在离那里不远的中前所。后来，孙承宗派人到前屯安置难民，赶跑了蒙古人，赵率教才进入前屯卫所。

在那里，赵率教招募的流亡百姓有五六万之多，他从中选择出精壮编入军队，进行军事训练；此外，他还亲自督促余下的难民一边大力发展屯田，一边修缮城墙，侦察敌情。

赵率教为改过而做的工作获得了孙承宗的由衷认可，孙承宗建议朝廷免除了他的罪过。从那之后，赵率教便忠诚地跟随孙承宗守卫辽东，孙承宗走后，赵率教就自然而然地把这份忠诚献给了孙承宗的接班人袁崇焕。

袁崇焕对赵率教也一直用心维护。当年，宁远被围，满桂守东城，支撑不住的时候，向守前屯的赵率教求援。赵率教在努尔哈赤的进攻下也非常吃紧，所以只派出一名都司、四名守备前去增援。满桂嫌他们来得晚，拒绝让他们入城，经袁崇焕从旁解劝，才放他们进来。宁远之围解除后，在袁崇焕的主持下，赵率教分得了一份战功，满桂觉得不公，遂对赵率教和袁崇焕都产生了不满。

为此，袁崇焕督师辽东后，把曾与他并肩战斗，取得宁远大捷、宁锦大捷的满桂调离了辽东战场。不用多久，袁崇焕将为这个安排付出惨痛的代价。

赵率教、祖大寿、何可纲三人都是袁崇焕的心腹爱将，取消了巡抚，再由他们三人掌控辽东地区的兵权，等于把全国约一半的兵力交给了袁崇焕，再无人能够制衡。为打消皇帝的疑虑，袁崇焕上疏说：“臣曾承诺五年复辽，专借此三人。他们当与臣相始终，届期不能复辽，臣将亲自处斩三人，然后再自行到法司受死。”

对辽东的将领安排，朱由检本来有很多疑虑，见袁崇焕又提五年复辽，便忍下心中的不快，同意了。

一番安排调整后，放眼整个辽东地区，再无人能跟袁崇焕抗衡。袁崇焕期望的统一事权似乎已经实现。可没过多久，他发现有一个角落，还有一个人，带领着一支队伍，并不服他的调配。

袁崇焕决定亲自去解决掉这最后一个不和谐的因素，不过事实证明，他那么做与自掘坟墓并无不同。